Mouse Retina SAGE Library

[Home]    [Libraries]    [Images]

---

Gene:              Accession:     e.g., Rho or Rhodopsin e.g., BG297543 batch search Tag:        Cytoband (Mm):     e.g., CCCAGTTCAC e.g., 6 E3 Unigene:        Cytoband (Hs):     e.g., Mm.2965 batch search e.g., 3q21-q24

---

UniGene	Symbol	Name	Chr	Cytoband	LocusLink
Mm.2137	Sin3b	transcriptional regulator, SIN3B (yeast)	8	8 33.0 cM (8 33.0 cM)	20467
Gene Ontology	nucleus | protein binding | regulation of transcription, DNA-dependent
Human Homolog	SIN3B[SIN3 homolog B, transcriptional regulator (yeast)]
Clusters	All Libraries - Raw DataAll Libraries - NormalizedComplete Retina - Raw DataComplete Retina - NormalizedEarly Retina - Raw DataEarly Retina - NormalizedLate Retina - Raw DataLate Retina - Normalized   Neighbors

No In Situ Hybridization images could be found.



SAGE Tags

Total 78 tags found with positive counts.

all tags     reliable tags     sum by library with all tags     sum by library with reliable tags    Library   Tag (Other Genes)   Normalized Count   % in library  P8 Cb GC ATGGTGATGT ATGGTGGATT (2) CTTCTGGGGA 14.6 0.0146 Cb medulloblastoma ATGGTGATGT ATGGTGGATT (2) CAAGTGTGCC (2) CTTCTGGGGA GCCCTGAAGA (2) 25.4 0.0254 P8 GC+1d culture AAGGAATTCA ATGGTGGATT (2) CTGGGCTCTG GGTGATGAGC 17 0.017 P8 GC+SHH+1d culture AAGGAATTCA ATGGTGGATT (2) CAAGTGTGCC (2) CCAAACCCAA GATCCTTTGA 25.9 0.0259 3T3 fibroblasts ATGGTGATGT ATGGTGGATT (2) CTGGGCTCTG 24.5 0.0245 E15 cortex ATGGTGATGT ATGGTGGATT (2) CTGGGCTCTG 19.7 0.0197 P1 cortex ATGGTGATGT CTGGGCTCTG TCTGAAGAGG (2) 18.1 0.0181 Hypothalamus ATGGTGATGT ATGGTGGATT (2) CTTCTGGGGA 10.8 0.0108 E12.5 retina ATGGTGATGT ATGGTGGATT (2) CTGGGCTCTG GGTGATGAGC 15.1 0.0151 E14.5 retina AGCACCCTGA (4) ATGGTGATGT ATGGTGGATT (2) GGTGATGAGC 21.8 0.0218 E16.5 retina AAGGAATTCA ATGGTGATGT ATGGTGGATT (2) CAAGTGTGCC (2) GATCCTTTGA 28.9 0.0289 E18.5 retina ATGGTGATGT ATGGTGGATT (2) CAAGTGTGCC (2) 14.6 0.0146 P0.5 retina ATGGTGGATT (2) 25.5 0.0255 P2.5 retina AGCACCCTGA (4) ATGGTGATGT ATGGTGGATT (2) CCAAACCCAA CTTCTGGGGA GATCCTTTGA GCCCTGAAGA (2) 26.6 0.0266 P4.5 retina ATGGTGGATT (2) CCAAACCCAA CTGGGCTCTG TCTGAAGAGG (2) 25.8 0.0258 P6.5 retina ATGGTGGATT (2) CCAAACCCAA CTTCTGGGGA TCTGAAGAGG (2) 18.4 0.0184 P10.5 crx- retina AAGGAATTCA ATGGTGGATT (2) CTTCTGGGGA 44.7 0.0447 P10.5 crx+ retina AAGGAATTCA ATGGTGGATT (2) CCAAACCCAA CTTCTGGGGA GGTGATGAGC 19.1 0.0191 Adult retinal AAGGAATTCA ATGGTGATGT ATGGTGGATT (2) CTGGGCTCTG CTTCTGGGGA 13.1 0.0131 ONL AGCACCCTGA (4) ATGGTGGATT (2) CTGGGCTCTG GATCCTTTGA 11.4 0.0114