Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.147946	Mybbp1a	MYB binding protein (P160) 1a	11	11 40.0 cM	18432
Gene Ontology	electron transport | negative regulation of transcription | protein binding | transcriptional repressor activity
Human Homolog	MYBBP1A[MYB binding protein (P160) 1a]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 109 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AGGATGCTAG ATGCTAAAAA GATTGTTTAT GCGGAGATGA (2) GTCACACCAC 60.3 0.0603 Cb medulloblastoma ATGCTAAAAA ATGCTATATG CTGGAGGTGA GTCACACCAC 9.2 0.0092 P8 GC+1d culture AATGGCCCTT ATGCTAAAAA ATGCTATATG CTGCAGCTGC (2) GTCACACCAC 28.4 0.0284 P8 GC+SHH+1d culture AATGGCCCTT ATGCTAAAAA ATGCTATATG CCTGCTCTGA (3) CCTGCTGCCA CTGGAGGTGA GTCACACCAC 41.1 0.0411 3T3 fibroblasts CCTGCTCTGA (3) CCTGCTGCCA GCGGAGATGA (2) GTCACACCAC 49 0.049 E15 cortex ATGCTAAAAA CACTGGCCCT CCTGCTGCCA GTCACACCAC 34.5 0.0345 P1 cortex AATGGCCCTT ATGCTAAAAA CACTGGCCCT GTCACACCAC 68.1 0.0681 Hypothalamus ATGCTAAAAA CTGCAGCTGC (2) GGTTGGGGGG 12.7 0.0127 E12.5 retina AATGGCCCTT ATGCTAAAAA CAGCTGTGAG CCTGCTCTGA (3) CCTGCTGCCA CTGCAGCTGC (2) GCGGAGATGA (2) GTCACACCAC 86.4 0.0864 E14.5 retina ATGCTAAAAA ATGCTATATG CTGCAGCTGC (2) GATTGTTTAT GTCACACCAC TCACCACCAC 25.5 0.0255 E16.5 retina AGGATGCTAG ATGCTAAAAA ATGCTATATG CAGCTGTGAG CCTGCTCTGA (3) CCTGCTGCCA GTCACACCAC 23.5 0.0235 E18.5 retina ATGCTAAAAA GTCACACCAC TTAAACAAAA 41.9 0.0419 P0.5 retina ATGCTAAAAA GATTGTTTAT GCGGAGATGA (2) GTCACACCAC 35.4 0.0354 P2.5 retina AATGGCCCTT ATGCTAAAAA CACTGGCCCT CCTCCAAAAC CCTGCTGCCA GGTTGGGGGG GTCACACCAC 38.8 0.0388 P4.5 retina ATGCTAAAAA ATGCTATATG CAGCTGTGAG CCTCCAAAAC CCTGCTCTGA (3) CTGGAGGTGA GATTGTTTAT GTCACACCAC 29.8 0.0298 P6.5 retina AATGGCCCTT ATGCTAAAAA ATGCTATATG CCCTGATGCT CCTGCTCTGA (3) GTCACACCAC TCACCACCAC 20.1 0.0201 P10.5 crx- retina AATGGCCCTT AGGATGCTAG ATGCTAAAAA ATGCTATATG CCCTGATGCT CCTCCAAAAC CCTGCTCTGA (3) GTCACACCAC TCACCACCAC 18.9 0.0189 P10.5 crx+ retina AATGGCCCTT ATGCTAAAAA GCGGAGATGA (2) GTCACACCAC 34.5 0.0345 Adult retinal AATGGCCCTT CCCTGATGCT CCTCCAAAAC CCTGCTCTGA (3) CCTGCTGCCA CTGGAGGTGA 16.8 0.0168 ONL ATGCTAAAAA CCTGCTCTGA (3) CCTGCTGCCA GTCACACCAC 11.4 0.0114