Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.258927 Eef1deukaryotic translation elongation factor 1 delta (guanine nucleotide exchange protein) 15    66656 
 Mm.258927 1700026P12RikRIKEN cDNA 1700026P12 gene 15    76576 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 127 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCACAAACGGT (5)192.50.1925
P8 Cb GCTGTGTGAGGA (6)440.044
P8 Cb GCCTCCTCAAAT (6)24.50.0245
P8 Cb GCAGCAGATGAA (5)1.60.0016
P8 Cb GCCTGTGGGGGG (6)1.60.0016
P8 Cb GCGCCCAGCTAG (2)1.60.0016
P8 Cb GCGTCCTCAAAT (5)1.60.0016
P8 Cb GCTTGTGAGCTG (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaCACAAACGGT (5)101.70.1017
Cb medulloblastomaTGTGTGAGGA (6)23.10.0231
Cb medulloblastomaCTCCTCAAAT (6)11.60.0116
Cb medulloblastomaCTGTGGGGGG (6)2.30.0023
Cb medulloblastomaTGTGTGGAGG (8)2.30.0023
Cb medulloblastomaTTGCAGAAGT (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCACAAACGGT (5)110.70.1107
P8 GC+1d cultureTGTGTGAGGA (6)28.50.0285
P8 GC+1d cultureCTCCTCAAAT (6)14.80.0148
P8 GC+1d cultureTGCCCAGGGC (7)4.60.0046
P8 GC+1d cultureCTGTGGGGGG (6)2.30.0023
P8 GC+1d cultureGCCCAGCTAG (2)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTCAGCTCTCA (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCACAAACGGT (5)118.30.1183
P8 GC+SHH+1d cultureCTCCTCAAAT (6)26.90.0269
P8 GC+SHH+1d cultureTGTGTGAGGA (6)26.90.0269
P8 GC+SHH+1d cultureTGCCCAGGGC (7)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureTTGTGAGCTG (4)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureAGCAGATGAA (5)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureCATATCTGCC (2)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureGCCAGCTTAG (4)1.20.0012
3T3 fibroblastsCACAAACGGT (5)150.70.1507
3T3 fibroblastsTGTGTGAGGA (6)56.10.0561
3T3 fibroblastsCTCCTCAAAT (6)70.007
3T3 fibroblastsGGCACAGGGG (6)3.50.0035
3T3 fibroblastsTCAGCTCTCA (3)3.50.0035
E15 cortexCACAAACGGT (5)69.30.0693
E15 cortexTGTGTGAGGA (6)29.70.0297
E15 cortexCTCCTCAAAT (6)24.70.0247
E15 cortexCTGTGGGGGG (6)4.90.0049
E15 cortexGTGGGGGGGG (19)4.90.0049
P1 cortexCACAAACGGT (5)86.40.0864
P1 cortexTGTGTGAGGA (6)13.60.0136
P1 cortexCTCCTCAAAT (6)9.10.0091
P1 cortexGGCACAGGGG (6)4.50.0045
P1 cortexTTGTGAGCTG (4)4.50.0045
HypothalamusCACAAACGGT (5)54.30.0543
HypothalamusTGTGTGAGGA (6)19.90.0199
HypothalamusCTCCTCAAAT (6)3.60.0036
HypothalamusGCCAGCTTAG (4)1.80.0018
HypothalamusGTCCTCAAAT (5)1.80.0018
HypothalamusTGCCCAGGGC (7)1.80.0018
HypothalamusTTGTGAGCTG (4)1.80.0018
E12.5 retinaCACAAACGGT (5)287.20.2872
E12.5 retinaTGTGTGAGGA (6)65.70.0657
E12.5 retinaCTCCTCAAAT (6)150.015
E12.5 retinaCTGTGGGGGG (6)1.90.0019
E12.5 retinaGCCCAGCTAG (2)1.90.0019
E12.5 retinaTTGCAGAAGT (2)1.90.0019
E14.5 retinaCACAAACGGT (5)131.20.1312
E14.5 retinaTGTGTGAGGA (6)45.50.0455
E14.5 retinaCTCCTCAAAT (6)25.50.0255
E14.5 retinaGGCACAGGGG (6)5.50.0055
E14.5 retinaCTGTGGGGGG (6)3.60.0036
E14.5 retinaTGCCCAGGGC (7)3.60.0036
E16.5 retinaCACAAACGGT (5)199.20.1992
E16.5 retinaCTCCTCAAAT (6)47.10.0471
E16.5 retinaTGTGTGAGGA (6)380.038
E16.5 retinaAGCAGATGAA (5)1.80.0018
E16.5 retinaCTGTGGGGGG (6)1.80.0018
E16.5 retinaGGCACAGGGG (6)1.80.0018
E16.5 retinaTGCCCAGGGC (7)1.80.0018
E18.5 retinaCACAAACGGT (5)120.10.1201
E18.5 retinaTGTGTGAGGA (6)41.80.0418
E18.5 retinaCTCCTCAAAT (6)34.60.0346
E18.5 retinaCTGTGGGGGG (6)3.60.0036
P0.5 retinaCACAAACGGT (5)233.50.2335
P0.5 retinaTGTGTGAGGA (6)33.40.0334
P0.5 retinaCTCCTCAAAT (6)21.60.0216
P0.5 retinaCTGTGGGGGG (6)9.80.0098
P0.5 retinaGCCCAGCTAG (2)20.002
P0.5 retinaTGCCCAGGGC (7)20.002
P2.5 retinaCACAAACGGT (5)119.70.1197
P2.5 retinaTGTGTGAGGA (6)42.20.0422
P2.5 retinaCTCCTCAAAT (6)22.90.0229
P2.5 retinaTCAGCTCTCA (3)3.50.0035
P2.5 retinaTGCCCAGGGC (7)3.50.0035
P2.5 retinaCATATCTGCC (2)1.80.0018
P2.5 retinaCTGTGGGGGG (6)1.80.0018
P2.5 retinaTTGTGAGCTG (4)1.80.0018
P4.5 retinaCACAAACGGT (5)89.20.0892
P4.5 retinaTGTGTGAGGA (6)45.60.0456
P4.5 retinaCTCCTCAAAT (6)27.70.0277
P4.5 retinaCTGTGGGGGG (6)20.002
P4.5 retinaGGCACAGGGG (6)20.002
P4.5 retinaTGCCCAGGGC (7)20.002
P4.5 retinaTTGCAGAAGT (2)20.002
P6.5 retinaCACAAACGGT (5)93.40.0934
P6.5 retinaTGTGTGAGGA (6)31.70.0317
P6.5 retinaCTCCTCAAAT (6)23.30.0233
P6.5 retinaCTGTGGGGGG (6)6.70.0067
P6.5 retinaGGCACAGGGG (6)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCACAAACGGT (5)222.90.2229
P10.5 crx- retinaTGTGTGAGGA (6)16.70.0167
P10.5 crx- retinaCTCCTCAAAT (6)9.30.0093
P10.5 crx- retinaCTGTGGGGGG (6)7.40.0074
P10.5 crx- retinaTGCCCAGGGC (7)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCACAAACGGT (5)82.70.0827
P10.5 crx+ retinaTGTGTGAGGA (6)19.20.0192
P10.5 crx+ retinaCTCCTCAAAT (6)9.60.0096
P10.5 crx+ retinaCTGTGGGGGG (6)7.70.0077
P10.5 crx+ retinaCATATCTGCC (2)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGCCAGCTTAG (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGTGGGGGGGG (19)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTCAGCTCTCA (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGCCCAGGGC (7)1.90.0019
Adult retinalCACAAACGGT (5)500.05
Adult retinalTGTGTGAGGA (6)24.10.0241
Adult retinalCTCCTCAAAT (6)7.40.0074
Adult retinalTGCCCAGGGC (7)3.70.0037
Adult retinalTGTGTGGAGG (8)3.70.0037
Adult retinalGCCCAGCTAG (2)1.90.0019
Adult retinalTTGTGAGCTG (4)1.90.0019
ONLCACAAACGGT (5)28.70.0287
ONLTGTGTGAGGA (6)19.20.0192
ONLCTCCTCAAAT (6)5.70.0057
ONLCTGTGGGGGG (6)3.80.0038
ONLGTGGGGGGGG (19)3.80.0038
ONLGGCACAGGGG (6)1.90.0019