Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.193395 6330580J24RikRIKEN cDNA 6330580J24 gene 9    67789 
 Gene Ontology tRNA ligase activity
 Human Homolog FLJ10496[hypothetical protein FLJ10496]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 51 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTGAGCTGCA (4)11.40.0114
P8 Cb GCGATTTCAGCT (2)8.20.0082
P8 Cb GCGACTGCTGGC (8)3.30.0033
Cb medulloblastomaCTGAGCTGCA (4)4.60.0046
Cb medulloblastomaGATTTCAGCT (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCTGAGCTGCA (4)240.024
P8 GC+1d cultureGACTGCTGGC (8)80.008
P8 GC+1d cultureGATTTCAGCT (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGGGCAAGGC (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCTGAGCTGCA (4)16.40.0164
P8 GC+SHH+1d cultureGACTGCTGGC (8)11.70.0117
P8 GC+SHH+1d cultureGATTTCAGCT (2)2.30.0023
3T3 fibroblastsCTGAGCTGCA (4)10.50.0105
E15 cortexCTGAGCTGCA (4)9.90.0099
E15 cortexGATTTCAGCT (2)4.90.0049
E15 cortexTGGGCAAGGC (3)4.90.0049
P1 cortexCTGAGCTGCA (4)9.10.0091
P1 cortexGATTTCAGCT (2)4.50.0045
HypothalamusCTGAGCTGCA (4)5.40.0054
HypothalamusGATTTCAGCT (2)5.40.0054
HypothalamusGACTGCTGGC (8)1.80.0018
E12.5 retinaCTGAGCTGCA (4)16.90.0169
E12.5 retinaGATTTCAGCT (2)1.90.0019
E14.5 retinaCTGAGCTGCA (4)18.20.0182
E14.5 retinaGATTTCAGCT (2)3.60.0036
E16.5 retinaCTGAGCTGCA (4)21.70.0217
E16.5 retinaGATTTCAGCT (2)1.80.0018
E18.5 retinaCTGAGCTGCA (4)21.80.0218
E18.5 retinaGATTTCAGCT (2)1.80.0018
P0.5 retinaCTGAGCTGCA (4)17.70.0177
P0.5 retinaGATTTCAGCT (2)11.80.0118
P0.5 retinaGACTGCTGGC (8)20.002
P0.5 retinaTGGGCAAGGC (3)20.002
P0.5 retinaTTGAGCTGCA (2)20.002
P2.5 retinaCTGAGCTGCA (4)26.40.0264
P2.5 retinaGATTTCAGCT (2)1.80.0018
P4.5 retinaCTGAGCTGCA (4)33.70.0337
P4.5 retinaGATTTCAGCT (2)20.002
P6.5 retinaCTGAGCTGCA (4)26.70.0267
P6.5 retinaGATTTCAGCT (2)8.30.0083
P10.5 crx- retinaCTGAGCTGCA (4)33.40.0334
P10.5 crx- retinaGATTTCAGCT (2)7.40.0074
P10.5 crx+ retinaCTGAGCTGCA (4)32.70.0327
P10.5 crx+ retinaTTGAGCTGCA (2)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaGACTGCTGGC (8)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGATTTCAGCT (2)1.90.0019
Adult retinalCTGAGCTGCA (4)25.90.0259
Adult retinalGATTTCAGCT (2)9.30.0093
Adult retinalGACTGCTGGC (8)5.60.0056
ONLGATTTCAGCT (2)5.70.0057
ONLCTGAGCTGCA (4)1.90.0019