Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.9593 Sh2d3cSH2 domain containing 3C 2    27387 
 Mm.9593 6330409D20RikRIKEN cDNA 6330409D20 gene 2    70730 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 38 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCTCTCTTTCA (2)8.20.0082
P8 Cb GCTTTTCTTTCA (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaTACAGCCACA (3)6.90.0069
P8 GC+1d cultureCTCTCTTTCA (2)80.008
P8 GC+1d cultureTTTCAAGCTT (3)2.30.0023
P8 GC+1d cultureTACAGCCACA (3)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTCCTCTGCAC (4)1.10.0011
P8 GC+1d cultureTTTTCTTTCA (4)1.10.0011
P8 GC+SHH+1d cultureCTCTCTTTCA (2)10.50.0105
P8 GC+SHH+1d cultureTACAGCCACA (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTTCAAGCTT (3)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureTTTTCTTTCA (4)1.20.0012
E15 cortexTACAGCCACA (3)4.90.0049
P1 cortexCTCTCTTTCA (2)4.50.0045
P1 cortexTACAGCCACA (3)4.50.0045
HypothalamusCTCTCTTTCA (2)5.40.0054
E12.5 retinaTACAGCCACA (3)3.80.0038
E12.5 retinaAAGAGCTGGA (7)1.90.0019
E12.5 retinaTCCTCTGCAC (4)1.90.0019
E14.5 retinaCTCTCTTTCA (2)3.60.0036
E16.5 retinaCTCTCTTTCA (2)3.60.0036
P0.5 retinaCTCTCTTTCA (2)7.90.0079
P0.5 retinaAAGAGCTGGA (7)20.002
P0.5 retinaTTTCAAGCTT (3)20.002
P2.5 retinaCTCTCTTTCA (2)3.50.0035
P2.5 retinaAAGAGCTGGA (7)1.80.0018
P4.5 retinaTACAGCCACA (3)20.002
P6.5 retinaCTCTCTTTCA (2)1.70.0017
P6.5 retinaTACAGCCACA (3)1.70.0017
P6.5 retinaTTTCAAGCTT (3)1.70.0017
P10.5 crx- retinaCTCTCTTTCA (2)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTTTCAAGCTT (3)3.70.0037
P10.5 crx- retinaTACAGCCACA (3)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaTACAGCCACA (3)3.80.0038
Adult retinalTTTCAAGCTT (3)3.70.0037
Adult retinalTACAGCCACA (3)1.90.0019
ONLCTCTCTTTCA (2)1.90.0019
ONLTACAGCCACA (3)1.90.0019