Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.33437	Gtl7	gene trap locus 7	2		76246
Gene Ontology	nucleolus
Human Homolog	KIAA0252[KIAA0252]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 4 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 77 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATGGCTATGG (2) CTGTCTGTAG GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT GGTCTATAGC TGCAGTGGTG TTGTGACTTT 22.8 0.0228 Cb medulloblastoma GCTGTGTAAT GGTCTATAGC 6.9 0.0069 P8 GC+1d culture CTGTCTGTAG GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT GGTCTATAGC TGCAGTGGTG TTGTGACTTT 28.5 0.0285 P8 GC+SHH+1d culture GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT TGCAGTGGTG TTGTGACTTT 18.8 0.0188 3T3 fibroblasts ATGGCTATGG (2) GTAAAGAAGC 7 0.007 E15 cortex GCTATGGAGA (2) 4.9 0.0049 P1 cortex ATGGCTATGG (2) CTGTCTGTAG GTAAAGAAGC 13.5 0.0135 Hypothalamus GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT GGTCTATAGC 7.2 0.0072 E12.5 retina ATGGCTATGG (2) CTGTCTGTAG GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT GGTCTATAGC 18.8 0.0188 E14.5 retina ATGGCTATGG (2) CTGTCTGTAG GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT GGTCTATAGC 34.5 0.0345 E16.5 retina CTGTCTGTAG GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT 16.2 0.0162 E18.5 retina ATGGCTATGG (2) CTGTCTGTAG GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT 27.3 0.0273 P0.5 retina ATGGCTATGG (2) GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT TGCAGTGGTG 21.6 0.0216 P2.5 retina ATGGCTATGG (2) CTGTCTGTAG GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT GTAAAGAAGC 42.4 0.0424 P4.5 retina ATGGCTATGG (2) CTGTCTGTAG GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT GGTCTATAGC TTGTGACTTT 35.7 0.0357 P6.5 retina GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT GGTCTATAGC TTGTGACTTT 16.7 0.0167 P10.5 crx- retina ATGGCTATGG (2) CTGTCTGTAG GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT GGTCTATAGC 26.1 0.0261 P10.5 crx+ retina ATGGCTATGG (2) GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT GGTCTATAGC 13.4 0.0134 Adult retinal ATGGCTATGG (2) GCTATGGAGA (2) GCTGTGTAAT 9.4 0.0094 ONL GCTGTGTAAT 1.9 0.0019