Mouse Retina SAGE Library    [Home]    [Libraries]    [Images]
Gene:              Accession:    
e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search
Tag:        Cytoband (Mm):    
e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3
Unigene:        Cytoband (Hs):    
e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

 UniGene  Symbol  Name  Chr  Cytoband  LocusLink 
 Mm.208286 8030492O04RikRIKEN cDNA 8030492O04 gene 2    319234 
 Mm.208286 C230047C07RikRIKEN cDNA C230047C07 gene 2    320252 
 Mm.208286 Itchitchy 2  2 89.0 cM  16396 
 Gene Ontology intracellular | ligase activity | nucleus | protein binding | protein modification | ubiquitin cycle | ubiquitin ligase complex | ubiquitin-dependent protein catabolism | ubiquitin-protein ligase activity
 Human Homolog ITCH[itchy homolog E3 ubiquitin protein ligase (mouse)]
 Clusters 
   Neighbors    

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 74 tags found with positive counts.

  all tags    reliable tags    sum by library with all tags    sum by library with reliable tags  
 Library  Tag (Other Genes)  Normalized Count  % in library 
P8 Cb GCCAGTAAGAAA (3)
GTGGCACACA (2)
TGGTTTTGGC (4)
TTACATTGAA (4)
17.90.0179
Cb medulloblastomaAGCAGCTGCT (2)
CAGTAAGAAA (3)
GGGTTGAAGT (3)
GTGGCACACA (2)
TTACATTGAA (4)
25.40.0254
P8 GC+1d cultureAGCAGCTGCT (2)
CAGTAAGAAA (3)
GGGTTGAAGT (3)
GTGGCACACA (2)
TGGTTTTGGC (4)
TTACATTGAA (4)
26.10.0261
P8 GC+SHH+1d cultureCATACATACA
GTGGCACACA (2)
TTACATTGAA (4)
TTCTGCTCCT
70.007
3T3 fibroblastsGTGGCACACA (2)
TTACATTGAA (4)
17.50.0175
E15 cortexGTGGCACACA (2)
24.70.0247
P1 cortexGTGGCACACA (2)
4.50.0045
HypothalamusGTGGCACACA (2)
TTACATTGAA (4)
10.80.0108
E12.5 retinaAGCAGCTGCT (2)
GGGTTGAAGT (3)
GTGGCACACA (2)
TTACATTGAA (4)
TTCTGCTCCT
28.20.0282
E14.5 retinaCATACATACA
GTGGCACACA (2)
TTACATTGAA (4)
29.10.0291
E16.5 retinaGGGTTGAAGT (3)
GTGGCACACA (2)
TGGTTTTGGC (4)
TTACATTGAA (4)
18.10.0181
E18.5 retinaCATACATACA
GGGTTGAAGT (3)
GTGGCACACA (2)
TTACATTGAA (4)
TTCTGCTCCT
21.90.0219
P0.5 retinaAGCAGCTGCT (2)
GTGGCACACA (2)
TTACATTGAA (4)
17.70.0177
P2.5 retinaCATACATACA
GTGGCACACA (2)
TGGTTTTGGC (4)
TTACATTGAA (4)
TTCTGCTCCT
35.30.0353
P4.5 retinaCATACATACA
GGGTTGAAGT (3)
GTGGCACACA (2)
TTACATTGAA (4)
TTCTGCTCCT
19.90.0199
P6.5 retinaGGGTTGAAGT (3)
GTGGCACACA (2)
TTACATTGAA (4)
TTCTGCTCCT
41.80.0418
P10.5 crx- retinaGGGTTGAAGT (3)
GTGGCACACA (2)
TGGTTTTGGC (4)
TTACATTGAA (4)
22.30.0223
P10.5 crx+ retinaGGGTTGAAGT (3)
GTGGCACACA (2)
TGGTTTTGGC (4)
TTACATTGAA (4)
230.023
Adult retinalCATACATACA
GGGTTGAAGT (3)
GTGGCACACA (2)
TTACATTGAA (4)
11.30.0113
ONLCATACATACA
GTGGCACACA (2)
TTACATTGAA (4)
34.50.0345