Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.172720 AA959742expressed sequence AA959742 11  11 D  98238 
 Mm.172720 AI596487expressed sequence AI596487 11    103797 
 Mm.172720 C78668expressed sequence C78668 11    97711 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 5 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 131 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAGGGATCA (3)
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
TAGGCCACAC (3)
TCTGAGTGGA (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTAGCAGGA
TGTGAGTGGT (4)
120.60.1206
Cb medulloblastomaACCAAGGCCT
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTGAGTGGT (4)
138.60.1386
P8 GC+1d cultureATGTCACCAT (3)
CAATAAACTG
GATTTAATAA (3)
GCTGCTGGTG (3)
TCTGAGTGGA (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTGAGTGGT (4)
136.90.1369
P8 GC+SHH+1d cultureACCAAGGCCT
ATGTCACCAT (3)
CAATAAACTG
CCTAAAGGAG (3)
GATTTAATAA (3)
GCTGCTGGTG (3)
TAGGCCACAC (3)
TCTGAGTGGA (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTGAGTGGT (4)
165.10.1651
3T3 fibroblastsACCAAGGCCT
CAATAAACTG
CCTAAAGGAG (3)
GCTGCTGGTG (3)
GTGGCGCTGC (4)
TCTGAGTGGT (3)
TGTGAGTGGT (4)
490.049
E15 cortexGCTGCTGGTG (3)
TAGGCCACAC (3)
19.70.0197
P1 cortexAAGGGATCAG (3)
CAATAAACTG
CCTAAAGGAG (3)
GCTGCTGGTG (3)
TGTGAGTGGT (4)
40.70.0407
HypothalamusAAAACAGGAG (3)
AAGGGATCAG (3)
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
GTGGCGCTGC (4)
TCTGAGTGGT (3)
TGTGAGTGGT (4)
110.40.1104
E12.5 retinaAAAACAGGAG (3)
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTGAGTGGT (4)
108.90.1089
E14.5 retinaAAAGGGATCA (3)
ATGTCACCAT (3)
CAATAAACTG
GATTTAATAA (3)
GCTGCTGGTG (3)
TCTGAGTGGA (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTGAGTGGT (4)
163.90.1639
E16.5 retinaAAGGGATCAG (3)
CAATAAACTG
CCTAAAGGAG (3)
GCTGCTGGTG (3)
TCTGAGTGGA (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTGAGTGGT (4)
110.40.1104
E18.5 retinaAAAGGGATCA (3)
ATGTCACCAT (3)
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
TAGGCCACAC (3)
TCTGAGTGGA (3)
TCTGAGTGGT (3)
227.50.2275
P0.5 retinaAAAGGGATCA (3)
ACCAAGGCCT
ATGTCACCAT (3)
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
TCTGAGTGGA (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTGAGTGGT (4)
96.20.0962
P2.5 retinaAAAGGGATCA (3)
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
TCTGAGTGGA (3)
TCTGAGTGGT (3)
130.30.1303
P4.5 retinaAAAGGGATCA (3)
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
TCTGAGTGGA (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTAGCAGGA
162.40.1624
P6.5 retinaAAAGGGATCA (3)
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
GTGGCGCTGC (4)
TCTGAGTGGA (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTGAGTGGT (4)
126.70.1267
P10.5 crx- retinaAAAGGGATCA (3)
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTGAGTGGT (4)
53.80.0538
P10.5 crx+ retinaAAAGGGATCA (3)
ACCAAGGCCT
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
TCTGAGTGGA (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTGAGTGGT (4)
103.70.1037
Adult retinalAAAACAGGAG (3)
AAAGGGATCA (3)
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTAGCAGGA
TGTGAGTGGT (4)
70.50.0705
ONLAAAACAGGAG (3)
AAAGGGATCA (3)
CAATAAACTG
GCTGCTGGTG (3)
TCTGAGTGGA (3)
TCTGAGTGGT (3)
TGTAGCAGGA
TGTGAGTGGT (4)
650.065