Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.274579 1110046J11RikRIKEN cDNA 1110046J11 gene 16    68812 
 Mm.274579 4930429H24RikRIKEN cDNA 4930429H24 gene 16    75785 
 Gene Ontology ion channel activity
 Human Homolog DRE1[DRE1 protein]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 70 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCGCAGTTCACA (4)4.90.0049
P8 Cb GCTCCTTGTTCT (2)4.90.0049
P8 Cb GCTCCATTCATA (3)1.60.0016
P8 Cb GCTGGGTGCTGA (5)1.60.0016
P8 Cb GCTTTATTGCAG (5)1.60.0016
Cb medulloblastomaGCAGTTCACA (4)11.60.0116
Cb medulloblastomaTCCATTCATA (3)2.30.0023
Cb medulloblastomaTTTATTGCAG (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureGCAGTTCACA (4)80.008
P8 GC+1d cultureTGTGTGGTTG (3)4.60.0046
P8 GC+1d cultureTCCATTCATA (3)3.40.0034
P8 GC+1d cultureTCCTTGTTCT (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGGGTGCTGA (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGTGCCTGTA (2)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTCCTTGTTCT (2)70.007
P8 GC+SHH+1d cultureGCAGTTCACA (4)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureTGGGTGCTGA (5)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureGAGAACACTC (6)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureTCCATTCATA (3)2.30.0023
3T3 fibroblastsTGGGTGCTGA (5)3.50.0035
3T3 fibroblastsTGTGCCTGTA (2)3.50.0035
E15 cortexTGGGTGCTGA (5)24.70.0247
E15 cortexGCAGTTCACA (4)14.80.0148
E15 cortexTCCTTGTTCT (2)9.90.0099
P1 cortexGCAGTTCACA (4)4.50.0045
P1 cortexTTTATTGCAG (5)4.50.0045
HypothalamusATGGTGGAAA (8)5.40.0054
HypothalamusGCAGTTCACA (4)5.40.0054
HypothalamusTCCATTCATA (3)3.60.0036
HypothalamusGAGAACACTC (6)1.80.0018
HypothalamusTGGGTGCTGA (5)1.80.0018
E12.5 retinaGCAGTTCACA (4)3.80.0038
E12.5 retinaTGGGTGCTGA (5)3.80.0038
E12.5 retinaTCCTTGTTCT (2)1.90.0019
E14.5 retinaTCCATTCATA (3)7.30.0073
E14.5 retinaGCAGTTCACA (4)5.50.0055
E14.5 retinaGAGAACACTC (6)1.80.0018
E14.5 retinaTGGGTGCTGA (5)1.80.0018
E16.5 retinaTCCTTGTTCT (2)7.20.0072
E16.5 retinaGCAGTTCACA (4)5.40.0054
E16.5 retinaTGGGTGCTGA (5)5.40.0054
E16.5 retinaTCCATTCATA (3)3.60.0036
E18.5 retinaTGGGTGCTGA (5)7.30.0073
E18.5 retinaGCAGTTCACA (4)5.50.0055
E18.5 retinaTCCATTCATA (3)1.80.0018
E18.5 retinaTGTGCCTGTA (2)1.80.0018
P0.5 retinaGCAGTTCACA (4)7.90.0079
P0.5 retinaTCCATTCATA (3)7.90.0079
P0.5 retinaTGGGTGCTGA (5)5.90.0059
P2.5 retinaTCCTTGTTCT (2)8.80.0088
P2.5 retinaTGGGTGCTGA (5)1.80.0018
P4.5 retinaGCAGTTCACA (4)9.90.0099
P4.5 retinaTCCTTGTTCT (2)40.004
P4.5 retinaTGGGTGCTGA (5)40.004
P6.5 retinaGCAGTTCACA (4)6.70.0067
P6.5 retinaTCCATTCATA (3)50.005
P6.5 retinaTGGGTGCTGA (5)50.005
P6.5 retinaTCCTTGTTCT (2)1.70.0017
P10.5 crx- retinaTCCTTGTTCT (2)35.30.0353
P10.5 crx- retinaTGGGTGCTGA (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTCCTTGTTCT (2)11.50.0115
P10.5 crx+ retinaTGGGTGCTGA (5)9.60.0096
P10.5 crx+ retinaGCAGTTCACA (4)3.80.0038
Adult retinalTGGGTGCTGA (5)3.70.0037
Adult retinalTCCATTCATA (3)1.90.0019
Adult retinalTCCTTGTTCT (2)1.90.0019
ONLGCAGTTCACA (4)5.70.0057
ONLTCCATTCATA (3)3.80.0038
ONLTTTATTGCAG (5)3.80.0038
ONLTGGGTGCTGA (5)1.90.0019