Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.291542 8430411E10RikRIKEN cDNA 8430411E10 gene 14    78101 
 Mm.291542 1700009P03RikRIKEN cDNA 1700009P03 gene 14    74213 
 Mm.291542 C85363expressed sequence C85363 14    97928 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 61 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACAATGTTCC (7)3.30.0033
P8 Cb GCATTGCATTAT (6)1.60.0016
P8 Cb GCGGTGTTAATG (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaACAATGTTCC (7)6.90.0069
Cb medulloblastomaGGTGTTAATG (4)4.60.0046
P8 GC+1d cultureACAATGTTCC (7)3.40.0034
P8 GC+1d cultureATTGCATTAT (6)2.30.0023
P8 GC+1d cultureGGTGTTAATG (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTTTATTATTT (15)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAGAGCATTAA (8)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureACAATGTTCC (7)5.90.0059
P8 GC+SHH+1d cultureGGTGTTAATG (4)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureAGAGCATTAA (8)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTCAGCTGTGG (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTTATTATTT (15)1.20.0012
3T3 fibroblastsACAATGTTCC (7)3.50.0035
E15 cortexACAATGTTCC (7)4.90.0049
P1 cortexTTTATTATTT (15)9.10.0091
P1 cortexACAATGTTCC (7)4.50.0045
P1 cortexATTGCATTAT (6)4.50.0045
P1 cortexGGTGTTAATG (4)4.50.0045
HypothalamusTTTATTATTT (15)7.20.0072
HypothalamusACAATGTTCC (7)5.40.0054
E12.5 retinaACAATGTTCC (7)7.50.0075
E12.5 retinaGGTGTTAATG (4)7.50.0075
E12.5 retinaAGAGCATTAA (8)3.80.0038
E12.5 retinaTCAGCTGTGG (3)1.90.0019
E14.5 retinaACAATGTTCC (7)12.80.0128
E14.5 retinaTTTATTATTT (15)3.60.0036
E14.5 retinaGGTGTTAATG (4)1.80.0018
E16.5 retinaACAATGTTCC (7)9.10.0091
E16.5 retinaTTTATTATTT (15)1.80.0018
E18.5 retinaACAATGTTCC (7)7.30.0073
E18.5 retinaAGAGCATTAA (8)3.60.0036
E18.5 retinaAAAACAGTTA (6)1.80.0018
E18.5 retinaTTTATTATTT (15)1.80.0018
P0.5 retinaACAATGTTCC (7)3.90.0039
P0.5 retinaGGTGTTAATG (4)3.90.0039
P0.5 retinaAAAACAGTTA (6)20.002
P2.5 retinaTTTATTATTT (15)12.30.0123
P2.5 retinaACAATGTTCC (7)5.30.0053
P2.5 retinaAATTAAAACT (6)1.80.0018
P4.5 retinaACAATGTTCC (7)11.90.0119
P4.5 retinaTTTATTATTT (15)5.90.0059
P6.5 retinaACAATGTTCC (7)8.30.0083
P6.5 retinaTTTATTATTT (15)3.30.0033
P6.5 retinaATTGCATTAT (6)1.70.0017
P6.5 retinaGGTGTTAATG (4)1.70.0017
P10.5 crx- retinaGGTGTTAATG (4)3.70.0037
P10.5 crx- retinaACAATGTTCC (7)1.90.0019
P10.5 crx- retinaTCAGCTGTGG (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGGTGTTAATG (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTCAGCTGTGG (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTTTATTATTT (15)1.90.0019
Adult retinalACAATGTTCC (7)7.40.0074
Adult retinalTTTATTATTT (15)1.90.0019
ONLACAATGTTCC (7)5.70.0057
ONLAAAACAGTTA (6)3.80.0038
ONLAATTAAAACT (6)1.90.0019
ONLGGTGTTAATG (4)1.90.0019
ONLTTTATTATTT (15)1.90.0019