Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.246412	1700020I14Rik	RIKEN cDNA 1700020I14 gene	2		66602
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 17 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 222 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT CAAAACAGAA (3) CTTGGGAATA CTTTATTGCT GACTTGGGTC (2) GTTTTGTTTT (2) TAAGCTGGCA TGGTTGTTGG (2) TTTATTTTTT (2) 254.4 0.2544 Cb medulloblastoma AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT GGTGGATCCC GTGGGTACAT GTTTAGGATG TAAGCTGGCA TATCCCAGGC TGAGACTGGG 915.5 0.9155 P8 GC+1d culture AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAA AGCAGAGAAT AGGTAAAGGA (2) CTTGGGAATA GTTTAGGATG TATCCCAGGC TATTACATTA (2) TGAGACTGGG TGGCCACTTA TGGTTGTTGG (2) TTTATTTTTT (2) 253.1 0.2531 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AATATTTATT (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAA AGCAGAGAAT AGGTAAAGGA (2) AGTGTTTTCT (2) CTTGGGAATA GACTTGGGTC (2) GTGGGTACAT GTTTTGTTTT (2) TATCCCAGGC TGAGACTGGG TGGTTGTTGG (2) TTTATTTTTT (2) 355.1 0.3551 3T3 fibroblasts AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) GACTTGGGTC (2) GTGGGTACAT 45.5 0.0455 E15 cortex AAAAAAAAAA (2) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT AGGTAAAGGA (2) GTAGCTGGCT TGGTTGTTGG (2) 267 0.267 P1 cortex AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT AGGTAAAGGA (2) TATTACATTA (2) TGGTTGTTGG (2) 313.5 0.3135 Hypothalamus AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT CTTTATTGCT GTGGGTACAT GTGGTACATA (2) TGGCCACTTA TGGTTGTTGG (2) 182.8 0.1828 E12.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT AGTGTTTTCT (2) CAAAACAGAA (3) CTTGGGAATA GTTTTGTTTT (2) TATCCCAGGC TGGTTGTTGG (2) 204.7 0.2047 E14.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AATATTTATT (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAA AGCAGAGAAT AGTGTTTTCT (2) CTTTATTGCT GTAGCTGGCT TATTACATTA (2) TGAGACTGGG TGGTTGTTGG (2) TTTATTTTTT (2) 220.3 0.2203 E16.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT AGGTAAAGGA (2) AGTGTTTTCT (2) GTGGGTACAT GTGGTACATA (2) GTTCACCTTT TAAAAGCCTG (2) TATTACATTA (2) TGGTTGTTGG (2) 119.5 0.1195 E18.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAA AGCAGAGAAT AGTGTTTTCT (2) CAAAACAGAA (3) GTTCACCTTT TATTACATTA (2) TGGTTGTTGG (2) TTTATTTTTT (2) 463.8 0.4638 P0.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT AGGTAAAGGA (2) AGTGTTTTCT (2) CTTGGGAATA TAAAAGCCTG (2) TATCCCAGGC TGGCCACTTA 151.4 0.1514 P2.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAA AGCAGAGAAT AGTGTTTTCT (2) CAAAACAGAA (3) CTTTATTGCT GTGGTACATA (2) GTTCACCTTT TATTACATTA (2) TGGTTGTTGG (2) TTTATTTTTT (2) 431.3 0.4313 P4.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAA AGCAGAGAAT AGGTAAAGGA (2) AGTGTTTTCT (2) TAAAAGCCTG (2) TAAGCTGGCA TGGTTGTTGG (2) 362.6 0.3626 P6.5 retina AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT GTTTTGTTTT (2) TGGTTGTTGG (2) TTTATTTTTT (2) 343.6 0.3436 P10.5 crx- retina AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT CTTTATTGCT TATTACATTA (2) TGGTTGTTGG (2) TTTATTTTTT (2) 111.6 0.1116 P10.5 crx+ retina AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT CTTGGGAATA TATTACATTA (2) TGGTTGTTGG (2) 188.2 0.1882 Adult retinal AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT CTTGGGAATA CTTTATTGCT GACTTGGGTC (2) GTTTTGTTTT (2) TGAGACTGGG TGGTTGTTGG (2) 139.2 0.1392 ONL AAAAAAAAAA (2) AAGACAGCTA (3) AAGGCTCACA (2) AATATTTATT (2) AGACCCTGTC (2) AGCAGAGAAT CTTGGGAATA CTTTATTGCT GACTTGGGTC (2) GTTTTGTTTT (2) TAAAAGCCTG (2) TATTACATTA (2) TGGTTGTTGG (2) TTTATTTTTT (2) 214.2 0.2142