Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.10331	Tnfaip1	tumor necrosis factor, alpha-induced protein 1 (endothelial)	11	11 45.1 cM	21927
Gene Ontology	membrane | potassium ion transport | protein binding | voltage-gated potassium channel activity | voltage-gated potassium channel complex
Human Homolog	TNFAIP1[tumor necrosis factor, alpha-induced protein 1 (endothelial)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 77 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAAAAAGAAA GAGGGTAAAG (3) GGCTGAGGAA (2) TGACTGGTTG TTCTAGGCTA TTTAATGTTT (2) TTTTATGTTT (2) 192.4 0.1924 Cb medulloblastoma AAAAAAGAAA GAGGGTAAAG (3) TGACTGGTTG TTTTATGTTT (2) 41.6 0.0416 P8 GC+1d culture AAAAAAGAAA TGACTGGTTG TTCTAGGCTA TTTTATGTTT (2) 167.8 0.1678 P8 GC+SHH+1d culture AAAAAAGAAA TATGTTTTTT (3) TGACTGGTTG TTTCCAGTGA TTTTATGTTT (2) 159.3 0.1593 3T3 fibroblasts TGACTGGTTG TTTTATGTTT (2) 56.1 0.0561 E15 cortex TATGTTTTTT (3) TTCTAGGCTA TTTCCAGTGA TTTTATGTTT (2) 19.6 0.0196 P1 cortex TTCTAGGCTA TTTTATGTTT (2) 100 0.1 Hypothalamus TTTTATGTTT (2) 65.2 0.0652 E12.5 retina TATGTTTTTT (3) TCTTATGTTT TTTTATGTTT (2) 219.7 0.2197 E14.5 retina GGCTGAGGAA (2) TTTCCAGTGA TTTTATGTTT (2) 386.2 0.3862 E16.5 retina GAGGGTAAAG (3) GGCTGAGGAA (2) TATGTTTTTT (3) TGACTGGTTG TTTCCAGTGA TTTTATGTTT (2) 503.4 0.5034 E18.5 retina TTTTATGTTT (2) 247.4 0.2474 P0.5 retina TGACTGGTTG TTTTATGTTT (2) 100.1 0.1001 P2.5 retina AAAAAAGAAA GAGGGTAAAG (3) TATGTTTTTT (3) TCTTATGTTT TGACTGGTTG TTTTATGTTT (2) 172.6 0.1726 P4.5 retina AAAAAAGAAA TATGTTTTTT (3) TGACTGGTTG TTTTATGTTT (2) 105.1 0.1051 P6.5 retina AAAAAAGAAA TGACTGGTTG TTTCCAGTGA TTTTATGTTT (2) 95.1 0.0951 P10.5 crx- retina AAAAAAGAAA GAGGGTAAAG (3) TATGTTTTTT (3) TGACTGGTTG TTTCCAGTGA TTTTATGTTT (2) 252.9 0.2529 P10.5 crx+ retina GGCTGAGGAA (2) TATGTTTTTT (3) TCTTATGTTT TGACTGGTTG TTCTAGGCTA TTTTATGTTT (2) 53.7 0.0537 Adult retinal TATGTTTTTT (3) TGACTGGTTG TTTTATGTTT (2) 14.9 0.0149 ONL AAAAAAGAAA TGACTGGTTG TTTAATGTTT (2) TTTTATGTTT (2) 63.2 0.0632