Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.45565 4932442E05RikRIKEN cDNA 4932442E05 gene 10    74415 
 Mm.45565 1810038L18RikRIKEN cDNA 1810038L18 gene 10    69181 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 7 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 57 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAACCTCTATG (3)
CATTTTTGGC (2)
GGGACAATGC (2)
8.20.0082
Cb medulloblastomaAACCTCTATG (3)
GGAAGTGTTG (2)
23.10.0231
P8 GC+1d cultureAACCTCTATG (3)
CCTCTCAGAA (3)
GGAAGTGTTG (2)
TCAAGTGGCA (2)
13.60.0136
P8 GC+SHH+1d cultureAACCTCTATG (3)
GGAAGTGTTG (2)
TCAAGTGGCA (2)
8.30.0083
E15 cortexAACCTCTATG (3)
4.90.0049
P1 cortexAACCTCTATG (3)
4.50.0045
HypothalamusAACCTCTATG (3)
CCTCTCAGAA (3)
3.60.0036
E12.5 retinaGGAAGTGTTG (2)
3.80.0038
E14.5 retinaCATATATACA
3.60.0036
E16.5 retinaAACCTTCTAT
GGAAGTGTTG (2)
5.40.0054
E18.5 retinaGGGACAATGC (2)
1.80.0018
P0.5 retinaAACCTCTATG (3)
GGAAGTGTTG (2)
GGGACAATGA (2)
7.90.0079
P2.5 retinaAACCTCTATG (3)
CATATATACA
CATTTTTGGC (2)
GGAAGTGTTG (2)
GGGACAATGA (2)
10.70.0107
P4.5 retinaAACCTCTATG (3)
GGAAGTGTTG (2)
TATTTTATAA (2)
19.80.0198
P6.5 retinaAACCTCTATG (3)
AACCTTCTAT
ACACTTAAGC (3)
CCTCTCAGAA (3)
GGAAGTGTTG (2)
GGGACAATGA (2)
GGGACAATGC (2)
TATTTTATAA (2)
TCAAGTGGCA (2)
41.90.0419
P10.5 crx- retinaAACCTCTATG (3)
ACACTTAAGC (3)
CATATATACA
CCTCTCAGAA (3)
GGAAGTGTTG (2)
TCAAGTGGCA (2)
24.30.0243
P10.5 crx+ retinaAACCTCTATG (3)
AACCTTCTAT
GGAAGTGTTG (2)
GGGACAATGC (2)
TATTTTATAA (2)
230.023
Adult retinalACACTTAAGC (3)
CATATATACA
GGAAGTGTTG (2)
9.40.0094
ONLAACCTTCTAT
GGAAGTGTTG (2)
13.40.0134