Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.147091	C230011H18Rik	RIKEN cDNA C230011H18 gene	2		399590
Mm.147091	D230046B21Rik	RIKEN cDNA D230046B21 gene	2		320325
Mm.147091	6430543K15Rik	RIKEN cDNA 6430543K15 gene	2		320349
Mm.147091	B230345P09Rik	RIKEN cDNA B230345P09 gene	2		319536
Mm.147091	Cugbp2	CUG triplet repeat,RNA binding protein 2	2		14007
Gene Ontology	mRNA splice site selection | nucleus | pre-mRNA splicing factor activity
Human Homolog	CUGBP2[CUG triplet repeat, RNA binding protein 2]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 191 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAACCCTTAT (5) ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) ATTGGTGTTA (5) CAAGACTGAA (5) CCTACAGTCC (5) CGTCTGAGAA (6) GAATTTTATT (4) GATTGTCTAA (5) GTATTTTATT (6) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) 166.4 0.1664 Cb medulloblastoma ACATTTAAAA (3) CTTTTCCCTC GAATTTTATT (4) GTATTTTATT (6) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) 140.9 0.1409 P8 GC+1d culture AAACCCTTAT (5) ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) CAAGACTGAA (5) CCTACAGTCC (5) GAATTTTATT (4) GATTGTCTAA (5) GTATTTTATT (6) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) TTTCATTGTT (6) 114.1 0.1141 P8 GC+SHH+1d culture AAACCCTTAT (5) ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) CCTACAGTCC (5) GAATTTTATT (4) GAGGGTGTGT (5) GATTGTCTAA (5) GTATTTTATT (6) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) TTTCATTGTT (6) 155.7 0.1557 3T3 fibroblasts TGGTTGCTGG 220.8 0.2208 E15 cortex AACTTTTTTT ACATTTAAAA (3) CCTACAGTCC (5) GAATTTTATT (4) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) 336.3 0.3363 P1 cortex AAACCCTTAT (5) AACTTTTTTT ATTGGTGTTA (5) CGTCTGAGAA (6) GATTGTCTAA (5) TGGTTGCTGG TTTCATTGTT (6) 118 0.118 Hypothalamus AACTTTTTTT ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) CAAGACTGAA (5) CCTACAGTCC (5) CTTTTCCCTC GAATTTTATT (4) GATTGTCTAA (5) GTATGCCCTC (2) GTATTTTATT (6) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) 382 0.382 E12.5 retina AAACCCTTAT (5) ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) CAAGACTGAA (5) CTTTTCCCTC GAATTTTATT (4) GATTGTCTAA (5) GTATTTTATT (6) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) 201 0.201 E14.5 retina ACATTTAAAA (3) CCTACAGTCC (5) GAATTTTATT (4) GATTGTCTAA (5) GTATTTTATT (6) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) TTTCATTGTT (6) 980.2 0.9802 E16.5 retina AAACCCTTAT (5) ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) ATTGGTGTTA (5) CTTTTCCCTC GAATTTTATT (4) GTATGCCCTC (2) GTATTTTATT (6) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) 811.2 0.8112 E18.5 retina ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) CCTACAGTCC (5) CGTCTGAGAA (6) GAATTTTATT (4) GTATTTTATT (6) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG 309.1 0.3091 P0.5 retina AAACCCTTAT (5) CAAGACTGAA (5) CCTACAGTCC (5) GAATTTTATT (4) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) TTTCATTGTT (6) 218 0.218 P2.5 retina AAACCCTTAT (5) ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) ATTGGTGTTA (5) CAAGACTGAA (5) CATACACTGT CTTTTCCCTC GAATTTTATT (4) GTATTTTATT (6) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) 216.5 0.2165 P4.5 retina ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) ATTGGTGTTA (5) CAAGACTGAA (5) CGTCTGAGAA (6) CTTTTCCCTC GAATTTTATT (4) GATTGTCTAA (5) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) TTTCATTGTT (6) 200.4 0.2004 P6.5 retina AAACCCTTAT (5) ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) CATACACTGT CCTACAGTCC (5) CGTCTGAGAA (6) CTTTTCCCTC GAATTTTATT (4) GTATTTTATT (6) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) 201.7 0.2017 P10.5 crx- retina ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) CAAGACTGAA (5) CTTTTCCCTC GAATTTTATT (4) GAGGGTGTGT (5) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) 306.7 0.3067 P10.5 crx+ retina ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) CAAGACTGAA (5) CTTTTCCCTC GAATTTTATT (4) GATTGTCTAA (5) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) 130.6 0.1306 Adult retinal ACATTTATTG (5) CCTACAGTCC (5) CTTTTCCCTC GATTGTCTAA (5) GTATGCCCTC (2) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) TTTCATTGTT (6) 233.6 0.2336 ONL AAACCCTTAT (5) ACATTTAAAA (3) ACATTTATTG (5) CGTCTGAGAA (6) GAATTTTATT (4) GAGGGTGTGT (5) GTATGCCCTC (2) TGAGAGAAAA (5) TGGTTGCTGG TTGGTGCTTC (7) 421.2 0.4212