Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.130362 Top2btopoisomerase (DNA) II beta 14    21974 
 Mm.130362 D230016L12RikRIKEN cDNA D230016L12 gene 14    319393 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 90 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACATTTCAAT (2)
ATTGCAGACT (2)
GCCAAGTCCA (3)
58.70.0587
Cb medulloblastomaACATTTCAAT (2)
ACTAAAAAAA
ACTGTAAAAA
ATTGCAGACT (2)
TAAATAAAGG (3)
300.03
P8 GC+1d cultureACATTTCAAT (2)
ACTAAAAAAA
ATGACAGTTC (2)
ATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
GCCAAGTCCA (3)
TGCTGTCTGA
55.70.0557
P8 GC+SHH+1d cultureACATTTCAAT (2)
ATGACAGTTC (2)
ATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
GCCAAGTCCA (3)
TAAATAAAGG (3)
36.30.0363
3T3 fibroblastsATTGCAGACT (2)
TGCTGTCTGA
70.007
E15 cortexATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
GCCAAGTCCA (3)
29.60.0296
P1 cortexACATTTCAAT (2)
ATTGCAGACT (2)
TGCTGTCTGA
22.60.0226
HypothalamusACATTTCAAT (2)
ACTAAAAAAA
ATGACAGTTC (2)
GCCAAGTCCA (3)
TTAATGCTGG (2)
30.70.0307
E12.5 retinaACATTTCAAT (2)
ATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
GCCAAGTCCA (3)
TAAATAAAGG (3)
26.30.0263
E14.5 retinaACATTTCAAT (2)
ATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
TAAATAAAGG (3)
21.70.0217
E16.5 retinaACATTTCAAT (2)
ACTAAAAAAA
ATTGCAGACT (2)
GCCAAGTCCA (3)
TAAATAAAGG (3)
30.70.0307
E18.5 retinaACATTTCAAT (2)
ACTAAAAAAA
ACTGTAAAAA
ATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
49.10.0491
P0.5 retinaACATTTCAAT (2)
ACTAAAAAAA
ATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
35.40.0354
P2.5 retinaACATTTCAAT (2)
ATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
GCCAAGTCCA (3)
TAAATAAAGG (3)
42.30.0423
P4.5 retinaACATTTCAAT (2)
ATTGCAGACT (2)
TAAATAAAGG (3)
45.60.0456
P6.5 retinaACATTTCAAT (2)
ATGACAGTTC (2)
ATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
TAAATAAAGG (3)
TGCTGTCTGA
400.04
P10.5 crx- retinaACATTTCAAT (2)
ACTGTAAAAA
ATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
50.20.0502
P10.5 crx+ retinaACATTTCAAT (2)
ATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
TAAATAAAGG (3)
61.50.0615
Adult retinalACATTTCAAT (2)
ATGACAGTTC (2)
ATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
TAAATAAAGG (3)
TGCTGTCTGA
26.10.0261
ONLACATTTCAAT (2)
ATTGCAGACT (2)
GAGTCTCCTG (3)
TAAATAAAGG (3)
TGCTGTCTGA
49.80.0498