Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.155896	Hnrpa2b1	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1	6	6 B3	53379
Gene Ontology	nucleus | ribonucleoprotein complex | RNA binding | RNA processing | viral nucleocapsid
Human Homolog	HNRPA2B1[heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A2/B1]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 249 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATCCTGGCTA CATAAATATG GAAGTGGAAG (4) GACAAGTATA (2) GCTGCAAGGC GGAAGGTGTC GGAATAAAGA (4) GGCTCCTGGT (2) GGTCCTTTTC GTAAGTAGGA GTGTAATAAG TGAAACCTTT (2) TGACTGTGAA TTAATAAAAG (2) 189 0.189 Cb medulloblastoma ATCCTGTGGA (2) CATAAATGTG (4) GGAATAAAGA (4) GTGTAATAAG GTGTGATAAG TGACTGTGAA TTAATAAAAG (2) 78.5 0.0785 P8 GC+1d culture ACTGAGATAA ATCCTGTGGA (2) CATAAATATG GACAAGTATA (2) GAGTGTTTTA (2) GGAAGGTGTC GGAATAAAGA (4) GGAGGACCAT GTAAGTAGGA GTGTAATAAG TTAATAAAAG (2) TTCCTGCTAC (3) 176.7 0.1767 P8 GC+SHH+1d culture ACTGAGATAA ATCCTGGCTA ATCCTGTGGA (2) CATAAATATG GAAGTGGAAG (4) GACAAGTATA (2) GAGTGTTTTA (2) GGAATAAAGA (4) GGAGGACCAT GGCTTCACTG (2) GGTCCTTTTC GTAAGTAGGA GTGTAATAAG TGACTGTGAA TTAATAAAAG (2) TTCCTGCTAC (3) 240.2 0.2402 3T3 fibroblasts ATCCTGGCTA GAAGTGGAAG (4) GCGAGGCCGT (2) GCTGCAAGGC GGAAGGTGTC GTAAGTAGGA GTGTAATAAG TTAATAAAAG (2) 49 0.049 E15 cortex AGTCTGGGGC (3) ATAAACTTCT (2) ATCCTGGCTA ATCCTGTGGA (2) CATAAATATG GGAATAAAGA (4) GTGTAATAAG 49.2 0.0492 P1 cortex ATCCTGTGGA (2) CATAAATATG GACAAGTATA (2) GGAATAAAGA (4) GGAGGTGTCT GGCTCCTGGT (2) GTGTAATAAG TGACTGTGAA TTAATAAAAG (2) 81.6 0.0816 Hypothalamus ATAAACTTCT (2) ATCCTGTGGA (2) CATAAAATAT (2) GAAGTGGAAG (4) GAGCTTGTTT (2) GGAATAAAGA (4) GTGTAATAAG TTAATAAAAG (2) TTATCTTTCC (2) TTCCTGCTAC (3) 105 0.105 E12.5 retina ACTGAGATAA ATAAACTTCT (2) ATCCTGTGGA (2) GAAGTGGAAG (4) GACAAGTATA (2) GAGCTTGTTT (2) GATGAGAAAG (2) GGAAGGTGTC GGTCCTTTTC GTAAGTAGGA GTGTAATAAG GTTCATATCA TGAAACCTTT (2) TTAATAAAAG (2) TTATCTTTCC (2) TTCCTGCTAC (3) TTTGTCCACA 180.5 0.1805 E14.5 retina ACTGAGATAA AGTCTGGGGC (3) ATCCTGGCTA ATCCTGTGGA (2) CATAAATATG CATAAATGTG (4) GACAAGTATA (2) GCTGCAAGGC GGAATAAAGA (4) GGAGGACCAT GGCTTCACTG (2) GGGTAATAAG GTAAGTAGGA GTGTAATAAG TGAAACCTTT (2) TGACTGTGAA TTAATAAAAG (2) TTCCTGCTAC (3) 191.1 0.1911 E16.5 retina ACTGAGATAA AGTCTGGGGC (3) ATAAACTTCT (2) ATCCTGGCTA ATCCTGTGGA (2) CATAAATATG GACAAGTATA (2) GCGAGGCCGT (2) GGAATAAAGA (4) GGAGGACCAT GGCTTCACTG (2) GGGTAATAAG GTAAGTAGGA GTGTAATAAG TGAAACCTTT (2) TTAATAAAAG (2) TTCCTGCTAC (3) TTTGTCCACA 193.6 0.1936 E18.5 retina ACTGAGATAA ATCCTGGCTA CATAAATATG GAAGTGGAAG (4) GACAAGTATA (2) GGAGGTGTCT GGCTCCTGGT (2) GGGTAATAAG GTAAGTAGGA GTGTAATAAG GTTCATATCA TGACTGTGAA TTAATAAAAG (2) TTATCTTTCC (2) 196.2 0.1962 P0.5 retina ACTGAGATAA ATAAACTTCT (2) ATCCTGGCTA CATAAAATAT (2) GAAGTGGAAG (4) GACAAGTATA (2) GGAGGTGTCT GTAAGTAGGA GTGTAATAAG GTGTGATAAG TGAAACCTTT (2) TTAATAAAAG (2) TTCCTGCTAC (3) 118 0.118 P2.5 retina ATAAACTTCT (2) ATCCTGGCTA CATAAAATAT (2) GAAGTGGAAG (4) GACAAGTATA (2) GGAATAAAGA (4) GGCTCCTGGT (2) GTAAGTAGGA GTGTAATAAA GTGTAATAAG GTGTGATAAG GTTCATATCA TTAATAAAAG (2) TTATCTTTCC (2) TTCCTGCTAC (3) TTTGTCCACA 164 0.164 P4.5 retina ACTGAGATAA ATAAACTTCT (2) CATAAATGTG (4) GACAAGTATA (2) GGAATAAAGA (4) GGCTCCTGGT (2) GGCTTCACTG (2) GTGTAATAAA GTGTAATAAG GTGTGATAAG TGACTGTGAA TTAATAAAAG (2) TTCCTGCTAC (3) 206.3 0.2063 P6.5 retina ACTGAGATAA ATCCTGGCTA ATCCTGTGGA (2) CATAAATATG GAAGTGGAAG (4) GACAAGTATA (2) GATGAGAAAG (2) GCGAGGCCGT (2) GGAATAAAGA (4) GGCTCCTGGT (2) GGGTAATAAG GTGTAATAAG TTAATAAAAG (2) TTATCTTTCC (2) TTCCTGCTAC (3) 143.5 0.1435 P10.5 crx- retina ATAAACTTCT (2) ATCCTGGCTA CATAAAATAT (2) CATAAATATG GAAGTGGAAG (4) GACAAGTATA (2) GGAAGGTGTC GGAATAAAGA (4) GGGTAATAAG GTGTAATAAG TGAAACCTTT (2) TTAATAAAAG (2) TTATCTTTCC (2) TTCCTGCTAC (3) 97 0.097 P10.5 crx+ retina ACTGAGATAA ATAAACTTCT (2) ATCCTGGCTA GAAGTGGAAG (4) GACAAGTATA (2) GGAATAAAGA (4) GTAAGTAGGA GTGTAATAAG TTAATAAAAG (2) TTCCTGCTAC (3) TTTGTCCACA 103.5 0.1035 Adult retinal ATAAACTTCT (2) ATCCTGGCTA CATAAATATG GAAGTGGAAG (4) GACAAGTATA (2) GATGAGAAAG (2) GGAATAAAGA (4) GTGTAATAAG TTAATAAAAG (2) 77.9 0.0779 ONL CATAAAATAT (2) GAAGTGGAAG (4) GACAAGTATA (2) GATGAGAAAG (2) GGAATAAAGA (4) GTGTAATAAG TTAATAAAAG (2) TTTGTCCACA 120.6 0.1206