Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.227176 AI647874expressed sequence AI647874 17    106629 
 Mm.227176 Slc3a1solute carrier family 3, member 1 17  17 51.0 cM  20532 
 Mm.227176 D030028O16RikRIKEN cDNA D030028O16 gene 17    213760 
 Human Homolog KIAA0436[putative prolyl oligopeptidase]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 55 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCACAGAGCT (6)22.80.0228
P8 Cb GCAATGGCATCA (4)1.60.0016
P8 Cb GCGAGTAGACTC (4)1.60.0016
Cb medulloblastomaCATAAAGATT (3)9.20.0092
Cb medulloblastomaCCACAGAGCT (6)9.20.0092
Cb medulloblastomaAATGGCATCA (4)2.30.0023
Cb medulloblastomaGAGTAGACTC (4)2.30.0023
P8 GC+1d cultureCCACAGAGCT (6)43.40.0434
P8 GC+SHH+1d cultureCCACAGAGCT (6)19.90.0199
P8 GC+SHH+1d cultureAATGGCATCA (4)1.20.0012
P8 GC+SHH+1d cultureAGCGAACATT (3)1.20.0012
3T3 fibroblastsCCACAGAGCT (6)10.50.0105
3T3 fibroblastsAATGGCATCA (4)70.007
E15 cortexCCACAGAGCT (6)39.60.0396
E15 cortexAGCGAACATT (3)4.90.0049
P1 cortexCCACAGAGCT (6)18.20.0182
P1 cortexCATAAAGATT (3)9.10.0091
HypothalamusCCACAGAGCT (6)16.30.0163
HypothalamusCATAAAGATT (3)3.60.0036
HypothalamusAGCGAACATT (3)1.80.0018
HypothalamusGAGTAGACTC (4)1.80.0018
HypothalamusTTAACTGAAG (7)1.80.0018
E12.5 retinaCCACAGAGCT (6)16.90.0169
E14.5 retinaCCACAGAGCT (6)310.031
E14.5 retinaAATGGCATCA (4)1.80.0018
E14.5 retinaCATAAAGATT (3)1.80.0018
E14.5 retinaTGTCATCTAA (3)1.80.0018
E16.5 retinaCCACAGAGCT (6)50.70.0507
E16.5 retinaGAGTAGACTC (4)1.80.0018
E16.5 retinaTTAACTGAAG (7)1.80.0018
E18.5 retinaCCACAGAGCT (6)27.30.0273
E18.5 retinaCATAAAGATT (3)1.80.0018
P0.5 retinaCCACAGAGCT (6)29.40.0294
P0.5 retinaCATAAAGATT (3)5.90.0059
P0.5 retinaGAGTAGACTC (4)20.002
P0.5 retinaTGTCATCTAA (3)20.002
P2.5 retinaCCACAGAGCT (6)22.90.0229
P2.5 retinaCATAAAGATT (3)3.50.0035
P4.5 retinaCCACAGAGCT (6)23.80.0238
P4.5 retinaCATAAAGATT (3)40.004
P6.5 retinaCCACAGAGCT (6)28.30.0283
P6.5 retinaCATAAAGATT (3)6.70.0067
P10.5 crx- retinaCCACAGAGCT (6)61.30.0613
P10.5 crx- retinaCATAAAGATT (3)9.30.0093
P10.5 crx- retinaAGCGAACATT (3)1.90.0019
P10.5 crx- retinaGAGTAGACTC (4)1.90.0019
P10.5 crx+ retinaCCACAGAGCT (6)15.40.0154
P10.5 crx+ retinaCATAAAGATT (3)3.80.0038
Adult retinalCCACAGAGCT (6)14.80.0148
Adult retinalCATAAAGATT (3)9.30.0093
ONLCCACAGAGCT (6)7.70.0077
ONLCATAAAGATT (3)5.70.0057
ONLAATGGCATCA (4)1.90.0019
ONLTGTCATCTAA (3)1.90.0019
ONLTTAACTGAAG (7)1.90.0019