Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.248478	Samhd1	SAM domain and HD domain, 1	2		56045
Gene Ontology	3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity | catalytic activity | immune response | signal transduction
Human Homolog	SAMHD1[SAM domain and HD domain 1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 102 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCTTTAATCC (355) 52.2 0.0522 P8 Cb GC ATGGTGGATT (3) 11.4 0.0114 P8 Cb GC GCCACACTTG (7) 1.6 0.0016 P8 Cb GC GTACAAAATT (2) 1.6 0.0016 P8 Cb GC GTATGTGGGA (2) 1.6 0.0016 P8 Cb GC TCTAAAAAAA (15) 1.6 0.0016 P8 Cb GC TGGCTGCTGG (16) 1.6 0.0016 P8 Cb GC TTCCACACTC (3) 1.6 0.0016 Cb medulloblastoma CCTTTAATCC (355) 41.6 0.0416 Cb medulloblastoma TCTAAAAAAA (15) 13.9 0.0139 Cb medulloblastoma ATGGTGGATT (3) 4.6 0.0046 Cb medulloblastoma GCCACACTTG (7) 2.3 0.0023 Cb medulloblastoma TCTAAAATTT (6) 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture CCTTTAATCC (355) 32 0.032 P8 GC+1d culture ATGGTGGATT (3) 13.7 0.0137 P8 GC+1d culture TCTAAAAAAA (15) 6.8 0.0068 P8 GC+1d culture GTATGTGGGA (2) 5.7 0.0057 P8 GC+1d culture GCCACACTTG (7) 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture TCTAAAATTT (6) 1.1 0.0011 P8 GC+1d culture TGGCTGCTGG (16) 1.1 0.0011 P8 GC+SHH+1d culture CCTTTAATCC (355) 25.8 0.0258 P8 GC+SHH+1d culture ATGGTGGATT (3) 21.1 0.0211 P8 GC+SHH+1d culture TCTAAAAAAA (15) 3.5 0.0035 P8 GC+SHH+1d culture GCCACACTTG (7) 1.2 0.0012 P8 GC+SHH+1d culture TGGCTGCTGG (16) 1.2 0.0012 3T3 fibroblasts CCTTTAATCC (355) 70.1 0.0701 3T3 fibroblasts ATGGTGGATT (3) 7 0.007 3T3 fibroblasts GCCACACTTG (7) 3.5 0.0035 3T3 fibroblasts TGGCTGCTGG (16) 3.5 0.0035 E15 cortex CCTTTAATCC (355) 54.4 0.0544 E15 cortex GCCACACTTG (7) 9.9 0.0099 E15 cortex ATGGTGGATT (3) 4.9 0.0049 E15 cortex TGGCTGCTGG (16) 4.9 0.0049 P1 cortex CCTTTAATCC (355) 154.5 0.1545 P1 cortex TCTAAAAAAA (15) 9.1 0.0091 Hypothalamus CCTTTAATCC (355) 19.9 0.0199 Hypothalamus TCTAAAAAAA (15) 10.9 0.0109 Hypothalamus ATGGTGGATT (3) 3.6 0.0036 Hypothalamus TGGCTGCTGG (16) 3.6 0.0036 Hypothalamus TTCCACACTC (3) 1.8 0.0018 E12.5 retina CCTTTAATCC (355) 75.1 0.0751 E12.5 retina TCTAAAAAAA (15) 3.8 0.0038 E12.5 retina ATGGTGGATT (3) 1.9 0.0019 E12.5 retina GCCACACTTG (7) 1.9 0.0019 E12.5 retina TGGCTGCTGG (16) 1.9 0.0019 E14.5 retina CCTTTAATCC (355) 120.3 0.1203 E14.5 retina TGGCTGCTGG (16) 23.7 0.0237 E14.5 retina ATGGTGGATT (3) 10.9 0.0109 E14.5 retina TCTAAAAAAA (15) 5.5 0.0055 E14.5 retina GTATGTGGGA (2) 1.8 0.0018 E14.5 retina TTCCACACTC (3) 1.8 0.0018 E16.5 retina CCTTTAATCC (355) 68.8 0.0688 E16.5 retina ATGGTGGATT (3) 16.3 0.0163 E16.5 retina TGGCTGCTGG (16) 7.2 0.0072 E16.5 retina TCTAAAAAAA (15) 3.6 0.0036 E18.5 retina CCTTTAATCC (355) 23.6 0.0236 E18.5 retina TCTAAAAAAA (15) 10.9 0.0109 E18.5 retina ATGGTGGATT (3) 7.3 0.0073 E18.5 retina GCCACACTTG (7) 1.8 0.0018 E18.5 retina GTATGTGGGA (2) 1.8 0.0018 E18.5 retina TGGCTGCTGG (16) 1.8 0.0018 P0.5 retina CCTTTAATCC (355) 72.6 0.0726 P0.5 retina ATGGTGGATT (3) 25.5 0.0255 P0.5 retina TCTAAAAAAA (15) 2 0.002 P2.5 retina CCTTTAATCC (355) 70.4 0.0704 P2.5 retina ATGGTGGATT (3) 10.6 0.0106 P2.5 retina TGGCTGCTGG (16) 8.8 0.0088 P2.5 retina TCTAAAAAAA (15) 5.3 0.0053 P2.5 retina GTATGTGGGA (2) 1.8 0.0018 P4.5 retina CCTTTAATCC (355) 43.6 0.0436 P4.5 retina ATGGTGGATT (3) 19.8 0.0198 P4.5 retina TCTAAAAAAA (15) 11.9 0.0119 P4.5 retina TGGCTGCTGG (16) 2 0.002 P6.5 retina CCTTTAATCC (355) 70 0.07 P6.5 retina ATGGTGGATT (3) 11.7 0.0117 P6.5 retina TCTAAAAAAA (15) 10 0.01 P6.5 retina GCCACACTTG (7) 5 0.005 P6.5 retina TGGCTGCTGG (16) 3.3 0.0033 P6.5 retina GTATGTGGGA (2) 1.7 0.0017 P10.5 crx- retina CCTTTAATCC (355) 63.2 0.0632 P10.5 crx- retina ATGGTGGATT (3) 40.9 0.0409 P10.5 crx- retina GCCACACTTG (7) 3.7 0.0037 P10.5 crx- retina GTATGTGGGA (2) 1.9 0.0019 P10.5 crx- retina TCTAAAAAAA (15) 1.9 0.0019 P10.5 crx- retina TGGCTGCTGG (16) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina CCTTTAATCC (355) 38.4 0.0384 P10.5 crx+ retina ATGGTGGATT (3) 9.6 0.0096 P10.5 crx+ retina TCTAAAAAAA (15) 3.8 0.0038 P10.5 crx+ retina GCCACACTTG (7) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina GTACAAAATT (2) 1.9 0.0019 P10.5 crx+ retina TTCCACACTC (3) 1.9 0.0019 Adult retinal CCTTTAATCC (355) 129.6 0.1296 Adult retinal TGGCTGCTGG (16) 5.6 0.0056 Adult retinal GCCACACTTG (7) 3.7 0.0037 Adult retinal ATGGTGGATT (3) 1.9 0.0019 Adult retinal GTATGTGGGA (2) 1.9 0.0019 Adult retinal TCTAAAAAAA (15) 1.9 0.0019 ONL CCTTTAATCC (355) 84.3 0.0843 ONL TGGCTGCTGG (16) 5.7 0.0057 ONL ATGGTGGATT (3) 3.8 0.0038 ONL TCTAAAAAAA (15) 3.8 0.0038 ONL GTACAAAATT (2) 1.9 0.0019