Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]

Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24


 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.195310 Hnrpdlheterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like 5  5 54.0 cM  50926 
 Gene Ontology DNA binding | mRNA metabolism | nucleic acid binding | nucleus | ribonucleoprotein complex | RNA binding | viral nucleocapsid
 Human Homolog HNRPDL[heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D-like]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 147 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCCTTGGCCTC
GTGGGTCAGT (3)
GTGTATCTTT (2)
TACACTACAA
TTAAACCTCA
86.50.0865
Cb medulloblastomaACACGTCTAT
CCTTGGCTTC
GGATACAAAA
GTGTATCTTT (2)
TTAAACCTCA
39.30.0393
P8 GC+1d cultureAAAGTGGACC (2)
ACACAATTGT
CCTTGGCCTC
CCTTGGCTTC
CTGAGAGCCA (3)
GGATACAAAA
GTGGGTCAGT (3)
GTGTATCTTT (2)
TACACTACAA
TACCAGCGTA
TTAAACCTCA
670.067
P8 GC+SHH+1d cultureCCTTGGCCTC
CCTTGGCTTC
CTGAGAGCCA (3)
GGGTATCTTT
GTAACTTGAC
GTGGGTCAGT (3)
GTGTATCTTT (2)
TACCAGCGTA
TTAAACCCCA
TTAAACCTCA
76.30.0763
3T3 fibroblastsCCTTGGCCTC
CTGAGAGCCA (3)
GTGGGTCAGT (3)
GTGTATCTTT (2)
TTAAACCTCA
31.50.0315
E15 cortexCCTTGGCCTC
CTGAGAGCCA (3)
GTGTATCTTT (2)
19.70.0197
P1 cortexCTGAGAGCCA (3)
GTGTATCTTT (2)
TACCAGCGTA
TTAAACCTCA
45.30.0453
HypothalamusACACGTCTAT
GGATACAAAA
GGGGGGGGGA (2)
GTGGGTCAGT (3)
GTGTATCTTT (2)
TACACTACAA
TTAAACCTCA
48.80.0488
E12.5 retinaAAAGTGGACC (2)
CCTTGGCCTC
CCTTGGCTTC
GGATACAAAA
GGGGGGGGGA (2)
GGGTATCTTT
GTAACTTGAC
GTGTATCTTT (2)
TACCAGCGTA
TTAAACCTCA
TTTAGAGTAC
157.90.1579
E14.5 retinaAAAGTGGACC (2)
CCTTGGCCTC
GTGTATCTTT (2)
TGACTTTCCA
TTAAACCTCA
1220.122
E16.5 retinaACACAATTGT
CCTTGGCCTC
CTGAGAGCCA (3)
GTAACTTGAC
GTGTATCTTT (2)
TACCAGCGTA
TTAAACCTCA
TTTAGAGTAC
99.60.0996
E18.5 retinaCCTTGGCCTC
GGATACAAAA
GGGGGGGGGA (2)
GTGGGTCAGT (3)
GTGTATCTTT (2)
TGACTTTCCA
TTAAACCTCA
1290.129
P0.5 retinaCCTTGGCCTC
CCTTGGCTTC
CTGAGAGCCA (3)
GTAACTTGAC
GTGTATCTTT (2)
TACACTACAA
TTAAACCCCA
TTAAACCTCA
TTCATCAGCA (8)
TTTAGAGTAC
139.60.1396
P2.5 retinaACACGTCTAT
CCTTGGCCTC
CCTTGGCTTC
CTGAGAGCCA (3)
GGATACAAAA
GTGTATCTTT (2)
TACACTACAA
TACCAGCGTA
TTAAACCCCA
TTAAACCTCA
181.50.1815
P4.5 retinaCCTTGGCTTC
GGATACAAAA
GGGGGGGGGA (2)
GTAACTTGAC
GTGGGTCAGT (3)
GTGTATCTTT (2)
TACACTACAA
TACCAGCGTA
TTAAACCTCA
107.10.1071
P6.5 retinaAAAGTGGACC (2)
CCTTGGCCTC
CTGAGAGCCA (3)
GTAACTTGAC
GTGTATCTTT (2)
TACCAGCGTA
TTAAACCTCA
TTCATCAGCA (8)
98.30.0983
P10.5 crx- retinaCCTTGGCCTC
CTGAGAGCCA (3)
GGGGGGGGGA (2)
GTGGGTCAGT (3)
GTGTATCTTT (2)
TTAAACCCCA
TTAAACCTCA
52.10.0521
P10.5 crx+ retinaAAAGTGGACC (2)
CCTTGGCCTC
CTGAGAGCCA (3)
GGATACAAAA
GTAACTTGAC
GTGGGTCAGT (3)
GTGTATCTTT (2)
TACACTACAA
TTAAACCTCA
72.90.0729
Adult retinalAAAGTGGACC (2)
CCTTGGCCTC
CTGAGAGCCA (3)
GTGTATCTTT (2)
TACCAGCGTA
TGACTTTCCA
TTAAACCTCA
TTCATCAGCA (8)
48.40.0484
ONLCCTTGGCCTC
GTGTATCTTT (2)
TACACTACAA
TACCAGCGTA
TTAAACCTCA
30.60.0306