| Library | Tag (Other Genes) | Normalized Count | % in library |
| P8 Cb GC | GGGCCTCCCC GGGTTCCCCT (2) GGTCCCACTG GGTTGCCACA
| 6.4 | 0.0064 |
| Cb medulloblastoma | GGGTTCCCCT (2) GGTCCCACTG GGTTGCCACA
| 6.9 | 0.0069 |
| P8 GC+1d culture | CTCCGGTCTC (2) GCCAAAATTT GCCCTCCCAC GGGCCTCCCC GGTCCCACTG
| 10.3 | 0.0103 |
| P8 GC+SHH+1d culture | GCCAAAATTT GCCCTCCCAC GGGCCTCCCC GGGGCCTCCC GGTCCCACTG
| 10.5 | 0.0105 |
| 3T3 fibroblasts | GGGCCTCCCC GGGTTCCCCT (2)
| 31.5 | 0.0315 |
| E15 cortex | GCCCTCCCAC GGGCCTCCCC GGTCCCACTG
| 24.7 | 0.0247 |
| P1 cortex | GGGCCTCCCC
| 9.1 | 0.0091 |
| Hypothalamus | GCCCTCCCAC GGTCCCACTG
| 18.1 | 0.0181 |
| E12.5 retina | CTCCGGTCTC (2) GCCCTCCCAC GGGCCTCCCC GGTCCCACTG
| 11.4 | 0.0114 |
| E14.5 retina | AGCAAAGCCC GGGCCTCCCC GGGTTCCCCT (2) GGTCCCACTG
| 7.2 | 0.0072 |
| E16.5 retina | GCCCTCCCAC GGGTTCCCCT (2) GGTCCCACTG GGTTGCCACA
| 7.2 | 0.0072 |
| E18.5 retina | GCCCTCCCAC
| 1.8 | 0.0018 |
| P0.5 retina | GCCAAAATTT GCTCAGGGCC GGGCCTCCCC
| 9.8 | 0.0098 |
| P2.5 retina | GCCCTCCCAC GGGCCTCCCC GGGTTCCCCT (2) GGTTGCCACA
| 14.1 | 0.0141 |
| P4.5 retina | GCCAAAATTT GGTCCCACTG
| 6 | 0.006 |
| P6.5 retina | GCCAAAATTT GCCCTCCCAC GGGTTCCCCT (2) GGTCCCACTG
| 16.7 | 0.0167 |
| P10.5 crx- retina | CTCCGGTCTC (2) GGGTTCCCCT (2)
| 11.1 | 0.0111 |
| P10.5 crx+ retina | GGGGCCTCCC GGTCCCACTG
| 5.7 | 0.0057 |
| Adult retinal | GGGCCTCCCC GGGGCCTCCC
| 3.8 | 0.0038 |
| ONL | AGCAAAGCCC GGGCCTCCCC GGGGCCTCCC GGTCCCACTG GGTTGCCACA
| 9.5 | 0.0095 |