Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.154087	2810411E12Rik	RIKEN cDNA 2810411E12 gene	7		117173
Mm.154087	Mtap6	microtubule-associated protein 6	7		17760
Gene Ontology	cytoskeletal regulatory protein binding | microtubule associated complex | microtubule-based process
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 78 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) CCCAAGGACA (3) GATCGCAGAA (2) GATGGTGACT (2) TAGTGCTCCC (2) 44 0.044 Cb medulloblastoma AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) 23.2 0.0232 P8 GC+1d culture AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) GATGGTGACT (2) TAGTGCTCCC (2) TATAGCCAAT (2) 89 0.089 P8 GC+SHH+1d culture AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) CCCAAGGACA (3) GATGGTGACT (2) TAGTGCTCCC (2) TATAGCCAAT (2) 52.7 0.0527 3T3 fibroblasts CCCAAGGACA (3) 7 0.007 E15 cortex AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) GATCGCAGAA (2) 39.5 0.0395 P1 cortex AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) TAGTGCTCCC (2) 54.5 0.0545 Hypothalamus AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) 32.6 0.0326 E12.5 retina AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) CCCAAGGACA (3) GATGGTGACT (2) TAGTGCTCCC (2) TATAGCCAAT (2) 18.9 0.0189 E14.5 retina AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) CCCAAGGACA (3) TAGTGCTCCC (2) 20 0.02 E16.5 retina AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) GATGGTGACT (2) TAGTGCTCCC (2) TATAGCCAAT (2) 45.2 0.0452 E18.5 retina AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) CCCAAGGACA (3) GATGGTGACT (2) TAGTGCTCCC (2) TATAGCCAAT (2) 21.7 0.0217 P0.5 retina AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) GATCGCAGAA (2) TATAGCCAAT (2) 29.5 0.0295 P2.5 retina AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) CCCAAGGACA (3) GATCGCAGAA (2) TAGTGCTCCC (2) TATAGCCAAT (2) 31.7 0.0317 P4.5 retina AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) CCCAAGGACA (3) GATGGTGACT (2) TAGTGCTCCC (2) 31.6 0.0316 P6.5 retina AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) TAGTGCTCCC (2) TATAGCCAAT (2) 35 0.035 P10.5 crx- retina AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) TATAGCCAAT (2) 87.3 0.0873 P10.5 crx+ retina AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) TATAGCCAAT (2) 38.4 0.0384 Adult retinal AAACTGTGCT (2) AGTGGGGGTG (3) CCCAAGGACA (3) 33.4 0.0334 ONL AGTGGGGGTG (3) 1.9 0.0019