Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.137746 Ube3cubiquitin protein ligase E3C 5    100763 
 Gene Ontology intracellular | ligase activity | protein modification | ubiquitin cycle | ubiquitin-protein ligase activity
 Human Homolog UBE3C[ubiquitin protein ligase E3C]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 61 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGAGCTGGTGA (8)4.90.0049
P8 Cb GCGTGTGTGGGG (5)1.60.0016
P8 Cb GCGTTTTCCCCT (5)1.60.0016
P8 Cb GCTGTGATGTTA (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaCTTATTTTAA (2)4.60.0046
Cb medulloblastomaGAGCTGGTGA (8)2.30.0023
Cb medulloblastomaGCTTAAAAAA (7)2.30.0023
Cb medulloblastomaGTTTTCCCCT (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureGAGCTGGTGA (8)12.60.0126
P8 GC+1d cultureTGTGATGTTA (4)4.60.0046
P8 GC+1d cultureGCTGTGTGGG (5)3.40.0034
P8 GC+1d cultureGTTTTCCCCT (5)3.40.0034
P8 GC+SHH+1d cultureGAGCTGGTGA (8)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureGCTGTGTGGG (5)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureGTTTTCCCCT (5)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureTGTGATGTTA (4)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureCTTATTTTAA (2)1.20.0012
3T3 fibroblastsTGTGATGTTA (4)3.50.0035
E15 cortexGAGCTGGTGA (8)4.90.0049
E15 cortexGTTTTCCCCT (5)4.90.0049
P1 cortexGTTTTCCCCT (5)13.60.0136
P1 cortexGTGTGTGGGG (5)4.50.0045
P1 cortexTGTGATGTTA (4)4.50.0045
HypothalamusGAGCTGGTGA (8)5.40.0054
HypothalamusGTTTTCCCCT (5)3.60.0036
E12.5 retinaGAGCTGGTGA (8)9.40.0094
E14.5 retinaTGTTTTGCAA (3)3.60.0036
E14.5 retinaGAGCTGGTGA (8)1.80.0018
E14.5 retinaGTGTGTGGGG (5)1.80.0018
E16.5 retinaGAGCTGGTGA (8)5.40.0054
E16.5 retinaGCTGTGTGGG (5)1.80.0018
E18.5 retinaGAGCTGGTGA (8)1.80.0018
E18.5 retinaGCTGTGTGGG (5)1.80.0018
E18.5 retinaGCTTAAAAAA (7)1.80.0018
E18.5 retinaTGTGATGTTA (4)1.80.0018
P0.5 retinaTGTGATGTTA (4)3.90.0039
P0.5 retinaGAGCTGGTGA (8)20.002
P2.5 retinaGAGCTGGTGA (8)70.007
P2.5 retinaGCTGTGTGGG (5)1.80.0018
P2.5 retinaGTGTGTGGGG (5)1.80.0018
P4.5 retinaGAGCTGGTGA (8)5.90.0059
P4.5 retinaTGTGATGTTA (4)5.90.0059
P4.5 retinaCTTATTTTAA (2)20.002
P4.5 retinaGCTGTGTGGG (5)20.002
P4.5 retinaGCTTAAAAAA (7)20.002
P6.5 retinaTGTGATGTTA (4)100.01
P6.5 retinaGAGCTGGTGA (8)8.30.0083
P6.5 retinaGCTGTGTGGG (5)1.70.0017
P6.5 retinaGCTTAAAAAA (7)1.70.0017
P10.5 crx- retinaGAGCTGGTGA (8)130.013
P10.5 crx- retinaGTTTTCCCCT (5)5.60.0056
P10.5 crx- retinaTGTGATGTTA (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGCTGTGTGGG (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGAGCTGGTGA (8)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaCTTATTTTAA (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGTGATGTTA (4)1.90.0019
Adult retinalTGTGATGTTA (4)3.70.0037
Adult retinalGCTGTGTGGG (5)1.90.0019
Adult retinalTGTTTTGCAA (3)1.90.0019
ONLGAGCTGGTGA (8)7.70.0077
ONLTGTGATGTTA (4)1.90.0019