Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.154378 C130036L24RikRIKEN cDNA C130036L24 gene 1    319336 
 Mm.154378 Nclnucleolin 1  1 48.4 cM  17975 
 Gene Ontology DNA binding | nucleolus | nucleus | RNA binding
 Human Homolog NCL[nucleolin]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 136 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCATCTTGCTGC (3)
ATGAGGAAGA (4)
CCTTTAACCC (2)
GAAACAGAAA
GAAGATGGAG (4)
GATCAGTGCT (2)
GCAAACCTAA (3)
GCCTCTTGGG (3)
GCTCCTCCTC
GGAGGCTAAA (2)
GTGAAGCTCG (2)
27.80.0278
Cb medulloblastomaGAAGATGATG (2)
GAGATCAGAT (2)
GCAAACCTAA (3)
GTGAAGCTCG (2)
TGGGTTCTGG (3)
16.10.0161
P8 GC+1d cultureCAACACGTTG
GAAGATGGAG (4)
GCAAACCTAA (3)
GCCTCCTTGG (3)
GCCTCTTGGG (3)
GCTCCTCCTC
TGGGTTCTGG (3)
28.50.0285
P8 GC+SHH+1d cultureATCTTGCTGC (3)
CCTTTAACCC (2)
GAAGATGGAG (4)
GAGATCAGAT (2)
GCAAACCTAA (3)
GCCTCTTGGG (3)
GCTCCTCCTC
GGAGGCTAAA (2)
GGCGGCGATG (2)
GTGAAGCTCG (2)
GTGGCGGATT (2)
35.30.0353
3T3 fibroblastsCCTTTAACCC (2)
GAAGATGGAG (4)
GCCTCTTGGG (3)
GTGAAGCTCG (2)
GTGGCGGATT (2)
420.042
E15 cortexCCTTTAACCC (2)
GAAGATGATG (2)
GAAGATGGAG (4)
GCTCCTCCTC
GTGAAGCTCG (2)
TGGGTTCTGG (3)
34.40.0344
P1 cortexCCTTTAACCC (2)
GAAGATGGAG (4)
GCCTCCTTGG (3)
13.50.0135
HypothalamusATGAGGAAGA (4)
GAAGATGGAG (4)
GCCTCTTGGG (3)
90.009
E12.5 retinaATCTTGCTGC (3)
GAAACAGAAA
GAAGATGGAG (4)
GCCTCTTGGG (3)
GCTCCTCCTC
GGAGGCTAAA (2)
TGGGTTCTGG (3)
35.80.0358
E14.5 retinaATCTTGCTGC (3)
CCTTTAACCC (2)
GAAACAGAAA
GAAGATGGAG (4)
GAGATCAGAT (2)
GCAAACCTAA (3)
GCTCCTCCTC
GGCGGCGATG (2)
TGGGTTCTGG (3)
23.50.0235
E16.5 retinaCAACACGTTG
GAAGATGATG (2)
GAAGATGGAG (4)
GAGATCAGAT (2)
GATCAGTGCT (2)
GCTCCTCCTC
TGGGTTCTGG (3)
14.40.0144
E18.5 retinaGAAACAGAAA
GAAGATGGAG (4)
GCCTCTTGGG (3)
GCTCCTCCTC
GTGGCGGATT (2)
TGGGTTCTGG (3)
23.70.0237
P0.5 retinaCAACACGTTG
GAAGATGGAG (4)
GCCTCTTGGG (3)
GCTCCTCCTC
GGAGGCTAAA (2)
GGCGGCGATG (2)
GTGAAGCTCG (2)
29.70.0297
P2.5 retinaCAACACGTTG
GAAGATGGAG (4)
GCCTCCTTGG (3)
GCCTCTTGGG (3)
GCTCCTCCTC
GTGAAGCTCG (2)
GTGGCGGATT (2)
TGGGTTCTGG (3)
40.60.0406
P4.5 retinaCCTTTAACCC (2)
GAAGATGGAG (4)
GCCTCTTGGG (3)
GCTCCTCCTC
GGAGGCTAAA (2)
TGGGTTCTGG (3)
21.90.0219
P6.5 retinaCAACACGTTG
CCTTTAACCC (2)
GAAACAGAAA
GAAGATGGAG (4)
GCCTCCTTGG (3)
GCCTCTTGGG (3)
150.015
P10.5 crx- retinaGCCTCTTGGG (3)
GCTCCTCCTC
GGCGGCGATG (2)
GTGAAGCTCG (2)
TGGGTTCTGG (3)
11.30.0113
P10.5 crx+ retinaGAAGATGGAG (4)
GCAAACCTAA (3)
GCCTCCTTGG (3)
GCCTCTTGGG (3)
GTGAAGCTCG (2)
TGGGTTCTGG (3)
13.30.0133
Adult retinalCAACACGTTG
CCTTTAACCC (2)
GAAACAGAAA
GAAGATGGAG (4)
GCAAACCTAA (3)
GCCTCTTGGG (3)
GCTCCTCCTC
GGCGGCGATG (2)
GTGAAGCTCG (2)
TGGGTTCTGG (3)
29.90.0299
ONLCAACACGTTG
CCTTTAACCC (2)
GAAACAGAAA
GAAGATGGAG (4)
GCCTCCTTGG (3)
GCCTCTTGGG (3)
GGCGGCGATG (2)
TGGGTTCTGG (3)
43.90.0439