Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.27223 Ppp4r2protein phosphatase 4, regulatory subunit 2 X    232314 
 Human Homolog PPP4R2[protein phosphatase 4, regulatory subunit 2]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 65 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAACTTAAAAA (12)4.90.0049
P8 Cb GCGTGGTTCTGT (4)3.30.0033
P8 Cb GCCAAGCTGCAA (2)1.60.0016
Cb medulloblastomaAACTTAAAAA (12)67.10.0671
Cb medulloblastomaGTGGTTCTGT (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAACTTAAAAA (12)80.008
P8 GC+1d cultureTGGAATTATG2.30.0023
P8 GC+1d cultureAGATGAATGG1.10.0011
P8 GC+1d cultureCAAGCTGCAA (2)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTTTAAACTAT1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureAACTTAAAAA (12)5.90.0059
P8 GC+SHH+1d cultureCAAGCTGCAA (2)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureGAGAGTGAGG (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTGGAATTATG1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTTAAACTAT1.20.0012
3T3 fibroblastsGAGAGTGAGG (3)70.007
3T3 fibroblastsCAAGCTGCAA (2)3.50.0035
E15 cortexCAAGCTGCAA (2)4.90.0049
P1 cortexAACTTAAAAA (12)18.20.0182
P1 cortexACTTTAAATA (4)4.50.0045
P1 cortexCAAGCTGCAA (2)4.50.0045
HypothalamusAACTTAAAAA (12)12.70.0127
HypothalamusCAAGCTGCAA (2)1.80.0018
HypothalamusGTGGTTCTGT (4)1.80.0018
E12.5 retinaCAAGCTGCAA (2)7.50.0075
E12.5 retinaTGGAATTATG3.80.0038
E12.5 retinaTTTAAACTAT3.80.0038
E12.5 retinaGAGAGTGAGG (3)1.90.0019
E12.5 retinaTGGTTTCAGA (2)1.90.0019
E14.5 retinaAACTTAAAAA (12)9.10.0091
E14.5 retinaCAAGCTGCAA (2)1.80.0018
E14.5 retinaTGGAATTATG1.80.0018
E16.5 retinaAACTTAAAAA (12)9.10.0091
E16.5 retinaCAAGCTGCAA (2)1.80.0018
E18.5 retinaAACTTAAAAA (12)5.50.0055
E18.5 retinaCAAGCTGCAA (2)1.80.0018
E18.5 retinaTGGTTTCAGA (2)1.80.0018
P0.5 retinaCAAGCTGCAA (2)9.80.0098
P0.5 retinaAACTTAAAAA (12)20.002
P2.5 retinaCAAGCTGCAA (2)5.30.0053
P2.5 retinaTTTAAACTAT3.50.0035
P2.5 retinaAACTTAAAAA (12)1.80.0018
P2.5 retinaTGGAATTATG1.80.0018
P4.5 retinaAACTTAAAAA (12)9.90.0099
P4.5 retinaCAAGCTGCAA (2)5.90.0059
P4.5 retinaAAACCATCTC (3)20.002
P4.5 retinaTGGTTTCAGA (2)20.002
P6.5 retinaAACTTAAAAA (12)11.70.0117
P6.5 retinaCAAGCTGCAA (2)50.005
P6.5 retinaACTTTAAATA (4)1.70.0017
P6.5 retinaGAGAGTGAGG (3)1.70.0017
P6.5 retinaTTTAAACTAT1.70.0017
P10.5 crx- retinaAACTTAAAAA (12)130.013
P10.5 crx- retinaCAAGCTGCAA (2)3.70.0037
P10.5 crx- retinaAAACCATCTC (3)1.90.0019
P10.5 crx- retinaACTTTAAATA (4)1.90.0019
P10.5 crx- retinaAGATGAATGG1.90.0019
P10.5 crx- retinaGAGAGTGAGG (3)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTGGAATTATG1.90.0019
P10.5 crx+ retinaAACTTAAAAA (12)7.70.0077
P10.5 crx+ retinaCAAGCTGCAA (2)1.90.0019
Adult retinalAACTTAAAAA (12)3.70.0037
ONLCAAGCTGCAA (2)3.80.0038
ONLACTTTAAATA (4)1.90.0019
ONLGAGAGTGAGG (3)1.90.0019