Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.25504 D2Bwg0886eDNA segment, Chr 2, Brigham & Women's Genetics 0886 expressed 2  2 24.0 cM  52841 
 Mm.25504 E030004H24RikRIKEN cDNA E030004H24 gene 2    319424 
 Mm.25504 5830434P21RikRIKEN cDNA 5830434P21 gene 2  2 B  227723 
 Human Homolog KIAA0515[KIAA0515]
 Clusters 
   Neighbors    

Total 9 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 79 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTTTCTCAAA (3)11.40.0114
P8 Cb GCCACCCCAGCC (4)3.30.0033
P8 Cb GCAGAGCAGAGA (5)1.60.0016
P8 Cb GCGCCTTTGGTG (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaCTTTCTCAAA (3)6.90.0069
Cb medulloblastomaGTTGGAAAAA (3)4.60.0046
P8 GC+1d cultureTCACAATCCT (3)5.70.0057
P8 GC+1d cultureCTTTCTCAAA (3)4.60.0046
P8 GC+1d cultureAGAGCAGAGA (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureGTTTGGCAAC (3)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTTTGGCTTTA (4)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCTTTCTCAAA (3)11.70.0117
P8 GC+SHH+1d cultureTCACAATCCT (3)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureTTTGGCTTTA (4)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureTCTTTCCCCA (4)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureAGAGCAGAGA (5)1.20.0012
3T3 fibroblastsCACCCCAGCC (4)70.007
3T3 fibroblastsAGAGCAGAGA (5)3.50.0035
3T3 fibroblastsGTTTGGCAAC (3)3.50.0035
3T3 fibroblastsTCACAATCCT (3)3.50.0035
E15 cortexCACCCCAGCC (4)4.90.0049
E15 cortexCTTTCTCAAA (3)4.90.0049
P1 cortexTCACAATCCT (3)9.10.0091
P1 cortexAGAGCAGAGA (5)4.50.0045
HypothalamusAGAGCAGAGA (5)3.60.0036
HypothalamusCTTTCTCAAA (3)3.60.0036
HypothalamusTCACAATCCT (3)1.80.0018
E12.5 retinaCACCCCAGCC (4)1.90.0019
E12.5 retinaCTTTCTCAAA (3)1.90.0019
E12.5 retinaTCTTTCCCCA (4)1.90.0019
E12.5 retinaTTTGGCTTTA (4)1.90.0019
E14.5 retinaCTTTCTCAAA (3)7.30.0073
E14.5 retinaCTCCCAGCGT (3)1.80.0018
E14.5 retinaGCCTTTGGTG (4)1.80.0018
E14.5 retinaGTTGGAAAAA (3)1.80.0018
E14.5 retinaTCACAATCCT (3)1.80.0018
E16.5 retinaCTTTCTCAAA (3)9.10.0091
E16.5 retinaCTCCCAGCGT (3)7.20.0072
E16.5 retinaGTTGGAAAAA (3)1.80.0018
E16.5 retinaTCTTTCCCCA (4)1.80.0018
E18.5 retinaCTTTCTCAAA (3)200.02
E18.5 retinaCACCCCAGCC (4)1.80.0018
E18.5 retinaGTTGGAAAAA (3)1.80.0018
E18.5 retinaTCACAATCCT (3)1.80.0018
P0.5 retinaCTTTCTCAAA (3)5.90.0059
P0.5 retinaTCACAATCCT (3)5.90.0059
P0.5 retinaAGAGCAGAGA (5)3.90.0039
P0.5 retinaCTCCCAGCGT (3)20.002
P0.5 retinaGCCTTTGGTG (4)20.002
P0.5 retinaGTTTGGCAAC (3)20.002
P0.5 retinaTCTTTCCCCA (4)20.002
P2.5 retinaCTTTCTCAAA (3)70.007
P2.5 retinaTCACAATCCT (3)3.50.0035
P2.5 retinaAGAGCAGAGA (5)1.80.0018
P2.5 retinaGCCTTTGGTG (4)1.80.0018
P2.5 retinaTCTTTCCCCA (4)1.80.0018
P4.5 retinaCTTTCTCAAA (3)40.004
P4.5 retinaAGAGCAGAGA (5)20.002
P4.5 retinaCACCCCAGCC (4)20.002
P4.5 retinaTCACAATCCT (3)20.002
P6.5 retinaCTTTCTCAAA (3)11.70.0117
P6.5 retinaCTCCCAGCGT (3)1.70.0017
P6.5 retinaGCCTTTGGTG (4)1.70.0017
P6.5 retinaTCACAATCCT (3)1.70.0017
P6.5 retinaTTTGGCTTTA (4)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCACCCCAGCC (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTCACAATCCT (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCTTTCTCAAA (3)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaAGAGCAGAGA (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCACCCCAGCC (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGTTGGAAAAA (3)1.90.0019
Adult retinalCTTTCTCAAA (3)3.70.0037
Adult retinalAGAGCAGAGA (5)1.90.0019
Adult retinalCACCCCAGCC (4)1.90.0019
Adult retinalCTCCCAGCGT (3)1.90.0019
Adult retinalTCACAATCCT (3)1.90.0019
Adult retinalTTTGGCTTTA (4)1.90.0019
ONLCTTTCTCAAA (3)5.70.0057
ONLTCACAATCCT (3)1.90.0019