Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.21118 Iarsisoleucine-tRNA synthetase 13    105148 
 Mm.21118 2510016L12RikRIKEN cDNA 2510016L12 gene 13    70306 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 77 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGTGTGTGTG (115)27.70.0277
P8 Cb GCTTGGGGGAGT (5)3.30.0033
P8 Cb GCGCTCTGGAGA (8)1.60.0016
P8 Cb GCTGAGAGTGCA (2)1.60.0016
Cb medulloblastomaTGTGTGTGTG (115)30.10.0301
Cb medulloblastomaTGAGAGTGCA (2)4.60.0046
P8 GC+1d cultureTGTGTGTGTG (115)27.40.0274
P8 GC+1d cultureTGTGTGTGTA (16)4.60.0046
P8 GC+1d cultureTTGGGGGAGT (5)3.40.0034
P8 GC+1d cultureGTGACAACTA (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTGAGAGTGCA (2)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGTGTGTGTG (115)28.10.0281
P8 GC+SHH+1d cultureTTGGGGGAGT (5)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureGCTCGGGAAG (5)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGTGACAACTA (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGTGGACCGGC (5)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTGAGAGTGCA (2)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTCACATTTA (9)1.20.0012
3T3 fibroblastsTGTGTGTGTG (115)280.028
3T3 fibroblastsGTGGACCGGC (5)3.50.0035
E15 cortexGCTCTGGAGA (8)4.90.0049
E15 cortexTGTGTGTGTA (16)4.90.0049
P1 cortexTGTGTGTGTG (115)18.20.0182
P1 cortexTTCACATTTA (9)4.50.0045
HypothalamusTGTGTGTGTG (115)25.40.0254
HypothalamusGCTCGGGAAG (5)1.80.0018
HypothalamusTGAGAGTGCA (2)1.80.0018
HypothalamusTGTGTGTGTA (16)1.80.0018
E12.5 retinaTGTGTGTGTG (115)43.20.0432
E12.5 retinaTTGGGGGAGT (5)3.80.0038
E12.5 retinaGCTCGGGAAG (5)1.90.0019
E12.5 retinaTGAGAGTGCA (2)1.90.0019
E14.5 retinaTGTGTGTGTG (115)54.70.0547
E14.5 retinaGTGGACCGGC (5)3.60.0036
E14.5 retinaTTCACATTTA (9)1.80.0018
E14.5 retinaTTGGGGGAGT (5)1.80.0018
E16.5 retinaTGTGTGTGTG (115)39.80.0398
E16.5 retinaGTGACAACTA (4)1.80.0018
E16.5 retinaGTGGACCGGC (5)1.80.0018
E16.5 retinaTGTGTGTGTA (16)1.80.0018
E16.5 retinaTTGGGGGAGT (5)1.80.0018
E18.5 retinaTGTGTGTGTG (115)47.30.0473
E18.5 retinaGTGACAACTA (4)1.80.0018
E18.5 retinaGTGGACCGGC (5)1.80.0018
E18.5 retinaTTGGGGGAGT (5)1.80.0018
P0.5 retinaTGTGTGTGTG (115)21.60.0216
P0.5 retinaTGTGTGTGTA (16)7.90.0079
P0.5 retinaTTGGGGGAGT (5)3.90.0039
P0.5 retinaAGCAGACACA (6)20.002
P2.5 retinaTGTGTGTGTG (115)35.20.0352
P2.5 retinaTTGGGGGAGT (5)3.50.0035
P2.5 retinaAGCAGACACA (6)1.80.0018
P2.5 retinaGTGACAACTA (4)1.80.0018
P2.5 retinaTGAGAGTGCA (2)1.80.0018
P4.5 retinaTGTGTGTGTG (115)47.60.0476
P4.5 retinaTGTGTGTGTA (16)20.002
P4.5 retinaTTGGGGGAGT (5)20.002
P6.5 retinaTGTGTGTGTG (115)41.70.0417
P6.5 retinaTGTGTGTGTA (16)50.005
P6.5 retinaGTGGACCGGC (5)3.30.0033
P6.5 retinaGCTCTGGAGA (8)1.70.0017
P6.5 retinaTGAGAGTGCA (2)1.70.0017
P6.5 retinaTTGGGGGAGT (5)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTGTGTGTGTG (115)59.40.0594
P10.5 crx- retinaTGTGTGTGTA (16)5.60.0056
P10.5 crx- retinaGTGGACCGGC (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGTGTGTGTG (115)44.20.0442
P10.5 crx+ retinaAGCAGACACA (6)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGAGAGTGCA (2)1.90.0019
Adult retinalTGTGTGTGTG (115)53.70.0537
Adult retinalTGTGTGTGTA (16)7.40.0074
Adult retinalTTGGGGGAGT (5)3.70.0037
Adult retinalGCTCGGGAAG (5)1.90.0019
Adult retinalTGAGAGTGCA (2)1.90.0019
ONLTGTGTGTGTG (115)230.023
ONLTGTGTGTGTA (16)3.80.0038
ONLGTGGACCGGC (5)1.90.0019