Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.17977 A330080J22RikRIKEN cDNA A330080J22 gene 9    211586 
 Mm.17977 1110029I05RikRIKEN cDNA 1110029I05 gene 9    319491 
 Mm.17977 C77901expressed sequence C77901 9    97519 
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 52 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCACGGAAAAAA (3)
TGCAATTTGT (3)
TTCTTTTCCA (3)
TTTTAAAAAA (2)
9.80.0098
Cb medulloblastomaCAGAAACAGA
TAGCCCAAGC (4)
TTTTAAAAAA (2)
13.80.0138
P8 GC+1d cultureAAGCACACAT (3)
ACGGAAAAAA (3)
GCCACCAGCC (5)
TTTTAAAAAA (2)
80.008
P8 GC+SHH+1d cultureAAGCACACAT (3)
GTGTCCAGAG (3)
TGCAATTTGT (3)
TTCTTTTCCA (3)
TTTTAAAAAA (2)
17.50.0175
3T3 fibroblastsGCCACCAGCC (5)
3.50.0035
E15 cortexCAGAAACAGA
4.90.0049
P1 cortexTTTTAAAAAA (2)
4.50.0045
HypothalamusTTTTAAAAAA (2)
1.80.0018
E12.5 retinaTGTGCACATA (3)
TTCTTTTCCA (3)
TTTTAAAAAA (2)
5.70.0057
E14.5 retinaTAGCCCAAGC (4)
TGTGTCTTTA (3)
TTCTTTTCCA (3)
TTTTAAAAAA (2)
12.70.0127
E16.5 retinaACGGAAAAAA (3)
TGCAATTTGT (3)
3.60.0036
E18.5 retinaTGCAATTTGT (3)
TTTTAAAAAA (2)
10.90.0109
P0.5 retinaGTGTCCAGAG (3)
TGTGTCTTTA (3)
40.004
P2.5 retinaGTGTCCAGAG (3)
TGCAATTTGT (3)
TGTGTCTTTA (3)
TTCTTTTCCA (3)
TTTTAAAAAA (2)
12.50.0125
P4.5 retinaCAGAAACAGA
TTTTAAAAAA (2)
60.006
P6.5 retinaCAGAAACAGA
TAGCCCAAGC (4)
TTTTAAAAAA (2)
8.40.0084
P10.5 crx- retinaCAGAAACAGA
TAGCCCAAGC (4)
TGTGCACATA (3)
TTCTTTTCCA (3)
TTTTAAAAAA (2)
11.30.0113
P10.5 crx+ retinaACGGAAAAAA (3)
TTTTAAAAAA (2)
3.80.0038
ONLTGTGCACATA (3)
TTTTAAAAAA (2)
7.60.0076