Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.29760 Psmd13proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 13 7    23997 
 Gene Ontology cytosol | endopeptidase activity | meiosis I | proteasome regulatory particle (sensu Eukarya)
 Human Homolog PSMD13[proteasome (prosome, macropain) 26S subunit, non-ATPase, 13]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 113 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGGATGTGC (4)16.30.0163
P8 Cb GCAGACCCTGCT (6)13.10.0131
P8 Cb GCGAGATCCTGG (5)4.90.0049
P8 Cb GCATCTTGCTGC (6)1.60.0016
P8 Cb GCGAGATGCTGG (5)1.60.0016
P8 Cb GCTTGAATAAAG (6)1.60.0016
Cb medulloblastomaAAGGATGTGC (4)370.037
Cb medulloblastomaGCTCTATACA (3)6.90.0069
Cb medulloblastomaAGACCCTGCT (6)2.30.0023
Cb medulloblastomaCCCTGTGCTG (5)2.30.0023
Cb medulloblastomaGAGATCCTGG (5)2.30.0023
Cb medulloblastomaGAGATGCTGG (5)2.30.0023
P8 GC+1d cultureAAGGATGTGC (4)17.10.0171
P8 GC+1d cultureAGACCCTGCT (6)11.40.0114
P8 GC+1d cultureGAGATGCTGG (5)80.008
P8 GC+1d cultureGAGATCCTGG (5)6.80.0068
P8 GC+1d cultureCCCTGTGCTG (5)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGCTCTATACA (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureAGACCCTGCT (6)18.70.0187
P8 GC+SHH+1d cultureAAGGATGTGC (4)15.20.0152
P8 GC+SHH+1d cultureGAGATGCTGG (5)70.007
P8 GC+SHH+1d cultureGCTCTATACA (3)5.90.0059
P8 GC+SHH+1d cultureATCTTGCTGC (6)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureGAGATCCTGG (5)3.50.0035
3T3 fibroblastsGAGATGCTGG (5)350.035
3T3 fibroblastsAAGGATGTGC (4)24.50.0245
3T3 fibroblastsAGACCCTGCT (6)10.50.0105
3T3 fibroblastsGAGATCCTGG (5)10.50.0105
E15 cortexAGACCCTGCT (6)34.60.0346
E15 cortexGAGATCCTGG (5)14.80.0148
E15 cortexAAGGATGTGC (4)9.90.0099
E15 cortexGAGATGCTGG (5)4.90.0049
P1 cortexAAGGATGTGC (4)4.50.0045
P1 cortexAGACCCTGCT (6)4.50.0045
P1 cortexGAGATCCTGG (5)4.50.0045
P1 cortexGAGATGCTGG (5)4.50.0045
HypothalamusAAGGATGTGC (4)14.50.0145
HypothalamusAGACCCTGCT (6)7.20.0072
HypothalamusGAGATGGTCT (2)7.20.0072
HypothalamusGAGATGCTGG (5)5.40.0054
HypothalamusGCTCTATACA (3)5.40.0054
HypothalamusGAGATCCTGG (5)3.60.0036
E12.5 retinaAAGGATGTGC (4)9.40.0094
E12.5 retinaAGACCCTGCT (6)7.50.0075
E12.5 retinaGCTCTATACA (3)5.60.0056
E12.5 retinaTTGAATAAAG (6)3.80.0038
E12.5 retinaATCTTGCTGC (6)1.90.0019
E12.5 retinaGAGATCCTGG (5)1.90.0019
E14.5 retinaAGACCCTGCT (6)14.60.0146
E14.5 retinaAAGGATGTGC (4)12.80.0128
E14.5 retinaGCTCTATACA (3)5.50.0055
E14.5 retinaAAGATGCTGG (12)1.80.0018
E14.5 retinaATCTTGCTGC (6)1.80.0018
E14.5 retinaGAGATGCTGG (5)1.80.0018
E16.5 retinaAGACCCTGCT (6)21.70.0217
E16.5 retinaAAGGATGTGC (4)14.50.0145
E16.5 retinaGCTCTATACA (3)5.40.0054
E16.5 retinaGAGATCCTGG (5)3.60.0036
E16.5 retinaACGTGGGTGC (2)1.80.0018
E16.5 retinaGAGATGCTGG (5)1.80.0018
E18.5 retinaAGACCCTGCT (6)16.40.0164
E18.5 retinaAAGGATGTGC (4)7.30.0073
E18.5 retinaGAGATCCTGG (5)7.30.0073
E18.5 retinaGCTCTATACA (3)1.80.0018
E18.5 retinaTTGAATAAAG (6)1.80.0018
P0.5 retinaGAGATGCTGG (5)19.60.0196
P0.5 retinaGAGATCCTGG (5)11.80.0118
P0.5 retinaAAGGATGTGC (4)9.80.0098
P0.5 retinaAAGATGCTGG (12)3.90.0039
P0.5 retinaACGTGGGTGC (2)20.002
P0.5 retinaAGACCCTGCT (6)20.002
P0.5 retinaGCTCTATACA (3)20.002
P2.5 retinaGCTCTATACA (3)14.10.0141
P2.5 retinaAGACCCTGCT (6)10.60.0106
P2.5 retinaAAGGATGTGC (4)3.50.0035
P2.5 retinaACGTGGGTGC (2)1.80.0018
P2.5 retinaCCCTGTGCTG (5)1.80.0018
P2.5 retinaGAGATGTTGG (3)1.80.0018
P4.5 retinaAGACCCTGCT (6)17.80.0178
P4.5 retinaGCTCTATACA (3)5.90.0059
P4.5 retinaAAGGATGTGC (4)40.004
P4.5 retinaAAGATGCTGG (12)20.002
P4.5 retinaGAGATCCTGG (5)20.002
P4.5 retinaGAGATGCTGG (5)20.002
P6.5 retinaAAGGATGTGC (4)11.70.0117
P6.5 retinaAGACCCTGCT (6)8.30.0083
P6.5 retinaGAGATCCTGG (5)50.005
P6.5 retinaGCTCTATACA (3)50.005
P6.5 retinaGAGATGCTGG (5)1.70.0017
P10.5 crx- retinaAAGGATGTGC (4)61.30.0613
P10.5 crx- retinaAGACCCTGCT (6)9.30.0093
P10.5 crx- retinaGAGATGCTGG (5)9.30.0093
P10.5 crx- retinaGAGATGTTGG (3)7.40.0074
P10.5 crx- retinaGAGATCCTGG (5)5.60.0056
P10.5 crx- retinaCCCTGTGCTG (5)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGCTCTATACA (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaAGACCCTGCT (6)19.20.0192
P10.5 crx+ retinaAAGGATGTGC (4)13.50.0135
P10.5 crx+ retinaGCTCTATACA (3)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaGAGATCCTGG (5)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaCCCTGTGCTG (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaGAGATGGTCT (2)1.90.0019
Adult retinalAAGGATGTGC (4)20.40.0204
Adult retinalAGACCCTGCT (6)14.80.0148
Adult retinalGAGATGCTGG (5)5.60.0056
Adult retinalGAGATCCTGG (5)3.70.0037
Adult retinalCCCTGTGCTG (5)1.90.0019
Adult retinalGAGATGTTGG (3)1.90.0019
ONLAAGGATGTGC (4)7.70.0077
ONLAGACCCTGCT (6)5.70.0057
ONLGCTCTATACA (3)5.70.0057
ONLGAGATGCTGG (5)1.90.0019
ONLGAGATGGTCT (2)1.90.0019