Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.206238 D5Ertd255eDNA segment, Chr 5, ERATO Doi 255, expressed 5  5 65.0 cM  52183 
 Mm.206238 Thrap2thyroid hormone receptor associated protein 2 5    76199 
 Gene Ontology mediator complex | receptor activity | transcription from Pol II promoter
 Human Homolog THRAP2[thyroid hormone receptor associated protein 2]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 72 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTCCTCCTGC (5)35.90.0359
P8 Cb GCTCCTGGTTAT (3)3.30.0033
P8 Cb GCCCTGTATGTA (2)1.60.0016
P8 Cb GCGAAATACCTT (4)1.60.0016
P8 Cb GCTGAATGTTTA (3)1.60.0016
P8 Cb GCTTAATATAAT (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaCCTGTATGTA (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCTCCTCCTGC (5)25.10.0251
P8 GC+1d cultureGAAATACCTT (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGGTGACTGTT (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCTCCTCCTGC (5)21.10.0211
P8 GC+SHH+1d cultureTGAAAAAAGA (7)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureTGAATGTTTA (3)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureTCCTGGTTAT (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsCTCCTCCTGC (5)49.10.0491
3T3 fibroblastsGGTGACTGTT (3)70.007
E15 cortexCTCCTCCTGC (5)49.50.0495
E15 cortexGGTGACTGTT (3)34.60.0346
E15 cortexGAAATACCTT (4)4.90.0049
E15 cortexGTAGGAGTTC (3)4.90.0049
E15 cortexTGAAAAAAGA (7)4.90.0049
P1 cortexCTCCTCCTGC (5)18.20.0182
P1 cortexGTAGGAGTTC (3)4.50.0045
P1 cortexTCCTGGTTAT (3)4.50.0045
HypothalamusTCCTGGTTAT (3)1.80.0018
E12.5 retinaCTCCTCCTGC (5)24.40.0244
E12.5 retinaTCCTGGTTAT (3)3.80.0038
E12.5 retinaTGACTGTATA (5)3.80.0038
E12.5 retinaGAAATACCTT (4)1.90.0019
E12.5 retinaGAGCAGTGAG (6)1.90.0019
E12.5 retinaTGAATGTTTA (3)1.90.0019
E14.5 retinaCTCCTCCTGC (5)3.60.0036
E14.5 retinaTCCTGGTTAT (3)1.80.0018
E14.5 retinaTGAATGTTTA (3)1.80.0018
E16.5 retinaCTCCTCCTGC (5)9.10.0091
E16.5 retinaGAAATACCTT (4)3.60.0036
E16.5 retinaGAGCAGTGAG (6)3.60.0036
E16.5 retinaTCCTGGTTAT (3)1.80.0018
E16.5 retinaTGAATGTTTA (3)1.80.0018
E16.5 retinaTTAATATAAT (4)1.80.0018
E18.5 retinaTCCTGGTTAT (3)7.30.0073
E18.5 retinaCTCCTCCTGC (5)5.50.0055
P0.5 retinaCTCCTCCTGC (5)13.70.0137
P0.5 retinaGTAGGAGTTC (3)3.90.0039
P0.5 retinaGAGCAGTGAG (6)20.002
P0.5 retinaTCCTGGTTAT (3)20.002
P0.5 retinaTGACTGTATA (5)20.002
P2.5 retinaCTCCTCCTGC (5)14.10.0141
P2.5 retinaGAGCAGTGAG (6)3.50.0035
P2.5 retinaTGACTGTATA (5)3.50.0035
P2.5 retinaCCTGTATGTA (2)1.80.0018
P2.5 retinaTCCTGGTTAT (3)1.80.0018
P4.5 retinaCTCCTCCTGC (5)5.90.0059
P4.5 retinaTGAATGTTTA (3)20.002
P6.5 retinaGAAATACCTT (4)3.30.0033
P6.5 retinaCTCCTCCTGC (5)1.70.0017
P6.5 retinaGGTGACTGTT (3)1.70.0017
P6.5 retinaGTAGGAGTTC (3)1.70.0017
P10.5 crx- retinaGTAGGAGTTC (3)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTGACTGTATA (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCTCCTCCTGC (5)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaTTAATATAAT (4)1.90.0019
Adult retinalTCCTGGTTAT (3)5.60.0056
Adult retinalCCTGTATGTA (2)3.70.0037
Adult retinalTGAATGTTTA (3)3.70.0037
Adult retinalGTAGGAGTTC (3)1.90.0019
Adult retinalTGACTGTATA (5)1.90.0019
ONLTCCTGGTTAT (3)3.80.0038
ONLCCTGTATGTA (2)1.90.0019
ONLCTCCTCCTGC (5)1.90.0019
ONLGAAATACCTT (4)1.90.0019
ONLTGACTGTATA (5)1.90.0019