Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.246869 8430423A01RikRIKEN cDNA 8430423A01 gene 1  1 E4  98415 
 Mm.246869 2700010L10RikRIKEN cDNA 2700010L10 gene 1    108914 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 3 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 143 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATAATGACAT (2)
GAAGGTTTGC (2)
GCTGCAAAGC (2)
GGCTGGAAAG
GGGGGGAGGG (5)
GTACTAAGGA (3)
GTGTCTCAAA (2)
TTAACTTCAA
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
22.80.0228
Cb medulloblastomaATAATGACAT (2)
ATAGTGACAT (2)
ATTTCTGAAT
GTGTCTCAAA (2)
GTGTGCGGAC (2)
TTATTTTTAG (2)
TTCGCTGTCG (2)
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
32.20.0322
P8 GC+1d cultureATAATGACAT (2)
ATAGTGACAT (2)
ATTTCTGAAT
CTCTGGGGGC (2)
TTAACTTCAA
TTATTTTTAG (2)
TTCTCTTCTC
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
23.80.0238
P8 GC+SHH+1d cultureAATTCTGGAT (2)
ATAATGACAT (2)
GGGGAGGGTA (2)
GTACTAAGGA (3)
GTGTCTCAAA (2)
TTAACTTCAA
TTATTTTTAG (2)
TTCTCTTCTC
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
24.40.0244
3T3 fibroblastsCTCTGGGGGC (2)
GGCTTTCAGT (3)
TCTCGGCCTG (2)
TTCGCTGTCG (2)
TTGGTATTGT (2)
420.042
E15 cortexTTTGTCTCAG (3)
4.90.0049
P1 cortexGTGTCTCAAA (2)
TCTCGGCCTG (2)
TTATTTTTAG (2)
TTCTCTTCTC
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
36.20.0362
HypothalamusATAGTGACAT (2)
GAAGGTTTGC (2)
GGGGAGGGTA (2)
GGGGGGGGGA (2)
90.009
E12.5 retinaAATTCTGGAT (2)
ATTTCTGAAT
GCTGCAAAGC (2)
GGCTTTCAGT (3)
GGGGGGGGGA (2)
GTACTAAGGA (3)
GTGTGCGGAC (2)
TTATTTTTAG (2)
TTCGCTGTCG (2)
TTCTCTTCTC
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
30.30.0303
E14.5 retinaGTGTCTCAAA (2)
1.80.0018
E16.5 retinaAATAAAATAT
ATTTCTGAAT
TTGGTATTGT (2)
12.60.0126
E18.5 retinaATTTCTGAAT
GGGGGGAGGG (5)
GGGGGGGGGA (2)
GTGTCTCAAA (2)
TCACTTAAAA
TTTGTCTCAG (3)
TTTTCAATGG (2)
23.50.0235
P0.5 retinaATAGTGACAT (2)
GTGTCTCAAA (2)
GTGTGCGGAC (2)
TTATTTTTAG (2)
TTCGCTGTCG (2)
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
TTTTCAATGG (2)
19.80.0198
P2.5 retinaATTTCTGAAT
GCTGCAAAGC (2)
GGCTTTCAGT (3)
GGGGAGGGTA (2)
GGGGGGAGGG (5)
GTACTAAGGA (3)
GTGTCTCAAA (2)
TTCTCTTCTC
TTTGTCTCAG (3)
TTTTCAATGG (2)
38.90.0389
P4.5 retinaATAATGACAT (2)
ATTTCTGAAT
GGGGGGAGGG (5)
GGGGGGGGGA (2)
GTACTAAGGA (3)
GTGTCTCAAA (2)
GTGTGCGGAC (2)
TTCTCTTCTC
TTTGTCTCAG (3)
TTTTCAATGG (2)
280.028
P6.5 retinaATTTCTGAAT
GTACTAAGGA (3)
GTGTCTCAAA (2)
TTATTTTTAG (2)
TTCTCTTCTC
20.10.0201
P10.5 crx- retinaATTTCTGAAT
GCTGCAAAGC (2)
GGCTTTCAGT (3)
GGGGGGGGGA (2)
TTCTCTTCTC
TTCTGAGCAG (2)
TTTGTCTCAG (3)
TTTTCAATGG (2)
22.50.0225
P10.5 crx+ retinaATTTCTGAAT
GGCTTTCAGT (3)
GGGGGGAGGG (5)
GTACTAAGGA (3)
TTAACTTCAA
TTCTCTTCTC
TTGGTATTGT (2)
TTTGTCTCAG (3)
32.60.0326
Adult retinalATAATGACAT (2)
ATAGTGACAT (2)
ATTTCTGAAT
GTACTAAGGA (3)
TCTCGGCCTG (2)
TTATTTTTAG (2)
TTCTCTTCTC
TTGGTATTGT (2)
33.60.0336
ONLAATAAAATAT
ATTTCTGAAT
GGCTGGAAAG
GGGGAGGGTA (2)
GGGGGGAGGG (5)
GTACTAAGGA (3)
TCACTTAAAA
TTCTCTTCTC
TTTGTCTCAG (3)
28.60.0286