Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.137746	Ube3c	ubiquitin protein ligase E3C	5		100763
Gene Ontology	intracellular | ligase activity | protein modification | ubiquitin cycle | ubiquitin-protein ligase activity
Human Homolog	UBE3C[ubiquitin protein ligase E3C]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 61 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC GAGCTGGTGA (2) GTGTGTGGGG (2) GTTTTCCCCT (2) TGTGATGTTA (2) 9.7 0.0097 Cb medulloblastoma CTTATTTTAA GAGCTGGTGA (2) GCTTAAAAAA GTTTTCCCCT (2) 11.5 0.0115 P8 GC+1d culture GAGCTGGTGA (2) GCTGTGTGGG (2) GTTTTCCCCT (2) TGTGATGTTA (2) 24 0.024 P8 GC+SHH+1d culture CTTATTTTAA GAGCTGGTGA (2) GCTGTGTGGG (2) GTTTTCCCCT (2) TGTGATGTTA (2) 15.2 0.0152 3T3 fibroblasts TGTGATGTTA (2) 3.5 0.0035 E15 cortex GAGCTGGTGA (2) GTTTTCCCCT (2) 9.8 0.0098 P1 cortex GTGTGTGGGG (2) GTTTTCCCCT (2) TGTGATGTTA (2) 22.6 0.0226 Hypothalamus GAGCTGGTGA (2) GTTTTCCCCT (2) 9 0.009 E12.5 retina GAGCTGGTGA (2) 9.4 0.0094 E14.5 retina GAGCTGGTGA (2) GTGTGTGGGG (2) TGTTTTGCAA (2) 7.2 0.0072 E16.5 retina GAGCTGGTGA (2) GCTGTGTGGG (2) 7.2 0.0072 E18.5 retina GAGCTGGTGA (2) GCTGTGTGGG (2) GCTTAAAAAA TGTGATGTTA (2) 7.2 0.0072 P0.5 retina GAGCTGGTGA (2) TGTGATGTTA (2) 5.9 0.0059 P2.5 retina GAGCTGGTGA (2) GCTGTGTGGG (2) GTGTGTGGGG (2) 10.6 0.0106 P4.5 retina CTTATTTTAA GAGCTGGTGA (2) GCTGTGTGGG (2) GCTTAAAAAA TGTGATGTTA (2) 17.8 0.0178 P6.5 retina GAGCTGGTGA (2) GCTGTGTGGG (2) GCTTAAAAAA TGTGATGTTA (2) 21.7 0.0217 P10.5 crx- retina GAGCTGGTGA (2) GCTGTGTGGG (2) GTTTTCCCCT (2) TGTGATGTTA (2) 24.2 0.0242 P10.5 crx+ retina CTTATTTTAA GAGCTGGTGA (2) TGTGATGTTA (2) 7.6 0.0076 Adult retinal GCTGTGTGGG (2) TGTGATGTTA (2) TGTTTTGCAA (2) 7.5 0.0075 ONL GAGCTGGTGA (2) TGTGATGTTA (2) 9.6 0.0096