Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.289702 Syt1synaptotagmin 1 10  10 D1 (10 58.0 cM)  20979 
 Mm.289702 5330428N10RikRIKEN cDNA 5330428N10 gene 10    78277 
 Mm.289702 6430709C05RikRIKEN cDNA 6430709C05 gene 10    76240 
 Mm.289702 A130086K04RikRIKEN cDNA A130086K04 gene 10    319988 
 Mm.289702 2900074G08RikRIKEN cDNA 2900074G08 gene 10    72989 
 Mm.289702 C030018G05RikRIKEN cDNA C030018G05 gene 10    77388 
 Mm.289702 C030044C18RikRIKEN cDNA C030044C18 gene 10    77637 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 3 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 76 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTGACCTCAA (2)
GGGTTGGCCG (9)
3.20.0032
Cb medulloblastomaAGCCGGTGAC (7)
CTGACCTCAA (2)
GACACTCAAT (7)
GGGTTGGCCG (9)
GGTTCACTCT (2)
106.30.1063
P8 GC+1d cultureGACACTCAAT (7)
GCTGCTGCTG (2)
GGAGATGATA (8)
12.50.0125
P8 GC+SHH+1d cultureAAGTCAGATG
GACACTCAAT (7)
GGGTTCACTA (9)
GGGTTGGCCG (9)
GTAGTTTTCT (2)
16.50.0165
3T3 fibroblastsCATCCTGATA
TTGGCCAGGA (7)
70.007
E15 cortexGACACTCAAT (7)
GGGTTGGCCG (9)
14.80.0148
P1 cortexGACACTCAAT (7)
22.70.0227
HypothalamusAAAACCTGAA
AAGTCAGATG
GACACTCAAT (7)
GGAGATGATA (8)
GGGTTCACTA (9)
GTAGTTTTCT (2)
TAATATGTTA
103.10.1031
E12.5 retinaGACACTCAAT (7)
3.80.0038
E14.5 retinaAAAACCTGAA
CATCCTGATA
CTGACCTCAA (2)
GACACTCAAT (7)
GGTTCACTCT (2)
23.60.0236
E16.5 retinaAGCCGGTGAC (7)
CTGACCTCAA (2)
GACACTCAAT (7)
GGGTTCACTA (9)
GGGTTGGCCG (9)
TAATATGTTA
23.50.0235
E18.5 retinaAAAAGATGAA (7)
CTGACCTCAA (2)
GACACTCAAT (7)
GGGTTCACTA (9)
32.70.0327
P0.5 retinaAAAACCTGAA
AAGTCAGATG
GACACTCAAT (7)
GCTGCTGCTG (2)
11.90.0119
P2.5 retinaGACACTCAAT (7)
40.50.0405
P4.5 retinaAAAAGATGAA (7)
AAGTCAGATG
CTGACCTCAA (2)
GACACTCAAT (7)
GGAGATGATA (8)
69.40.0694
P6.5 retinaCATCCTGATA
GACACTCAAT (7)
GCTGCTGCTG (2)
GGGTTCACTA (9)
GGGTTGGCCG (9)
GGTTCACTCT (2)
83.50.0835
P10.5 crx- retinaGACACTCAAT (7)
GGGTTCACTA (9)
GGGTTGGCCG (9)
TTCTGAGCAG (2)
39.10.0391
P10.5 crx+ retinaAAGTCAGATG
GACACTCAAT (7)
GGGTTCACTA (9)
TTGGCCAGGA (7)
128.70.1287
Adult retinalAGCCGGTGAC (7)
CTGACCTCAA (2)
GACACTCAAT (7)
GGAGATGATA (8)
GGGTTCACTA (9)
GGGTTGGCCG (9)
70.50.0705
ONLAAAAGATGAA (7)
GACACTCAAT (7)
GTAGTTTTCT (2)
88.10.0881