Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.49752 Rnf157ring finger protein 157 11    217340 
 Mm.49752 X83325EST X83325 11  11 74.0 cM  13927 
 Mm.49752 2610036E23RikRIKEN cDNA 2610036E23 gene 11    69919 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 66 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCTTTAATCT (38)4.90.0049
P8 Cb GCCGCCACCACG (19)3.30.0033
P8 Cb GCGACAGGTTTT (3)1.60.0016
Cb medulloblastomaCGCCACCACG (19)6.90.0069
Cb medulloblastomaATTCTTAAAA (3)2.30.0023
Cb medulloblastomaGACAGGTTTT (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCGCCACCACG (19)2.30.0023
P8 GC+1d cultureATTCTTAAAA (3)1.10.0011
P8 GC+1d cultureCCTTTAATCT (38)1.10.0011
P8 GC+1d cultureGACAGGTTTT (3)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCGCCACCACG (19)9.40.0094
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTTAATCT (38)3.50.0035
P8 GC+SHH+1d cultureATTCTTAAAA (3)2.30.0023
P8 GC+SHH+1d cultureCCCTCACACA (7)1.20.0012
3T3 fibroblastsCCTTTAATCT (38)10.50.0105
3T3 fibroblastsCCCTCACACA (7)3.50.0035
E15 cortexCGCCACCACG (19)9.90.0099
P1 cortexATTCTTAAAA (3)9.10.0091
P1 cortexCCTTTAATCT (38)4.50.0045
P1 cortexCGCCACCACG (19)4.50.0045
HypothalamusCGCCACCACG (19)9.10.0091
HypothalamusGACAGGTTTT (3)3.60.0036
HypothalamusATTCTTAAAA (3)1.80.0018
HypothalamusCCTTTAATCT (38)1.80.0018
E12.5 retinaATTCTTAAAA (3)1.90.0019
E12.5 retinaCCTTTAATCT (38)1.90.0019
E12.5 retinaCGCCACCACG (19)1.90.0019
E14.5 retinaCCTTTAATCT (38)12.80.0128
E14.5 retinaATTCTTAAAA (3)1.80.0018
E14.5 retinaCGCCACCACG (19)1.80.0018
E14.5 retinaGACAGGTTTT (3)1.80.0018
E16.5 retinaCGCCACCACG (19)9.10.0091
E16.5 retinaCCCTCACACA (7)1.80.0018
E16.5 retinaGGAGGAGAGA (9)1.80.0018
E18.5 retinaATTCTTAAAA (3)1.80.0018
E18.5 retinaCGCCACCACG (19)1.80.0018
E18.5 retinaGACAGGTTTT (3)1.80.0018
P0.5 retinaCCTTTAATCT (38)20.002
P0.5 retinaGACAGGTTTT (3)20.002
P2.5 retinaCGCCACCACG (19)8.80.0088
P2.5 retinaCCTTTAATCT (38)3.50.0035
P2.5 retinaATTCTTAAAA (3)1.80.0018
P2.5 retinaGACAGGTTTT (3)1.80.0018
P4.5 retinaATTCTTAAAA (3)9.90.0099
P4.5 retinaCGCCACCACG (19)7.90.0079
P4.5 retinaCCTTTAATCT (38)40.004
P4.5 retinaGACAGGTTTT (3)20.002
P6.5 retinaCCTTTAATCT (38)11.70.0117
P6.5 retinaCGCCACCACG (19)50.005
P6.5 retinaATTCTTAAAA (3)3.30.0033
P6.5 retinaGGAGGAGAGA (9)3.30.0033
P6.5 retinaGACAGGTTTT (3)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCGCCACCACG (19)7.40.0074
P10.5 crx- retinaGACAGGTTTT (3)3.70.0037
P10.5 crx- retinaATTCTTAAAA (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaATTCTTAAAA (3)5.80.0058
P10.5 crx+ retinaCGCCACCACG (19)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaGACAGGTTTT (3)3.80.0038
P10.5 crx+ retinaGGAGGAGAGA (9)1.90.0019
Adult retinalCGCCACCACG (19)24.10.0241
Adult retinalCCTTTAATCT (38)7.40.0074
Adult retinalATTCTTAAAA (3)3.70.0037
ONLCGCCACCACG (19)15.30.0153
ONLATTCTTAAAA (3)11.50.0115
ONLCCTTTAATCT (38)11.50.0115
ONLGACAGGTTTT (3)3.80.0038