Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.201706 R74903expressed sequence R74903 16    98045 
 Mm.201706 1810013L24RikRIKEN cDNA 1810013L24 gene 16    69053 
 Mm.201706 3010002C02RikRIKEN cDNA 3010002C02 gene 16    72398 
 Clusters 
   Neighbors    

Total 5 In Situ Hybridization Images

Images -- Click to Enlarge



SAGE Tags

Total 100 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAACCTTTCTT (3)
AAGTGTTGAG (3)
CAAGTAATAC (3)
CCGTGTTCTG (3)
CCTGTTGGAG (2)
GAAAAAAAAA (2)
GAAAAAGAAT (4)
GTTTCTTTTC (2)
TAACAGTGGA (3)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
94.40.0944
Cb medulloblastomaGAAAAAAAAA (2)
GAAAAAGAAT (4)
GTTTCTTTTC (2)
TAACAGTGGA (3)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
217.30.2173
P8 GC+1d cultureAAGGGAAATA
CAAGTAATAC (3)
CCGTGTTCTG (3)
CCTGTTGGAG (2)
GAAAAAAAAA (2)
TAACAGTGGA (3)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
83.20.0832
P8 GC+SHH+1d cultureAACCTTTCTT (3)
AAGGGAAATA
CCTGTTGGAG (2)
GAAAAAAAAA (2)
GAAAAAGAAT (4)
TAACAGTGGA (3)
TGTGTGTGTG (2)
117.20.1172
3T3 fibroblastsTGTGTGTGTG (2)
280.028
E15 cortexGAAAAAAAAA (2)
54.40.0544
P1 cortexAACCTTTCTT (3)
GAAAAAAAAA (2)
TGTGTGTGTG (2)
TTAAAATAAC (3)
72.70.0727
HypothalamusCAAGTAATAC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
960.096
E12.5 retinaGAAAAAAAAA (2)
GAAAAAGAAT (4)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
93.90.0939
E14.5 retinaGAAAAAAAAA (2)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
91.10.0911
E16.5 retinaAACCTTTCTT (3)
AGAATTAACC (4)
GAAAAAAAAA (2)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
70.50.0705
E18.5 retinaCAAGTAATAC (3)
GAAAAAAAAA (2)
GTTTCTTTTC (2)
TGTGTGTGTG (2)
116.40.1164
P0.5 retinaAAGTGTTGAG (3)
CCTGTTGGAG (2)
GAAAAAAAAA (2)
GTTTCTTTTC (2)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
66.80.0668
P2.5 retinaAGAATTAACC (4)
CCGTGTTCTG (3)
CCTGTTGGAG (2)
GAAAAAAAAA (2)
GTTTCTTTTC (2)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTAAAATAAC (3)
135.60.1356
P4.5 retinaGAAAAAAAAA (2)
GTTTCTTTTC (2)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
105.10.1051
P6.5 retinaAGAATTAACC (4)
CAAGTAATAC (3)
GAAAAAAAAA (2)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
TTAAAATAAC (3)
95.10.0951
P10.5 crx- retinaGAAAAAAAAA (2)
GTTTCTTTTC (2)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
79.90.0799
P10.5 crx+ retinaCCGTGTTCTG (3)
GAAAAAAAAA (2)
TGTGTGTGTG (2)
88.40.0884
Adult retinalAAGTGTTGAG (3)
CCGTGTTCTG (3)
CCTGTTGGAG (2)
GAAAAAAAAA (2)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
79.80.0798
ONLAAGGGAAATA
AGAATTAACC (4)
GAAAAAAAAA (2)
TACCTTTGTA (3)
TGTGTGTGTG (2)
53.60.0536