Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.119387 BC017647cDNA sequence BC017647 11    216971 
 Mm.119387 9630020I17RikRIKEN cDNA 9630020I17 gene 11    319557 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 39 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCCCTTCCCA (7)6.50.0065
P8 Cb GCCCCCTCCCCA (6)3.30.0033
P8 Cb GCAAGAAAACCA (8)1.60.0016
P8 Cb GCGTGGGCAGCC (5)1.60.0016
Cb medulloblastomaCCCCTTCCCA (7)18.50.0185
Cb medulloblastomaCCCCTCCCCA (6)16.20.0162
Cb medulloblastomaGCAACTGTCA (4)4.60.0046
P8 GC+1d cultureCCCCTTCCCA (7)9.10.0091
P8 GC+1d cultureCCCCTCCCCA (6)5.70.0057
P8 GC+SHH+1d cultureCCCCTTCCCA (7)11.70.0117
P8 GC+SHH+1d cultureAAGAAAACCA (8)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureCCCCTCCCCA (6)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGTGGAATTTT (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGTGGGCAGCC (5)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTGAGCAAAG (4)1.20.0012
3T3 fibroblastsGTGGGCAGCC (5)3.50.0035
E15 cortexTTGAGCAAAG (4)4.90.0049
P1 cortexCCCCTTCCCA (7)4.50.0045
P1 cortexTTGAGCAAAG (4)4.50.0045
HypothalamusCCCCTTCCCA (7)3.60.0036
HypothalamusAAGAAAACCA (8)1.80.0018
HypothalamusGCAACTGTCA (4)1.80.0018
E12.5 retinaCCCCTTCCCA (7)1.90.0019
E18.5 retinaCCCCTTCCCA (7)3.60.0036
E18.5 retinaGTGGAATTTT (4)3.60.0036
P0.5 retinaGTGGGCAGCC (5)20.002
P2.5 retinaAAGAAAACCA (8)1.80.0018
P2.5 retinaCCCCTTCCCA (7)1.80.0018
P4.5 retinaCCCCTTCCCA (7)5.90.0059
P4.5 retinaGCAACTGTCA (4)20.002
P6.5 retinaCCCCTTCCCA (7)6.70.0067
P6.5 retinaTTGAGCAAAG (4)50.005
P6.5 retinaCCCCTCCCCA (6)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCCCCTCCCCA (6)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCCCCTCCCCA (6)7.70.0077
P10.5 crx+ retinaCCCCTTCCCA (7)1.90.0019
Adult retinalCCCCTTCCCA (7)7.40.0074
Adult retinalTTGAGCAAAG (4)1.90.0019
ONLCCCCTCCCCA (6)1.90.0019