Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.304075 6430512A10RikRIKEN cDNA 6430512A10 gene 5    381626 
 Mm.304075 3200001K10RikRIKEN cDNA 3200001K10 gene 5    72420 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 73 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTTCTTTCCCT (9)4.90.0049
P8 Cb GCTGACTGGCAG (6)3.30.0033
P8 Cb GCACACTGTGTG (5)1.60.0016
P8 Cb GCCACACCACAG (5)1.60.0016
P8 Cb GCCATCTCACTC (4)1.60.0016
P8 Cb GCGCTTTGTGTA (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaGCTTTGTGTA (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaTGACTGGCAG (6)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGACTGGCAG (6)6.80.0068
P8 GC+1d cultureGCTTTGTGTA (4)3.40.0034
P8 GC+1d cultureGGAGGGAGGA (7)3.40.0034
P8 GC+1d cultureACACTGTGTG (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCATTTAAAAT (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCACACCACAG (5)1.10.0011
P8 GC+1d cultureCTGGGCAGAC (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureGCTTTGTGTA (4)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureTGACTGGCAG (6)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureCTGGGCAGAC (3)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureCATTTAAAAT (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGGAGGGAGGA (7)1.20.0012
3T3 fibroblastsCACACCACAG (5)70.007
3T3 fibroblastsGCTTTGTGTA (4)3.50.0035
E15 cortexACACTGTGTG (5)4.90.0049
E15 cortexGCTTTGTGTA (4)4.90.0049
P1 cortexGCTTTGTGTA (4)4.50.0045
HypothalamusGGAGGGAGGA (7)3.60.0036
HypothalamusACACTGTGTG (5)1.80.0018
HypothalamusCTCTTCCTGT (3)1.80.0018
HypothalamusTGACTGGCAG (6)1.80.0018
E12.5 retinaAGTGTTACCT (3)1.90.0019
E12.5 retinaCATCTCACTC (4)1.90.0019
E12.5 retinaCATTTAAAAT (4)1.90.0019
E14.5 retinaATACACAAAG (3)1.80.0018
E14.5 retinaCTCTTCCTGT (3)1.80.0018
E14.5 retinaGCTTTGTGTA (4)1.80.0018
E14.5 retinaGGAGGGAGGA (7)1.80.0018
E14.5 retinaTGACTGGCAG (6)1.80.0018
E18.5 retinaACACTGTGTG (5)1.80.0018
E18.5 retinaATACACAAAG (3)1.80.0018
E18.5 retinaCACACCACAG (5)1.80.0018
E18.5 retinaTGACTGGCAG (6)1.80.0018
P0.5 retinaCTCTTCCTGT (3)3.90.0039
P0.5 retinaAGTGTTACCT (3)20.002
P0.5 retinaCACACCACAG (5)20.002
P0.5 retinaGCTTTGTGTA (4)20.002
P0.5 retinaGGAGGGAGGA (7)20.002
P0.5 retinaTGACTGGCAG (6)20.002
P2.5 retinaTGACTGGCAG (6)5.30.0053
P2.5 retinaGCTTTGTGTA (4)3.50.0035
P2.5 retinaATACACAAAG (3)1.80.0018
P2.5 retinaCACACCACAG (5)1.80.0018
P2.5 retinaCATCTCACTC (4)1.80.0018
P2.5 retinaCTCTTCCTGT (3)1.80.0018
P2.5 retinaGGAGGGAGGA (7)1.80.0018
P4.5 retinaTGACTGGCAG (6)5.90.0059
P4.5 retinaCTCTTCCTGT (3)20.002
P4.5 retinaGCTTTGTGTA (4)20.002
P6.5 retinaCTCTTCCTGT (3)3.30.0033
P6.5 retinaGCTTTGTGTA (4)3.30.0033
P6.5 retinaCATCTCACTC (4)1.70.0017
P6.5 retinaGGAGGGAGGA (7)1.70.0017
P6.5 retinaTGACTGGCAG (6)1.70.0017
P10.5 crx- retinaAGTGTTACCT (3)5.60.0056
P10.5 crx- retinaCATTTAAAAT (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaCTCTTCCTGT (3)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGCTTTGTGTA (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCATCTCACTC (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGCTTTGTGTA (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGACTGGCAG (6)1.90.0019
Adult retinalTGACTGGCAG (6)5.60.0056
Adult retinalCTCTTCCTGT (3)1.90.0019
Adult retinalGGAGGGAGGA (7)1.90.0019
ONLGCTTTGTGTA (4)3.80.0038