Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.184021 Ptprdprotein tyrosine phosphatase, receptor type, D 4  4 38.0 cM  19266 
 Gene Ontology hydrolase activity | integral to membrane | plasma membrane | protein-tyrosine-phosphatase activity | receptor activity | transmembrane receptor protein tyrosine phosphatase signaling pathway
 Human Homolog PTPRD[protein tyrosine phosphatase, receptor type, D]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 124 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAGTTTGGCTT
GAAGGGTATT (2)
GAGTCTCTTC
GGCCTGAATT (2)
GTGTTTGTGT
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
TTGTGTCAGC
800.08
Cb medulloblastomaGAAGGGTATT (2)
GAGTCTCTTC
GGCCTGAATT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TATATATACA (2)
TTAAAAAAAA (2)
173.40.1734
P8 GC+1d cultureACTTATTTTC
GAAGGGTATT (2)
GAGTCTCTTC
GGCCTGAATT (2)
GTGTTTGTGT
TAAAAAAAAA (3)
TATATATACA (2)
TTAAAAAAAA (2)
102.50.1025
P8 GC+SHH+1d cultureACTTATTTTC
AGTTTGGCTT
GAGTCTCTTC
GGCCTGAATT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TATATATACA (2)
TGGGAAAGGT
TTAAAAAAAA (2)
TTTTGTTTTG (2)
1430.143
3T3 fibroblastsACTTATTTTC
TAAAAAAAAA (3)
10.50.0105
E15 cortexGAAGGGTATT (2)
GTGTTTGTGT
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
24.60.0246
P1 cortexGAGTCTCTTC
GGCCTGAATT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
95.40.0954
HypothalamusGAAGGGTATT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TGGGAAAGGT
TTAAAAAAAA (2)
59.70.0597
E12.5 retinaGAAGGGTATT (2)
GAGTCTCTTC
GGCCTGAATT (2)
GTGTTTGTGT
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
470.047
E14.5 retinaACTTATTTTC
AGTTTGGCTT
GAAGGGTATT (2)
GGCCTGAATT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
67.30.0673
E16.5 retinaGAAGGGTATT (2)
GAGTCTCTTC
GGCCTGAATT (2)
GTGTTTGTGT
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
54.20.0542
E18.5 retinaAGTTTGGCTT
GAAGGGTATT (2)
GAGTCTCTTC
TAAAAAAAAA (3)
TGGGAAAGGT
TTAAAAAAAA (2)
174.50.1745
P0.5 retinaACTTATTTTC
GAAGGGTATT (2)
GGCCTGAATT (2)
GTGTTTGTGT
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
66.90.0669
P2.5 retinaACTTATTTTC
GAAGGGTATT (2)
GAGTCTCTTC
GGCCTGAATT (2)
GTGTTTGTGT
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
TTGTGTCAGC
139.20.1392
P4.5 retinaACTTATTTTC
GAAGGGTATT (2)
GAGTCTCTTC
GGCCTGAATT (2)
GTGTTTGTGT
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
194.20.1942
P6.5 retinaAGTTTGGCTT
GAAGGGTATT (2)
GAGTCTCTTC
GGCCTGAATT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
TTGTGTCAGC
101.80.1018
P10.5 crx- retinaGAAGGGTATT (2)
GAGTCTCTTC
GGCCTGAATT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
TTTTGTTTTG (2)
390.039
P10.5 crx+ retinaAGTTTGGCTT
GAAGGGTATT (2)
GAGTCTCTTC
GGCCTGAATT (2)
TAAAAAAAAA (3)
TATATATACA (2)
TGGGAAAGGT
TTAAAAAAAA (2)
TTGTGTCAGC
TTTTGTTTTG (2)
59.50.0595
Adult retinalACTTATTTTC
GGCCTGAATT (2)
GTGTTTGTGT
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
TTTTGTTTTG (2)
40.80.0408
ONLGAAGGGTATT (2)
GGCCTGAATT (2)
GTGTTTGTGT
TAAAAAAAAA (3)
TTAAAAAAAA (2)
440.044