Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.212606	C330018J07Rik	RIKEN cDNA C330018J07 gene	16		320184
Mm.212606	1810012N18Rik	RIKEN cDNA 1810012N18 gene	16		69110
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 80 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC AAATAAGTGG (3) AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGA (2) AAGTGTGACG (3) GAGAAGATCT (2) GATACTTGGG (2) GATGCCACAG (4) TACCCAGGCA (2) TCTAGACTTG (2) 109.3 0.1093 Cb medulloblastoma AAATAAGTGG (3) AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGA (2) GAGAAGATCT (2) 20.8 0.0208 P8 GC+1d culture AAATAAGTGG (3) AAGATCAAGA (2) CTCTCTTAAA GATACTTGGG (2) TACCCAGGCA (2) TCTAGACTTG (2) 31.9 0.0319 P8 GC+SHH+1d culture AAATAAGTGG (3) AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGA (2) GAGAAGATCT (2) GATACTTGGG (2) TCTAGACTTG (2) 25.8 0.0258 3T3 fibroblasts AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGA (2) AAGTGTGACG (3) GAGAAGATCT (2) TCTAGACTTG (2) 80.6 0.0806 E15 cortex AAATAAGTGG (3) AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGA (2) AAGTGTGACG (3) GAGAAGATCT (2) TACCCAGGCA (2) 133.4 0.1334 P1 cortex AAGATCAAGA (2) GATACTTGGG (2) 81.8 0.0818 Hypothalamus AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGA (2) ACAGAAAGTG (3) GAGAAGATCT (2) GATGCCACAG (4) 16.2 0.0162 E12.5 retina AAGATCAAGA (2) TCTAGACTTG (2) 52.6 0.0526 E14.5 retina AAATAAGTGG (3) AAGATCAAGA (2) AAGATCCTGA (2) AAGTGTGACG (3) TACCCAGGCA (2) 16.3 0.0163 E16.5 retina AAATAAGTGG (3) AAGATCAAGA (2) TACCCAGGCA (2) 12.6 0.0126 E18.5 retina AAATAAGTGG (3) AAGATCAAGA (2) GATACTTGGG (2) TACCCAGGCA (2) 14.5 0.0145 P0.5 retina AAATAAGTGG (3) AAGATCAAGA (2) CTCTCTTAAA TACCCAGGCA (2) TCTAGACTTG (2) 35.5 0.0355 P2.5 retina AAGATCAAGA (2) 5.3 0.0053 P4.5 retina AAGATCAAGA (2) ACAGAAAGTG (3) 13.9 0.0139 P6.5 retina AAGATCAAGA (2) CTCTCTTAAA GAGAAGATCT (2) GATACTTGGG (2) GATGCCACAG (4) TACCCAGGCA (2) 15.2 0.0152 P10.5 crx- retina AAGATCAAGA (2) ACAGAAAGTG (3) 3.8 0.0038 P10.5 crx+ retina AAGATCAAGA (2) GAGAAGATCT (2) TACCCAGGCA (2) TCTAGACTTG (2) 17.2 0.0172 Adult retinal AAGATCAAGA (2) 3.7 0.0037 ONL AAGATCAAGA (2) CTCTCTTAAA 7.6 0.0076