| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | TTGGTTAAAA (2)
| 3.3 | 0.0033 |
| Cb medulloblastoma | GGGTGCTTTG (3) TTGGTTAAAA (2)
| 4.6 | 0.0046 |
| P8 GC+1d culture | TTCATTTGGG (5) TTGGTTAAAA (2)
| 2.2 | 0.0022 |
| P8 GC+SHH+1d culture | GGGTGCTTTG (3) TGGGTTTAAA (4) TTGGTTAAAA (2) TTGGTTTAAA (3)
| 5.9 | 0.0059 |
| 3T3 fibroblasts | GTGTTTGAGG (4)
| 3.5 | 0.0035 |
| P1 cortex | TTCATTTGGG (5) TTGGTTAAAA (2)
| 9 | 0.009 |
| Hypothalamus | TTGGTTAAAA (2) TTGGTTTAAA (3)
| 3.6 | 0.0036 |
| E12.5 retina | GTGTTTGAGG (4) TGGGTTTAAA (4) TTCATTTGGG (5)
| 5.7 | 0.0057 |
| E14.5 retina | TTGGTTAAAA (2)
| 5.5 | 0.0055 |
| E16.5 retina | TTCATTTGGG (5) TTGGTTAAAA (2) TTGGTTTAAA (3)
| 5.4 | 0.0054 |
| E18.5 retina | GGGTGCTTTG (3) GTGTTTGAGG (4) TTGGTTTAAA (3)
| 5.4 | 0.0054 |
| P2.5 retina | GTGTTTGAGG (4) TTGGTTAAAA (2)
| 3.6 | 0.0036 |
| P4.5 retina | TTCATTTGGG (5) TTGGTTAAAA (2)
| 4 | 0.004 |
| P6.5 retina | TTCATTTGGG (5) TTGGTTAAAA (2)
| 6.6 | 0.0066 |
| P10.5 crx- retina | TGGGTTTAAA (4) TTCATTTGGG (5) TTGGTTAAAA (2)
| 5.7 | 0.0057 |
| ONL | TTCATTTGGG (5) TTGGTTAAAA (2)
| 3.8 | 0.0038 |