Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.182912	Ghitm	growth hormone inducible transmembrane protein	14	14 15.0 cM	66092
Gene Ontology	integral to membrane
Human Homolog	GHITM[growth hormone inducible transmembrane protein]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 131 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AACAAAGCAA (2) CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CTTGCTTTCT TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 24.4 0.0244 Cb medulloblastoma AACAAAGCAA (2) ACTGGGCATT CCTTTTCCTT (2) CCTTTTTTTT (2) CTTTCAATTA TGTGCGCCCT (3) TTGGCTGCAA 46.1 0.0461 P8 GC+1d culture AACAAAGCAA (2) ACTGGGCATT CCCTTTCCTT (2) CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CTTCCAATTA (2) CTTGCTTTCT CTTTCAATTA GAAAGGGTGG (2) TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 35 0.035 P8 GC+SHH+1d culture CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CCTTTTTTTT (2) CTTCCAATTA (2) CTTTCAATTA GGATGGGGAT TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 29.4 0.0294 3T3 fibroblasts CTTTTCTTTT (2) TGTGCGCCCT (3) TTGGCTGCAA 14 0.014 E15 cortex AACAATTCAA CCCTTTCCTT (2) CCTTTTCCTT (2) TGTGCGCCCT (3) 39.5 0.0395 P1 cortex CCCTTTCCTT (2) CCTTTTCCTT (2) TTTAAAATGT (2) 31.7 0.0317 Hypothalamus AACAAAGCAA (2) AGTGACAAGT CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT TGGGCTGCAA TGTGCGCCCT (3) 19.9 0.0199 E12.5 retina ATTTGAGCTG CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CCTTTTTTTT (2) CTTTTCTTTT (2) 33.9 0.0339 E14.5 retina ATTTGAGCTG CCTTTTCCTT (2) CTTGCTTTCT GAAAGGGTGG (2) TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 30.9 0.0309 E16.5 retina AACAAAGCAA (2) ACTGGGCATT ATTAAAGATA ATTTGAGCTG CCCTTTCCTT (2) CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CCTTTTTTTT (2) CTGAAAAGAA GAAAGGGTGG (2) TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 56 0.056 E18.5 retina AACAAAGCAA (2) CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CCTTTTTTTT (2) CTTGCTTTCT TGTGCGCCCT (3) 23.6 0.0236 P0.5 retina ATTAAAGATA ATTTGAGCTG CCTTTTCCTT (2) CCTTTTTTTT (2) TGGGCTGCAA TGTGCGCCCT (3) 25.6 0.0256 P2.5 retina AACAAAGCAA (2) ATTTGAGCTG CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CTTGCTTTCT CTTTTCTTTT (2) TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 37.2 0.0372 P4.5 retina AACAAAGCAA (2) AACAATTCAA CCTTTTCCTT (2) CCTTTTTTTT (2) TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 23.9 0.0239 P6.5 retina AACAAAGCAA (2) ACTCCCTGTC CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CTTTCAATTA TGTGCGCCCT (3) 21.7 0.0217 P10.5 crx- retina AACAAAGCAA (2) ACTCCCTGTC AGTGACAAGT CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT CCTTTTTTTT (2) TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 61.4 0.0614 P10.5 crx+ retina AACAATTCAA ACTCCCTGTC ACTGGGCATT CCCTTTCCTT (2) CCTTTTCCTT (2) CTTGCTTTCT TGGGCTGCAA TGTGCGCCCT (3) TTTAAAATGT (2) 22.9 0.0229 Adult retinal ACTGGGCATT ATTAAAGATA CCTTTTCCTT (2) CCTTTTCTTT TTTAAAATGT (2) 33.4 0.0334 ONL AACAAAGCAA (2) AACAATTCAA AGTGACAAGT CCTTTTCCTT (2) CTTTCAATTA TTGGCTGCAA 36.3 0.0363