Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.272866 Hmox2heme oxygenase (decycling) 2 16  16 2.6 cM  15369 
 Mm.272866 2700048O17RikRIKEN cDNA 2700048O17 gene 16    72582 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 136 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGGTTGCTGG (369)68.50.0685
P8 Cb GCTGTGTGTGTG (115)27.70.0277
P8 Cb GCTTGTTTGCAT (4)4.90.0049
P8 Cb GCCAGAAAAAAG (4)3.30.0033
P8 Cb GCATGGGGAAGG (5)1.60.0016
P8 Cb GCGATGGGGAAA (6)1.60.0016
P8 Cb GCGGGGACTTTT (8)1.60.0016
P8 Cb GCTGGTTGCCGG (6)1.60.0016
Cb medulloblastomaTGGTTGCTGG (369)113.30.1133
Cb medulloblastomaTGTGTGTGTG (115)30.10.0301
Cb medulloblastomaGGGGACTTTT (8)6.90.0069
Cb medulloblastomaTTGTTTGCAT (4)6.90.0069
Cb medulloblastomaCTACAAAAAA (6)2.30.0023
Cb medulloblastomaTGGTTGCCGG (6)2.30.0023
Cb medulloblastomaTTTGAACTTA (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGGTTGCTGG (369)57.10.0571
P8 GC+1d cultureTGTGTGTGTG (115)27.40.0274
P8 GC+1d cultureGTGGACAATG (4)5.70.0057
P8 GC+1d cultureGATGGGGAAA (6)3.40.0034
P8 GC+1d cultureCTACAAAAAA (6)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTTGTTTGCAT (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAGCCAAGTAC (2)1.10.0011
P8 GC+1d cultureATGGGGAAGG (5)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGGGGACTTTT (8)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTGCCAATAAA (7)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTGGTTGCCGG (6)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTTTGAACTTA (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGGTTGCTGG (369)890.089
P8 GC+SHH+1d cultureTGTGTGTGTG (115)28.10.0281
P8 GC+SHH+1d cultureGATGGGGAAA (6)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureGGGGACTTTT (8)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureTGCCAATAAA (7)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureATGGGGAAGG (5)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureCAGAAAAAAG (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureCTACAAAAAA (6)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTGTTTGCAT (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTTGAACTTA (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsTGGTTGCTGG (369)220.80.2208
3T3 fibroblastsTGTGTGTGTG (115)280.028
E15 cortexTGGTTGCTGG (369)277.10.2771
E15 cortexTGGTTGCCGG (6)14.80.0148
E15 cortexGATGGGGAAA (6)4.90.0049
E15 cortexGGGGACTTTT (8)4.90.0049
P1 cortexTGGTTGCTGG (369)86.40.0864
P1 cortexTGTGTGTGTG (115)18.20.0182
P1 cortexGTGGACAATG (4)9.10.0091
P1 cortexTGGTTGCCGG (6)4.50.0045
HypothalamusTGGTTGCTGG (369)349.60.3496
HypothalamusTGTGTGTGTG (115)25.40.0254
HypothalamusTGGTTGCCGG (6)5.40.0054
HypothalamusTTGTTTGCAT (4)3.60.0036
HypothalamusATGGGGAAGG (5)1.80.0018
HypothalamusCAACAGAGAA (4)1.80.0018
E12.5 retinaTGGTTGCTGG (369)157.70.1577
E12.5 retinaTGTGTGTGTG (115)43.20.0432
E12.5 retinaTTGTTTGCAT (4)5.60.0056
E12.5 retinaATGGGGAAGG (5)1.90.0019
E12.5 retinaCTACAAAAAA (6)1.90.0019
E12.5 retinaGATGGGGAAA (6)1.90.0019
E12.5 retinaGGGGACTTTT (8)1.90.0019
E12.5 retinaGTGGACAATG (4)1.90.0019
E12.5 retinaTGGTTGCCGG (6)1.90.0019
E12.5 retinaTGTTTGCATC (5)1.90.0019
E14.5 retinaTGGTTGCTGG (369)936.50.9365
E14.5 retinaTGTGTGTGTG (115)54.70.0547
E14.5 retinaGATGGGGAAA (6)5.50.0055
E14.5 retinaTGGTTGCCGG (6)3.60.0036
E14.5 retinaTGTTTGCATC (5)3.60.0036
E14.5 retinaATGGGGAAGG (5)1.80.0018
E14.5 retinaGGGGACTTTT (8)1.80.0018
E14.5 retinaTTGTTTGCAT (4)1.80.0018
E16.5 retinaTGGTTGCTGG (369)767.90.7679
E16.5 retinaTGTGTGTGTG (115)39.80.0398
E16.5 retinaGATGGGGAAA (6)7.20.0072
E16.5 retinaTGGTTGCCGG (6)7.20.0072
E16.5 retinaTTGTTTGCAT (4)5.40.0054
E18.5 retinaTGGTTGCTGG (369)252.80.2528
E18.5 retinaTGTGTGTGTG (115)47.30.0473
E18.5 retinaCTACAAAAAA (6)3.60.0036
E18.5 retinaTGCCAATAAA (7)1.80.0018
E18.5 retinaTTGTTTGCAT (4)1.80.0018
P0.5 retinaTGGTTGCTGG (369)190.40.1904
P0.5 retinaTGTGTGTGTG (115)21.60.0216
P0.5 retinaGATGGGGAAA (6)3.90.0039
P0.5 retinaCTACAAAAAA (6)20.002
P0.5 retinaGGGGACTTTT (8)20.002
P0.5 retinaGTGGACAATG (4)20.002
P2.5 retinaTGGTTGCTGG (369)165.40.1654
P2.5 retinaTGTGTGTGTG (115)35.20.0352
P2.5 retinaTGGTTGCCGG (6)3.50.0035
P2.5 retinaTTGTTTGCAT (4)3.50.0035
P2.5 retinaATGGGGAAGG (5)1.80.0018
P2.5 retinaCTACAAAAAA (6)1.80.0018
P2.5 retinaGATGGGGAAA (6)1.80.0018
P2.5 retinaGGGGACTTTT (8)1.80.0018
P2.5 retinaTTTGAACTTA (3)1.80.0018
P4.5 retinaTGGTTGCTGG (369)150.60.1506
P4.5 retinaTGTGTGTGTG (115)47.60.0476
P4.5 retinaGGGGACTTTT (8)40.004
P4.5 retinaTTTGAACTTA (3)40.004
P4.5 retinaATGGGGAAGG (5)20.002
P4.5 retinaGATGGGGAAA (6)20.002
P4.5 retinaTTGTTTGCAT (4)20.002
P6.5 retinaTGGTTGCTGG (369)156.70.1567
P6.5 retinaTGTGTGTGTG (115)41.70.0417
P6.5 retinaCTACAAAAAA (6)1.70.0017
P6.5 retinaGATGGGGAAA (6)1.70.0017
P6.5 retinaGGGGACTTTT (8)1.70.0017
P6.5 retinaTGTTTGCATC (5)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTGGTTGCTGG (369)280.50.2805
P10.5 crx- retinaTGTGTGTGTG (115)59.40.0594
P10.5 crx- retinaTTGTTTGCAT (4)5.60.0056
P10.5 crx- retinaTGGTTGCCGG (6)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTTTGAACTTA (3)3.70.0037
P10.5 crx- retinaGTGGACAATG (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGGTTGCTGG (369)101.90.1019
P10.5 crx+ retinaTGTGTGTGTG (115)44.20.0442
P10.5 crx+ retinaTTGTTTGCAT (4)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaGGGGACTTTT (8)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaTGCCAATAAA (7)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaATGGGGAAGG (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCTACAAAAAA (6)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGTGGACAATG (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGGTTGCCGG (6)1.90.0019
Adult retinalTGGTTGCTGG (369)214.80.2148
Adult retinalTGTGTGTGTG (115)53.70.0537
Adult retinalGGGGACTTTT (8)3.70.0037
Adult retinalAGCCAAGTAC (2)1.90.0019
Adult retinalATGGGGAAGG (5)1.90.0019
Adult retinalGTGGACAATG (4)1.90.0019
Adult retinalTGTTTGCATC (5)1.90.0019
Adult retinalTTGTTTGCAT (4)1.90.0019
ONLTGGTTGCTGG (369)398.40.3984
ONLTGTGTGTGTG (115)230.023
ONLAGCCAAGTAC (2)1.90.0019
ONLGATGGGGAAA (6)1.90.0019