Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.11480 Bxdc1brix domain containing 1 10    67239 
 Gene Ontology nucleus
 Human Homolog BXDC1[brix domain containing 1]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 60 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGCACACACA (29)8.20.0082
P8 Cb GCTGGGTGCTGG (64)8.20.0082
P8 Cb GCAAAGTGCCCA (4)1.60.0016
P8 Cb GCTATGTCACAG1.60.0016
Cb medulloblastomaTGGGTGCTGG (64)9.20.0092
Cb medulloblastomaTGCACACACA (29)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGCACACACA (29)9.10.0091
P8 GC+1d cultureTGGGTGCTGG (64)5.70.0057
P8 GC+1d cultureAAAGTGCCCA (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTATGCACTGA1.10.0011
P8 GC+1d cultureTATGTCACAG1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGCACACACA (29)16.40.0164
P8 GC+SHH+1d cultureTGGGTGCTGG (64)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureTTGGGCTCCC (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsTGGGTGCTGG (64)17.50.0175
3T3 fibroblastsTGCACACACA (29)140.014
E15 cortexTGGGTGCTGG (64)14.80.0148
E15 cortexAAAGTGCCCA (4)4.90.0049
P1 cortexTGGGTGCTGG (64)13.60.0136
P1 cortexTGCACACACA (29)4.50.0045
HypothalamusTGGGTGCTGG (64)9.10.0091
HypothalamusTGCACACACA (29)1.80.0018
E12.5 retinaTGGGTGCTGG (64)9.40.0094
E12.5 retinaTATGTCACAG5.60.0056
E12.5 retinaTGCACACACA (29)5.60.0056
E12.5 retinaTTGGGCTCCC (3)1.90.0019
E14.5 retinaTGGGTGCTGG (64)54.70.0547
E14.5 retinaTGCACACACA (29)9.10.0091
E14.5 retinaTTGGGCTCCC (3)1.80.0018
E16.5 retinaTGGGTGCTGG (64)41.70.0417
E16.5 retinaTGCACACACA (29)9.10.0091
E18.5 retinaTGGGTGCTGG (64)200.02
E18.5 retinaTGCACACACA (29)7.30.0073
E18.5 retinaAAAGTGCCCA (4)1.80.0018
E18.5 retinaTTGGGCTCCC (3)1.80.0018
P0.5 retinaTGGGTGCTGG (64)11.80.0118
P0.5 retinaAAAGTGCCCA (4)7.90.0079
P0.5 retinaTGCACACACA (29)20.002
P2.5 retinaTGGGTGCTGG (64)17.60.0176
P2.5 retinaTGCACACACA (29)3.50.0035
P4.5 retinaTGGGTGCTGG (64)9.90.0099
P4.5 retinaTGCACACACA (29)20.002
P4.5 retinaTTGGGCTCCC (3)20.002
P6.5 retinaTGGGTGCTGG (64)13.30.0133
P6.5 retinaTGCACACACA (29)11.70.0117
P6.5 retinaTTGGGCTCCC (3)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTGGGTGCTGG (64)20.40.0204
P10.5 crx- retinaTGCACACACA (29)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTATGCACTGA1.90.0019
P10.5 crx- retinaTTGGGCTCCC (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGGGTGCTGG (64)15.40.0154
P10.5 crx+ retinaTGCACACACA (29)9.60.0096
P10.5 crx+ retinaAAAGTGCCCA (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTATGTCACAG1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTTGGGCTCCC (3)1.90.0019
Adult retinalTGGGTGCTGG (64)130.013
Adult retinalTGCACACACA (29)9.30.0093
Adult retinalTATGCACTGA1.90.0019
ONLTGGGTGCTGG (64)40.20.0402
ONLTGCACACACA (29)15.30.0153