Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.35801	BC048355	cDNA sequence BC048355	17		381101
Mm.35801	C76683	expressed sequence C76683	17		98052
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 42 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC TGGGTGCTGG (64) 8.2 0.0082 P8 Cb GC CTCCTTCCTT (2) 1.6 0.0016 Cb medulloblastoma TGGGTGCTGG (64) 9.2 0.0092 Cb medulloblastoma CTCCTTCCTT (2) 2.3 0.0023 P8 GC+1d culture TGGGTGCTGG (64) 5.7 0.0057 P8 GC+SHH+1d culture TGGGTGCTGG (64) 3.5 0.0035 P8 GC+SHH+1d culture CTCCTTCCTT (2) 2.3 0.0023 3T3 fibroblasts TGGGTGCTGG (64) 17.5 0.0175 E15 cortex TGGGTGCTGG (64) 14.8 0.0148 P1 cortex TGGGTGCTGG (64) 13.6 0.0136 Hypothalamus TGGGTGCTGG (64) 9.1 0.0091 Hypothalamus TATGTATGTA (15) 5.4 0.0054 Hypothalamus GTGCAAGAGG (3) 1.8 0.0018 E12.5 retina TGGGTGCTGG (64) 9.4 0.0094 E12.5 retina CTCCTTCCTT (2) 5.6 0.0056 E12.5 retina TATGTATGTA (15) 1.9 0.0019 E14.5 retina TGGGTGCTGG (64) 54.7 0.0547 E14.5 retina CTCCTTCCTT (2) 7.3 0.0073 E14.5 retina GTGCAAGAGG (3) 1.8 0.0018 E14.5 retina TATGTATGTA (15) 1.8 0.0018 E16.5 retina TGGGTGCTGG (64) 41.7 0.0417 E16.5 retina CTCCTTCCTT (2) 7.2 0.0072 E16.5 retina GTGCAAGAGG (3) 1.8 0.0018 E16.5 retina TATGTATGTA (15) 1.8 0.0018 E18.5 retina TGGGTGCTGG (64) 20 0.02 E18.5 retina CTCCTTCCTT (2) 3.6 0.0036 E18.5 retina TATGTATGTA (15) 1.8 0.0018 P0.5 retina TGGGTGCTGG (64) 11.8 0.0118 P0.5 retina CTCCTTCCTT (2) 7.9 0.0079 P2.5 retina TGGGTGCTGG (64) 17.6 0.0176 P2.5 retina CTCCTTCCTT (2) 3.5 0.0035 P4.5 retina TGGGTGCTGG (64) 9.9 0.0099 P4.5 retina CTCCTTCCTT (2) 2 0.002 P4.5 retina TATGTATGTA (15) 2 0.002 P6.5 retina TGGGTGCTGG (64) 13.3 0.0133 P10.5 crx- retina TGGGTGCTGG (64) 20.4 0.0204 P10.5 crx+ retina TGGGTGCTGG (64) 15.4 0.0154 P10.5 crx+ retina TATGTATGTA (15) 1.9 0.0019 Adult retinal TGGGTGCTGG (64) 13 0.013 ONL TGGGTGCTGG (64) 40.2 0.0402 ONL GTGCAAGAGG (3) 5.7 0.0057 ONL TATGTATGTA (15) 1.9 0.0019