Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.41702 6230403H02RikRIKEN cDNA 6230403H02 gene 12    67779 
 Mm.41702 1110038H03RikRIKEN cDNA 1110038H03 gene 12    66189 
 Mm.41702 Sox11SRY-box containing gene 11 12  12  20666 
 Gene Ontology DNA binding | nucleus | regulation of transcription, DNA-dependent | transcription factor activity | transcription factor complex
 Clusters 
   Neighbors    

Total 6 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 120 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACAATGGCAT (4)
CAAACTCTAT (3)
CAAATATGTT (6)
CAGAGTGTAG (3)
CTCTTAGCAG (3)
GAATAGATAA (3)
GACTCCCCAC (4)
GCACTGTTAA (3)
GTCAGAGAGA (5)
GTGAGTGTTT (3)
GTGATCGTGT (3)
TAAACACATC (3)
TAAGGCTCAG (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
TGGCTTTTAT (6)
114.10.1141
Cb medulloblastomaCAGAGTGTAG (3)
2.30.0023
P8 GC+1d cultureACAATGGCAT (4)
CAAACTCTAT (3)
CAAATATGTT (6)
CAGAGTGTAG (3)
CTCTTAGCAG (3)
GAATAGATAA (3)
GCACTGTTAA (3)
GTCAGAGAGA (5)
GTGAGGAAGG (4)
GTGAGTGTTT (3)
TAAACACATC (3)
TATAGAAGTA (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
TGGCTTTTAT (6)
108.10.1081
P8 GC+SHH+1d cultureACAATGGCAT (4)
CAAATATGTT (6)
CAGAGTGTAG (3)
CTCTTAGCAG (3)
GAATAGATAA (3)
GCACTGTTAA (3)
GCAGTCTAGC (3)
GGCACATCCA (3)
GTCAGAGAGA (5)
GTGAGTGTTT (3)
TAAGGCTCAG (3)
TGGAGGCTCC (4)
TGGATGCAGT (3)
TGGCTTTTAT (6)
73.90.0739
E15 cortexCAAATATGTT (6)
CAGAGTGTAG (3)
CTCTTAGCAG (3)
GCACTGTTAA (3)
GCAGTCTAGC (3)
GTCAGAGAGA (5)
GTGAGGAAGG (4)
GTGAGTGTTT (3)
GTGATCGTGT (3)
TAAGGCTCAG (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
395.40.3954
P1 cortexCAAATATGTT (6)
CAGAGTGTAG (3)
CTCTTAGCAG (3)
GCACTGTTAA (3)
GTGAGTGTTT (3)
GTGATCGTGT (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
63.40.0634
HypothalamusTATTTGCAAA (4)
1.80.0018
E12.5 retinaCAAACTCTAT (3)
CAAATATGTT (6)
GAATAGATAA (3)
GACTCCCCAC (4)
GCACTGTTAA (3)
GTCAGAGAGA (5)
GTGAGTGTTT (3)
TAAGGCTCAG (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
TGGATGCAGT (3)
79.10.0791
E14.5 retinaCAGAGTGTAG (3)
GCACTGTTAA (3)
GGCACATCCA (3)
TGGAGGCTCC (4)
TGGATGCAGT (3)
25.40.0254
E16.5 retinaCAAATATGTT (6)
GCACTGTTAA (3)
GGCACATCCA (3)
GTGAGTGTTT (3)
TGGAGGCTCC (4)
28.90.0289
E18.5 retinaCAAATATGTT (6)
CAGAGTGTAG (3)
GCACTGTTAA (3)
GTGAGTGTTT (3)
TAAGGCTCAG (3)
TGGAGGCTCC (4)
TGGCTTTTAT (6)
38.20.0382
P0.5 retinaACAATGGCAT (4)
CTCTTAGCAG (3)
GCACTGTTAA (3)
GTGAGGAAGG (4)
GTGAGTGTTT (3)
TAAGGCTCAG (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
23.80.0238
P2.5 retinaACAATGGCAT (4)
CAAACTCTAT (3)
CAGAGTGTAG (3)
CTCTTAGCAG (3)
GCACTGTTAA (3)
TATAGAAGTA (3)
TATTTGCAAA (4)
TGGAGGCTCC (4)
16.10.0161
P4.5 retinaGCACTGTTAA (3)
GTGAGTGTTT (3)
TGGAGGCTCC (4)
11.90.0119
P6.5 retinaGACTCCCCAC (4)
1.70.0017
P10.5 crx- retinaCAAATATGTT (6)
TGGAGGCTCC (4)
3.80.0038
Adult retinalTATAGAAGTA (3)
TGGATGCAGT (3)
3.80.0038
ONLTGGATGCAGT (3)
1.90.0019