Mouse Retina SAGE Library

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Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

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UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.1782	Rcn2	reticulocalbin 2	9		26611
Gene Ontology	calcium ion binding | endoplasmic reticulum | extracellular space
Human Homolog	RCN2[reticulocalbin 2, EF-hand calcium binding domain]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

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SAGE Tags

Total 80 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC CTGAATTTAA (3) GGTTTTGTTA (3) TCCCCTCCAT (4) TCTAAAAAAA (2) TCTAAACAAT 17.9 0.0179 Cb medulloblastoma CTGAATTTAA (3) TCTAAAAAAA (2) 18.5 0.0185 P8 GC+1d culture GACCAAAAAT (3) GGTTTTGTTA (3) TCTAAAAAAA (2) TCTAAACAAT 13.6 0.0136 P8 GC+SHH+1d culture CTGAATTTAA (3) GGTTTTGTTA (3) TCTAAAAAAA (2) TCTAAACAAT 10.4 0.0104 3T3 fibroblasts CCGCTGCTGC 10.5 0.0105 E15 cortex GGTTTTGTTA (3) 4.9 0.0049 P1 cortex GGTTTTGTTA (3) TCCCCTCCAT (4) TCTAAAAAAA (2) TCTAAACAAT 22.6 0.0226 Hypothalamus CCGCTGCTGC CTGAATTTAA (3) GACCAAAAAT (3) TCTAAAAAAA (2) TCTAAACAAT 19.9 0.0199 E12.5 retina GACCAAAAAT (3) GGTTTTGTTA (3) TCCCCTCCAT (4) TCTAAAAAAA (2) TCTAAACAAT 15.2 0.0152 E14.5 retina GACCAAAAAT (3) TCTAAAAAAA (2) 9.1 0.0091 E16.5 retina CTGAATTTAA (3) GACCAAAAAT (3) TCTAAAAAAA (2) 10.8 0.0108 E18.5 retina CTGAATTTAA (3) GACCAAAAAT (3) TCCCCTCCAT (4) TCTAAAAAAA (2) 16.3 0.0163 P0.5 retina CTGAATTTAA (3) GACCAAAAAT (3) GGTTTTGTTA (3) TCCCCTCCAT (4) TCTAAAAAAA (2) TCTAAACAAT TGGTAGCTCT 25.6 0.0256 P2.5 retina GACCAAAAAT (3) GGTTTTGTTA (3) TCCCCTCCAT (4) TCTAAAAAAA (2) 19.5 0.0195 P4.5 retina CTGAATTTAA (3) GACCAAAAAT (3) TCTAAAAAAA (2) 23.7 0.0237 P6.5 retina GTGCAAAGGA TCCCCTCCAT (4) TCTAAAAAAA (2) 15 0.015 P10.5 crx- retina GACCAAAAAT (3) GGTTTTGTTA (3) TCCCCTCCAT (4) TCTAAAAAAA (2) TCTAAACAAT 22.4 0.0224 P10.5 crx+ retina CCGCTGCTGC CTGAATTTAA (3) GACCAAAAAT (3) GGTTTTGTTA (3) GTGCAAAGGA TCTAAAAAAA (2) TGGTAGCTCT 15.2 0.0152 Adult retinal CCGCTGCTGC CTGAATTTAA (3) TCCCCTCCAT (4) TCTAAAAAAA (2) 9.4 0.0094 ONL GACCAAAAAT (3) GGTTTTGTTA (3) GTGCAAAGGA TCCCCTCCAT (4) TCTAAAAAAA (2) TCTAAACAAT TGGTAGCTCT 20.9 0.0209