Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.250438 2310046G15RikRIKEN cDNA 2310046G15 gene 7    76453 
 Mm.250438 1700019G06RikRIKEN cDNA 1700019G06 gene 7    69404 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 69 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTTCCCTGTGT (3)6.50.0065
P8 Cb GCATAATACTTA (6)1.60.0016
P8 Cb GCGAGAATGGGG (5)1.60.0016
Cb medulloblastomaTTCCCTGTGT (3)4.60.0046
Cb medulloblastomaATAATACTTA (6)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTTCCCTGTGT (3)12.60.0126
P8 GC+1d cultureGAGAATGGGG (5)9.10.0091
P8 GC+1d cultureACAAAAATAT (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCGTCTTCTTG (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureATAATACTTA (6)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTTCCCTGTGT (3)10.50.0105
P8 GC+SHH+1d cultureGAGAATGGGG (5)9.40.0094
P8 GC+SHH+1d cultureCGTCTTCTTG (2)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureTGCGTGTGTG (16)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTGGGTGTTGA (8)1.20.0012
3T3 fibroblastsGAGAATGGGG (5)10.50.0105
3T3 fibroblastsCGTCTTCTTG (2)70.007
3T3 fibroblastsTGCGTGTGTG (16)3.50.0035
3T3 fibroblastsTTCCCTGTGT (3)3.50.0035
P1 cortexGAGAATGGGG (5)4.50.0045
P1 cortexTTCCCTGTGT (3)4.50.0045
HypothalamusTTCCCTGTGT (3)3.60.0036
HypothalamusCTGGGTAATT (3)1.80.0018
HypothalamusGAGAATGGGG (5)1.80.0018
E12.5 retinaTTCCCTGTGT (3)5.60.0056
E12.5 retinaGAGAATGGGG (5)3.80.0038
E14.5 retinaTTCCCTGTGT (3)10.90.0109
E14.5 retinaCTGGGTAATT (3)1.80.0018
E14.5 retinaTGCGTGTGTG (16)1.80.0018
E16.5 retinaTTCCCTGTGT (3)7.20.0072
E16.5 retinaACAAAAATAT (5)1.80.0018
E16.5 retinaAGAAAAATAT (4)1.80.0018
E16.5 retinaCGTCTTCTTG (2)1.80.0018
E16.5 retinaGAGAATGGGG (5)1.80.0018
E16.5 retinaTGGGTGTTGA (8)1.80.0018
E18.5 retinaTGGGTGTTGA (8)1.80.0018
E18.5 retinaTTCCCTGTGT (3)1.80.0018
P0.5 retinaGAGAATGGGG (5)13.70.0137
P0.5 retinaCGTCTTCTTG (2)5.90.0059
P0.5 retinaACAAAAATAT (5)20.002
P0.5 retinaATAATACTTA (6)20.002
P0.5 retinaTGCGTGTGTG (16)20.002
P0.5 retinaTTCCCTGTGT (3)20.002
P2.5 retinaTTCCCTGTGT (3)8.80.0088
P2.5 retinaGAGAATGGGG (5)3.50.0035
P2.5 retinaACAAAAATAT (5)1.80.0018
P2.5 retinaCGTCTTCTTG (2)1.80.0018
P2.5 retinaCTGGGTAATT (3)1.80.0018
P2.5 retinaTGCGTGTGTG (16)1.80.0018
P4.5 retinaATAATACTTA (6)20.002
P4.5 retinaGAGAATGGGG (5)20.002
P4.5 retinaTTCCCTGTGT (3)20.002
P6.5 retinaGAGAATGGGG (5)3.30.0033
P6.5 retinaTTCCCTGTGT (3)3.30.0033
P6.5 retinaACAAAAATAT (5)1.70.0017
P6.5 retinaAGAAAAATAT (4)1.70.0017
P6.5 retinaTGCGTGTGTG (16)1.70.0017
P10.5 crx- retinaGAGAATGGGG (5)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTTCCCTGTGT (3)3.70.0037
P10.5 crx- retinaACAAAAATAT (5)1.90.0019
P10.5 crx- retinaCGTCTTCTTG (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTTCCCTGTGT (3)7.70.0077
P10.5 crx+ retinaGAGAATGGGG (5)1.90.0019
Adult retinalGAGAATGGGG (5)9.30.0093
Adult retinalTTCCCTGTGT (3)1.90.0019
ONLACAAAAATAT (5)3.80.0038
ONLGAGAATGGGG (5)3.80.0038
ONLTTCCCTGTGT (3)3.80.0038
ONLTGCGTGTGTG (16)1.90.0019