Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.1635	Pias3	protein inhibitor of activated STAT 3	3	3 F2.1	229615
Mm.1635	C230057H02Rik	RIKEN cDNA C230057H02 gene	3		320575
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

Total 18 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge

SAGE Tags

Total 74 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CCTTTAATCC (3) GAGGACCCCT (3) GATACCTGCT (2) TTCCATCCTT (3) 71.8 0.0718 Cb medulloblastoma CCTTTAATCC (3) GGGGCTCTGT (2) GTGCACGTGC (3) TTCCATCCTT (3) 55.4 0.0554 P8 GC+1d culture CCTTTAATCC (3) GCACACCAGG (2) GGGGCTCTGT (2) TTCCATCCTT (3) 37.6 0.0376 P8 GC+SHH+1d culture CCTTTAATCC (3) GCACACCAGG (2) GGGGCTCTGT (2) TTAAGAAAAA (4) 31.7 0.0317 3T3 fibroblasts CCTTTAATCC (3) GGGGCTCTGT (2) GTGCACGTGC (3) 77.1 0.0771 E15 cortex CCTTTAATCC (3) 54.4 0.0544 P1 cortex CCTTTAATCC (3) GATACCTGCT (2) GGGGCTCTGT (2) 163.5 0.1635 Hypothalamus CCTTTAATCC (3) GATACCTGCT (2) GTGCACGTGC (3) 25.3 0.0253 E12.5 retina CCTTTAATCC (3) GATACCTGCT (2) GGGGCTCTGT (2) 84.5 0.0845 E14.5 retina CCTTTAATCC (3) GATACCTGCT (2) GCACACCAGG (2) GGGGCTCTGT (2) 133 0.133 E16.5 retina CCTTTAATCC (3) GGGGCTCTGT (2) GTGCACGTGC (3) 81.5 0.0815 E18.5 retina CCTTTAATCC (3) GATACCTGCT (2) GGGGCTCTGT (2) TTCCATCCTT (3) 34.5 0.0345 P0.5 retina CCTTTAATCC (3) GATACCTGCT (2) GGGGCTCTGT (2) GTGCACGTGC (3) 109.9 0.1099 P2.5 retina CCTTTAATCC (3) GATACCTGCT (2) GGGGCTCTGT (2) TTAAGAAAAA (4) 154.9 0.1549 P4.5 retina CCTTTAATCC (3) GATACCTGCT (2) GGGGCTCTGT (2) TTCCATCCTT (3) 132.8 0.1328 P6.5 retina CCTTTAATCC (3) GAGGACCCCT (3) GATACCTGCT (2) GGGGCTCTGT (2) TTCCATCCTT (3) 151.7 0.1517 P10.5 crx- retina CCTTTAATCC (3) GATACCTGCT (2) GGGGCTCTGT (2) GTGCACGTGC (3) TTCCATCCTT (3) 78.2 0.0782 P10.5 crx+ retina CCTTTAATCC (3) GATACCTGCT (2) GGGGCTCTGT (2) GTGCACGTGC (3) TTCCATCCTT (3) 94.1 0.0941 Adult retinal CCTTTAATCC (3) GAGGACCCCT (3) GGGGCTCTGT (2) GTGCACGTGC (3) 140.8 0.1408 ONL CCTTTAATCC (3) GGGGCTCTGT (2) TTAAGAAAAA (4) 93.9 0.0939