Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.169673 AI642036expressed sequence AI642036 11    216705 
 Mm.169673 9530029O12RikRIKEN cDNA 9530029O12 gene 11    399629 
 Mm.169673 C530049I24RikRIKEN cDNA C530049I24 gene 11    320445 
 Mm.169673 C80165expressed sequence C80165 11    97726 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 95 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAGAGGAAAC
AATACAATGG
ATGTTCTGTT (4)
CTTGAAAAGG (6)
GCTATGCTAT
GCTATGTCTT (6)
TGAGCTTAAT (4)
TTTTCTGGAA (2)
21.10.0211
Cb medulloblastomaATGTTCTGTT (4)
CCTTTTTTTT (2)
GCGCAGGGGA (2)
TTTTCTGGAA (2)
18.40.0184
P8 GC+1d cultureAATACAATGG
ATGTTCTGTT (4)
CTTGAAAAGG (6)
TTCATTTTCT
TTTTCTGGAA (2)
13.60.0136
P8 GC+SHH+1d cultureATGTTCTGTT (4)
CCTTTTTTTT (2)
CTTGAAAAGG (6)
GCTATGCTAT
TGTTAGGTGG (4)
TTCATTTTCT
TTTTCTGGAA (2)
17.80.0178
E15 cortexATGTTCTGTT (4)
TTTTCTGGAA (2)
19.70.0197
P1 cortexATGTTCTGTT (4)
4.50.0045
HypothalamusAATACAATGG
ATGTTCTGTT (4)
GCAAGGAACA (4)
GCGCAGGGGA (2)
GCTATGTCTT (6)
TTTTCTGGAA (2)
32.50.0325
E12.5 retinaAATACAATGG
ATGTTCTGTT (4)
CCTTTTTTTT (2)
TGAGCTTAAT (4)
TTTTCTGGAA (2)
11.40.0114
E14.5 retinaAAGAGGAAAC
ATGTTCTGTT (4)
CTTGAAAAGG (6)
GCGCAGGGGA (2)
TTTTCTGGAA (2)
200.02
E16.5 retinaATGTTCTGTT (4)
CCTTTTTTTT (2)
GCTATGCTAT
TTTTCTGGAA (2)
23.50.0235
E18.5 retinaAAGAGGAAAC
ATGTTCTGTT (4)
CCTTTTTTTT (2)
GCTATGCTAT
TGAGCTTAAT (4)
TTTTCTGGAA (2)
25.40.0254
P0.5 retinaATGTTCTGTT (4)
CCTTTTTTTT (2)
GCAAGGAACA (4)
TGTTAGGTGG (4)
9.90.0099
P2.5 retinaAATACAATGG
ATGTTCTGTT (4)
GCTATGCTAT
TGAGCTTAAT (4)
TTTTCTGGAA (2)
29.90.0299
P4.5 retinaATGTTCTGTT (4)
CCTTTTTTTT (2)
GCGCAGGGGA (2)
GCTATGCTAT
15.90.0159
P6.5 retinaATGTTCTGTT (4)
GCGCAGGGGA (2)
GCTATGCTAT
GCTATGTCTT (6)
TTTTCTGGAA (2)
15.10.0151
P10.5 crx- retinaATGTTCTGTT (4)
CCTTTTTTTT (2)
CTTGAAAAGG (6)
GCAAGGAACA (4)
GCTATGCTAT
TGTTAGGTGG (4)
TTTTCTGGAA (2)
390.039
P10.5 crx+ retinaATGTTCTGTT (4)
CTTGAAAAGG (6)
GCGCAGGGGA (2)
GCTATGCTAT
TTCATTTTCT
TTTTCTGGAA (2)
24.90.0249
Adult retinalATGTTCTGTT (4)
CTTGAAAAGG (6)
GCAAGGAACA (4)
TTTTCTGGAA (2)
11.20.0112
ONLAATACAATGG
ATGTTCTGTT (4)
CTTGAAAAGG (6)
GCAAGGAACA (4)
GCTATGCTAT
TGTTAGGTGG (4)
TTTTCTGGAA (2)
20.90.0209