Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.20818 2600002E23RikRIKEN cDNA 2600002E23 gene 4    67898 
 Gene Ontology calcium ion binding
 Human Homolog PEF[PEF protein with a long N-terminal hydrophobic domain (peflin)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 85 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCAAAAAAAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
TTTTCAAAAA (3)
220.30.2203
Cb medulloblastomaAAAAAAAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
TTTTCAAAAA (3)
830.20.8302
P8 GC+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
ACCACCAAAA (2)
AGCCTCATCA (2)
ATTTCAAAAA
CTGCTGGTGG (2)
TTTTCAAAAA (3)
261.30.2613
P8 GC+SHH+1d cultureAAAAAAAAAA (2)
ACCACCAAAA (2)
AGCCTCATCA (2)
ATTTCAAAAA
CTGCTGGTGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
TTTTCAAAAA (3)
TTTTCCACCA
326.70.3267
3T3 fibroblastsAAAAAAAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
TTTTCAAAAA (3)
91.10.0911
E15 cortexAAAAAAAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
222.70.2227
P1 cortexAAAAAAAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
249.90.2499
HypothalamusAAAAAAAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
TTTTCAAAAA (3)
TTTTCCAAAA
152.10.1521
E12.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
TTTAAAAAAA (3)
TTTTCAAAAA (3)
TTTTCCAAAA
146.50.1465
E14.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
ACCACCAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
TTTTCAAAAA (3)
TTTTCCACCA
116.50.1165
E16.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
ACCACCAAAA (2)
AGCCTCATCA (2)
TTTAAAAAAA (3)
48.90.0489
E18.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
TTTTCAAAAA (3)
TTTTCCAAAA
394.60.3946
P0.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
ACCACCAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
133.50.1335
P2.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
ATTTCAAAAA
CTGCTGGTGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
TTTTCAAAAA (3)
TTTTCCAAAA
341.60.3416
P4.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
ACCACCAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
293.20.2932
P6.5 retinaAAAAAAAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
280.20.2802
P10.5 crx- retinaAAAAAAAAAA (2)
ATTTCAAAAA
CTGCTGGTGG (2)
TTTTCAAAAA (3)
61.30.0613
P10.5 crx+ retinaAAAAAAAAAA (2)
ACCACCAAAA (2)
ATTTCAAAAA
CTGCTGGTGG (2)
103.70.1037
Adult retinalAAAAAAAAAA (2)
ACCACCAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
TTTTCAAAAA (3)
81.60.0816
ONLAAAAAAAAAA (2)
CTGCTGGTGG (2)
TTTAAAAAAA (3)
TTTTCAAAAA (3)
120.70.1207