Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.333594 5430402M21RikRIKEN cDNA 5430402M21 gene 7    71337 
 Mm.333594 BC057627cDNA sequence BC057627 7    330474 
 Human Homolog C19orf7[chromosome 19 open reading frame 7]
 Clusters 
   Neighbors    

Total 8 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 57 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCTGGTCTCTTA (3)8.20.0082
P8 Cb GCATATGGAATA (6)3.30.0033
P8 Cb GCTCATCTGTAG (3)1.60.0016
Cb medulloblastomaTGGTCTCTTA (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTGGTCTCTTA (3)9.10.0091
P8 GC+1d cultureATATGGAATA (6)4.60.0046
P8 GC+1d cultureAGGGTCTTCG (2)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCAGGCTCACT (3)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGGTCTCAGCC (5)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureTGGTCTCTTA (3)12.90.0129
P8 GC+SHH+1d cultureATATGGAATA (6)4.70.0047
P8 GC+SHH+1d cultureAGGGTCTTCG (2)1.20.0012
3T3 fibroblastsGGTCTCAGCC (5)70.007
3T3 fibroblastsAGGGTCTTCG (2)3.50.0035
E15 cortexGGTCTCAGCC (5)14.80.0148
E15 cortexATATGGAATA (6)4.90.0049
E15 cortexTGGTCTCTTA (3)4.90.0049
P1 cortexTGGTCTCTTA (3)9.10.0091
P1 cortexTCATCTGTAG (3)4.50.0045
HypothalamusATATGGAATA (6)5.40.0054
HypothalamusGGTCTCAGCC (5)5.40.0054
E12.5 retinaTGGTCTCTTA (3)9.40.0094
E12.5 retinaATATGGAATA (6)5.60.0056
E12.5 retinaAGGGTCTTCG (2)1.90.0019
E14.5 retinaATATGGAATA (6)5.50.0055
E14.5 retinaCAGGCTCACT (3)1.80.0018
E14.5 retinaTGGTCTCTTA (3)1.80.0018
E16.5 retinaGGTCTCAGCC (5)5.40.0054
E16.5 retinaATATGGAATA (6)3.60.0036
E16.5 retinaTGGTCTCTTA (3)3.60.0036
E16.5 retinaCAGGCTCACT (3)1.80.0018
E18.5 retinaATATGGAATA (6)9.10.0091
E18.5 retinaTGGTCTCTTA (3)3.60.0036
P0.5 retinaTGGTCTCTTA (3)5.90.0059
P0.5 retinaAGGGTCTTCG (2)20.002
P0.5 retinaATATGGAATA (6)20.002
P2.5 retinaTGGTCTCTTA (3)14.10.0141
P2.5 retinaATATGGAATA (6)10.60.0106
P2.5 retinaAGGGTCTTCG (2)3.50.0035
P4.5 retinaTGGTCTCTTA (3)9.90.0099
P4.5 retinaATATGGAATA (6)40.004
P4.5 retinaGGTCTCAGCC (5)20.002
P6.5 retinaATATGGAATA (6)100.01
P6.5 retinaTGGTCTCTTA (3)100.01
P10.5 crx- retinaATATGGAATA (6)7.40.0074
P10.5 crx- retinaCAGGCTCACT (3)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGGTCTCAGCC (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTGGTCTCTTA (3)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaATATGGAATA (6)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaGGTCTCAGCC (5)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTCATCTGTAG (3)1.90.0019
Adult retinalATATGGAATA (6)3.70.0037
Adult retinalAGGGTCTTCG (2)1.90.0019
Adult retinalGGTCTCAGCC (5)1.90.0019
Adult retinalTGGTCTCTTA (3)1.90.0019
ONLTGGTCTCTTA (3)11.50.0115
ONLATATGGAATA (6)1.90.0019